恩斯特·迈尔:达尔文的使徒

恩斯特·迈尔是20世纪著名的生物学家,也是罕有的一位对生物学及其相关领域有着深入而全面了解的科学思想大师。他曾在鸟类学、系统分类学、进化生物学以及生物学史学和生物学哲学等许多方面做出巨大贡献,包括发现诸多新物种以及提出生物学物种概念;并在1930-1940年代的进化论综合进程中担任主要设计者,从而为促进当代生物学及其哲学的发展起到了重要的作用

戊肝病毒Th表位肽免疫可增强其载体蛋白的体液免疫应答

戊型肝炎病毒衣壳蛋白内包含一个强H-2d限制性Th表位P34。以该表位肽免疫BALB/c鼠,其脾细胞能够在体外识别重组戊型肝炎病毒衣壳蛋白,剔除实验表明应答细胞几乎完全是CD4+T细胞,证明P34表位肽能有效诱导产生特异性Th细胞。以P34肽初免小鼠,再以包含该表位的重组戊型肝炎病毒抗原(E2)免疫,结果表明,10μg、20μgE2免疫组在免疫后第1周即有部分小鼠产生抗体,到第3周所有小鼠均能够产生抗体;而对照肽P18初免的小鼠,以20μgE2加强免疫亦无法诱导小鼠产生抗体。这表明,Th表位肽P34初免诱导产生的Th细胞能够有效促进小鼠对携带该表位的载体蛋白的体液免疫应答

Research on Ernst Mayr's Philosophy of Biology

恩斯特·迈尔是综合进化论的建筑师之一，也是自达尔文以来最伟大的进化生物学家，同时还是一位分类学家、热带探险家、鸟类学家、博物学家、科学史学家和科学哲学家。除了他在科学研究领域取得的非凡成就之外，他还在生物学史和生物哲学领域发表过深具影响力的独创性见解和经典著作。由于他杰出的科学研究成就和深具洞察力的哲学目光，他的思想体系包括了丰富的科学思想内涵和哲学思考。迈尔从青年时代的新拉马克主义者转变为坚定的达尔文主义者，并且坚决抵制软遗传的任何观点和学说；接受还原论唯物思想熏陶并与先验论和二元论绝缘的他后来成为反还原论、力主生物学和生物学哲学自主性的代表性人物，这些都表明其哲学思想的转变与他的科学研究活动是密切关联的。迈尔还是第一个强调生物种群作用的人，在此基础上指出“种群思想”和类型论本质主义之间的根本性差异。种群思想将每一个生物个体的独特性以及可能导致新物种产生的种群无限变异纳入考量范围。而类型论者关于每一个物种都具有不变本质的假设决定了变异和变异的有限性；除非通过骤变，否则不可能形成物种。迈尔使用自然选择和种群思想理论作为其生物学史研究框架的理论模型。并在生殖、环境和生活史的基础上提出生物学物种的概念，描述了异域成种模式，并运用大量证据证明地理隔离是成种关键。本文从反本质论、反活力论和反还原论三个视角对迈尔的哲学思想加以剖析。他为了推动进化论思想的传播，在达尔文进化论处于困境的时代与他人合作构建了现代综合进化论，消解了进化论和孟德尔理论之间的张力。针对达尔文进化论最受抵制的部分——自然选择学说，迈尔基于种群生态学和遗传事实梳理出三条推理，为自然选择的合理性做出了有力辩护。针对分子生物学不断涌现的新发现和新假说，例如“中性学说”，对自然选择带来的新挑战，迈尔坚持选择对表型的作用，从而将“中性学说”纳入了自然选择的框架体系中，成为他“偶然性+必然性”两步进化观点的合理组成部分。并且复活了亚里士多德的目的论，注入“程序目的性”的现代科学内涵，使之成为生物学研究的有力助推器。迈尔用生物学成就论证或反驳哲学和科学中的错误理论，同时不忘对生物学中的一些概念或理论难题进行哲学分析，以期解决生物学和哲学中的一些问题。他强调生物学和生物学哲学的自主性，指出功能解释和目的论解释在生物学中的合理性，并且力主生命世界中存在的历史性、特异性和复杂性。同时，他认为库恩的科学革命范式并不适用于生物科学。在生物科学领域，多种相互竞争的范式可以并行存在，并且宣称“革命”可能在不同的领域时时发生。对于生物学发展而言，概念的变换比新事实的发现更具影响力

Roles of DNA Damage Checkpoint in Maintaining Telomere Stability

真核生物的DNA损伤检控系统是维持细胞基因组稳定的一个重要机制,该系统能检测细胞在生命活动过程中出现的DNA损伤并引发细胞周期阻滞,对DNA损伤进行修复,以维持细胞遗传的稳定性。端粒是位于真核细胞染色体末端由重复DNA序列和蛋白质组成的复合物,具有保护染色体、介导染色体复制、引导减数分裂时的同源染色体配对和调节细胞衰老等作用。虽然端粒与DNA双链断裂都具有作为线性染色体末端的共同特点,但正常端粒并不像DNA双链断裂那样激活DNA损伤检控系统。另一方面,端粒又与DNA损伤相似,因为多种DNA损伤检控蛋白在端粒长度稳定中起重要作用。因此DNA损伤检控系统既参与了维持正常端粒的完整性,又可对端粒损伤作出应答。现就DNA损伤检控系统在维持端粒稳定中的作用及其对功能缺陷端粒的应答作一简要综述。The DNA damage checkpoint of eukaryote is a vital mechanism to maintain genomic stability of the cell. This checkpoint can detect the DNA damages in the cell and cause cell cycle arrest, which will guarantee proper damage repair and ensure genomic stability. Telomeres are repetitive DNA-protein complex at the end of eucaryotic linear chromosomes and play a key role in protecting the chromosomes, mediating the replication of the chromosome, initiating the homolog alignment during meiosis and regulating the senescence of the cells. Telomeres and DNA double-strand breaks share the common feature of being physical ends of chromosomes. However, unlike double-strand breaks, telomeres do not activate the DNA damage checkpoint. On the other hand, telomeres resemble damaged DNA, as several DNA damage checkpoint proteins play important roles in telomere length maintenance. Therefore, DNA damage checkpoint signaling pathways not only are necessary for telomere integrity maintenance, but also play a vital role in facilitating repair of damaged telomeres. Here, we review recent studies defining the roles of DNA damage checkpoint in telomere maintenance and in response to telomere dysfunction.国家自然科学基金(No.30370307,No.30400239,No.30570935);; 厦门大学新世纪优秀人才支持计划资助~

2004–2016年中国生态系统研究网络水体酸碱度和总溶解性固体数据集

水体的酸碱度(pH)和总溶解性固体(TDS)是中国生态系统研究网络(CERN)的重要监测指标,可为生态系统水体质量长期变化研究提供重要数据。降水pH可以表征其是否为酸沉降,地表水和地下水的pH则关系到水质是否对植物生长和动物饮用存在危害等。TDS是表征水体溶解性固体总含量的指标,同样影响到植物根系的水分吸收和动物的生存分布。本数据集收集整理了CERN农田、森林、荒漠、草原、沼泽5种典型生态系统34个生态站2004–2016年降水、地表水、地下水pH和TDS数据。本数据集可为分析降水、地表水、地下水的酸碱度和TDS的时间变化和空间格局提供数据,可为研究中国典型生态系统水质酸碱度和盐碱化的长期变化提供数据支撑