거리학습을 이용한 Alignment-free 서열분석 성능개선

학위논문 (석사)-- 서울대학교 대학원 : 전기·정보공학부, 2016. 8. 윤성로.서열 분석기술은 유전체 연구에 있어 필수적인 작업이다. 기존에 사용되었던 Alignment 방식 서열분석은 높은 정확도를 가지나 동적 프로그래밍이 가지는 높은 시간복잡도와 공간복잡도로 인해 많은 양의 서열을 분석하기 어렵다. 이런 단점을 해결하기 위해 등장한 Alignment-free 방식은 Alignment 방법에 비해 빠르고 적은 공간을 사용하나 상대적으로 낮은 정확도를 보인다. 대표적인 Alignment-free 방법인 k-mer profile은 서열의 단어구성을 이용해 서열을 벡터로 변환하고, 이 벡터간의 거리를 이용해 서열간의 유사도를 정의한다. 본 논문은 거리학습을 이용해 벡터로 변환된 정보에서 서열간의 공통점과 차이점을 효과적으로 표현하는 거리를 학습해 Alignment-free 방법의 정확도를 향상시켰다. 본 논문은 PFAM, RFAM 데이터를 이용한 실험을 통해 거리학습이 Alignment-free 방식 서열분석의 정확도를 PFAM에서는 평균 20%p, RFAM에서는 16%p 향상시킬 수 있음을 확인하였다.제 1 장 서론 1 제 2 장 배경이론 3 2.1. Alignment-free 서열분석 3 2.1.1. k-mer 기반 거리 4 2.1.2. Sequence as Image 6 2.2. 거리학습 11 2.2.1. Supervised Mahalanobis Metric Learning 12 2.2.2. Unsupervised Metric Learning 16 2.3. 분류기 17 2.3.1. k-Nearest Neighbor 17 제 3 장 방법론 20 3.1. k-mer profiling 20 3.2. 거리학습 21 제 4 장 실험 및 결과 23 4.1. 데이터 셋 & k-mer 빈도 23 4.2. 실험환경 23 4.3. 결과 24 4.3.1. PFAM data 24 4.3.2. RFAM data 28 제 5 장 결론 34 참고 문헌 35 Abstract 39Maste

(A) study on virtual metrology of plasma enhanced chemical vapor deposition using equipment sensor log data

학위논문(석사) - 한국과학기술원 : 산업및시스템공학과, 2022.2,[iv, 29 p. :]본 논문은 플라즈마 화학 기상 증착 공정의 막 두께에 대한 가상 계측 시스템을 구축하는 문제를 다룬다. 장비 내 센서를 통해 얻어지는 로그데이터와 공정 후 계측한 막 두께 데이터를 이용하여, 플라즈마 화학 기상 공정의 특성을 고려한 여러 신경망 기반 예측모델을 고안하고, 실제 데이터에 대해 학습한 예측모델을 통해 막 평균 두께 및 위치 별 막 두께에 대한 가상 계측 시스템을 구축한다. 학습된 예측 모델을 통해 공정 장비 내에서 일어나는 현상에 대한 시뮬레이터를 가상 계측 시스템으로서 간접적으로 구현하고, 실제 데이터에 적용해보며 이를 분석해본다.한국과학기술원 :산업및시스템공학과

하이브리드 차량에서의 열 관리 모델을 융합한 무단변속시 효율 향상 방안에 관한 연구

학위논문 (석사)-- 서울대학교 대학원 : 지능형융합시스템학과, 2012. 2. 민경덕.Recently, TMS (Thermal Management System) has received attention from researchers as a way to enhance both fuel economy and emissions. There is a lot of research focused on the engine but research on Thermal Management Systems that deal not only with the engine but also other powertrain systems, such as cooling system, lubrication system, etc, is lacking. In addition, TMS themselves have not been studied widely. As such, now it is important to direct some research efforts towards TMS. In using a TMS, the regions with the most improved efficiency are cold-start and discarding the unneeded part of the exhaust gas emission, which can save about 20~30% of the total chemical fuel energy. However, until recently it has been very difficult to get experimental data from real vehicles and then make accurate simulation models. Simulation models and our ability to acquire experimental data are better than a few years ago because of developments in technology. In addition, recently hybrid and electric vehicles have been the subject of strict regulations. Especially, those HEVs equipped with CVT (Continuously Variable Transmission) have the advantage of giving assistance to the power source motor and operate with an optimal operation line (OOL). In spite of these advantages, CVT has disadvantages in that its efficiency is lower than other transmission systems and its life is shorter. Thus, in this paper, a CVT transmission model is constructing using four kinds of modeling and the model efficiency is improved by using a waste heat recovery system. Our model of the CVT consists of variable sub systems including thermal mass, heat transfer and friction models as well as a waste heat recovery model, which are used to analyze heat and predict temperature in the transmission. The model introduced in the paper is focused on oil lubrication and temperature unlike previous research models. CVT loss energy is a heat source in the transmission that results in rising oil temperatures. Particularly, unlike engine oil and coolant, transmission oil temperature is raised slowly raised when vehicle starts, this can cause friction loss, especially in cold-start conditions. Therefore, each model in this paper takes this into account while assuming that the transmission and engine are a simple cylinder shape. Moreover, a heat exchanger is used in waste heat recovery systems for efficiency and weight. The integration model TTM (Transmission Thermal Management) consists of transmission and WHR (Waste Heat Recovery) systems developed in this research. The simulation results of the system were validated by experimental data and suggest methods to improve the efficiency of transmissions. As a result, transmission efficiency is improved by about 1.4% and the CVT temperature is raised about 11°C in the UDDS driving mode meaning transmission losses are reduced by the nominal system and there is also a possibility of reduced fuel consumption. An integrated TTM model introduced in this research is expected to be the basis of more advanced research into this area최근 열 관리 시스템(Thermal Management)은 차량의 연비와 배기 특성을 개선할 수 있는 중요한 방안으로서 관심의 대상이 되고 있다. 특히 엔진 부분의 정밀 엔진 제어, 신 연소 기법 등을 통한 엔진 자체에 초점이 맞추어진 연구는 광범위하게 이루어져 왔다. 하지만 최근에는 엔진과 파워트레인의 냉각계통까지 포함한 연구의 잠재성이 인정되었고 이를 통해 차량의 연비 및 배기특성 향상에 큰 효과를 가지고 있는 것으로 기대된다. 열 관리 시스템이란 버려지는 열의 효과적인 관리를 통해서 차량의 효율을 향상시키는데 초점이 맞추어져 있다. 현재의 열 관리 관련 연구 중 가장 효율 향상을 볼 수 있는 부분으로는 차량의 냉 시동 시 발생하는 손실에 관한 부분, 버려지는 배기가스 열 회수를 통한 부분 등 이 있다. 그러나 이러한 부분들이 실제로는 실험적 검증이 힘들뿐더러 시뮬레이션 모델을 개발하는 것도 쉽지 않다. 이러한 한계에도 불구하고 기술의 발달로 인하여 모델의 완성도는 높아지고, 실험적 검증도 조금씩 근접해져 가고 있다. 또한 최근 들어 연비와 배기가스 규제가 강화되면서, 대안으로 하이브리드 차량과 전기 자동차등이 연구의 화제가 되고 있다. 특히 CVT를 장착한 하이브리드 차량은 보조 동력원인 모터의 사용과 더불어 엔진을 최적 운전영역에서 운영할 수 있다는 장점을 가지고 있다. 그러나 변속기 자체의 효율이 낮다라는 점과 손실이 많고 수명에 관한 문제 때문에 이를 개선하기 위한 연구도 활발하다. 기존의 많은 연구를 통해 많은 시뮬레이션 모델들이 구축되었는데, 이는 모두 동역학 적 관점을 반영하여 구현되었다. 하지만 최근에 추세를 볼 때 오일의 흐름이 주요하게 작용되는 변속기의 경우 열역학 적 관점에서 모델링 하는 것이 필요하게 되었다. 따라서 본 연구에서는 이러한 흐름을 반영하여 변속기 윤활 시스템에 관하여 모델을 구성하였으며, Heat recovery system을 이용하여 변속기 효율을 향상시키는 모델을 구연하였다. 이 모델은 윤활, 배기, thermal mass 모델을 통하여 구성되었고, 이러한 시스템을 통하여 변속기 내부에서 발생하는 열을 분석하고, 예측할 수 있도록 구축하였다. 본 연구에서 소개된 모델은 기존의 많은 CVT 모델들과는 다르게 오일의 윤활 및 온도에 초점을 맞추었다. CVT의 손실에너지는 대부분 열 에너지로 전환되기 때문에 오일 온도의 상승 정도를 분석하는 것은 CVT 효율을 전반적으로 반영한다고 볼 수 있다. 특히 엔진과는 다르게 오일의 온도가 많이 상승되지 않아 이에 의한 마찰 및 손실이 심화되고, 전반적으로 CVT 시스템에 효율에 영향을 주게 된다. 특히 이러한 영향은 온도가 낮은 냉 시동 시 큰 손실을 가져다 준다. 따라서 온도에 따른 마찰을 Friction 모델을 이용하여 모사하고, 단일한 파이프 모델을 응용하여 오일의 흐름을 단순화 하여 기존의 Friction에 따른 오일온도 상승을 구현하였다. 또한 온도가 낮은 경우, 즉 냉 시동시의 효율을 개선하기 위하여 버려지는 배기가스 에너지를 이용하는 배열 회수 시스템을 구성하였다. 기존의 여러 시스템 중 열 교환기를 사용하여 무게 대비 효과를 상승시켰고, 이를 이용하여 warm-up 시 오일온도를 상승시켜 CVT의 효율을 개선하고, 나아가 연비 개선의 가능성도 제시할 수 있는 통합모델을 구현하였다. 이 통합모델을 통하여 오일 온도는 약 11도, 효율은 약 1.4 % 를 향상시키는 결과를 가져다 주었다. 기존의 변속기 유압시스템, 구동 풀리 손실에 관한 초점을 벗어나 열 적 관점에서 모델링을 구현함에 따라 변속기에서 내부에서 발생하는 에너지 흐름을 분석할 수 있다는 가능성을 제시하였다. 또한 본 연구에서 제시한 모델을 응용하여 엔진뿐 만 아니라 다양한 부분에서도 이러한 연구가 이루어 질 수 있을 것으로 기대된다.Maste

미국의 자동차 연비규제를 중심으로

학위논문(석사) - 한국과학기술원 : 경영공학부, 2020.2,[ii, 53 p. :]정교히 디자인된 환경규제는 기업 혁신을 촉진한다는 포터의 가설 이후로 환경규제 강도와 기업 혁신의 관계에 대한 많은 연구가 있었다. 본 연구에서는 요구수준과 성과 피드백에 기반한 행태적 접근을 통해, 규제강도 및 시행까지 부여되는 시간적 압력에 따른 기업의 서로 다른 혁신 패턴을 제시한다. 미국의 자동차 연비규제 사례를 바탕으로 분석한 결과, 발표된 환경규제 기준을 달성하지 못한 후발 기업의 경우 규제강도가 증가함에 따라 선도 기업 대비 더 먼 거리의 기술을 탐색하며 출원하는 특허의 임팩트는 감소하는 경향성을 보였다. 또한 규제 시행에 의한 시간적 압력이 증가함에 따라, 후발 기업은 선도 기업 대비 더 많은 특허를 출원했지만 특허 임팩트는 크게 감소하는 양상을 보였다. 이 결과는 환경규제에 대응하는 선도 및 후발 기업의 혁신 패턴을 다방면에서 이해하는 데 도움이 될 수 있으며, 나아가 기업행태이론을 시간 차원으로 확장 시킴에 그 의의를 갖는다.한국과학기술원 :경영공학부

Cavity singularity and maximal regularity of the compressible Stokes equations: some numerical examples

DoctorIn this thesis we study two problems. First we study a linearized compressible Stokes system on the T-shaped cavity domain, with a suitable boundary condition. The T-shaped domain is a well-known model problem in aerodynamics. In the T-shaped cavity domain the fluid flows consist of three essential phenomena that are the flows in the top region with inflow and outflow, the ones in the bottom(cavity) region and the interface fluctuation between two flows. We establish a piecewise maximal regularity by constructing a vector function cor- responding to the pressure jump on the interior curve, without subtracting the corner singularities. Secondly, a complete regularity theory is an open question for compressible Stokes equations on polygonal domains with zero Dirichlet conditions. As a partial answer we study a nonlinear compressible Stokes system on the infinite sector, with inflow and outflow conditions vanishing at the vertex. We construct the velocity vector u and the density function ρ of the following forms u(x,y)=r^λ (ϕ(θ) e + ψ(θ) e'),θ∈(0,ω), ρ(x,y)=r^(λ-1) σ(θ). where ω is the opening angle of the sector; φ, ψ and σ are the solutions for a nonlinear boundary value problem with any positive number λ≠nπ/ω for integer n; r=(x^2+y^2 )^(1/2), θ are the polar coordinates at the origin, e = (cosθ,sinθ) and e' = (−sinθ,cosθ). We also give some numerical examples

예제동작을 이용한 영상기반 동작포착 및 동작이전

학위논문(박사) - 한국과학기술원 : 전산학전공, 2005.2, [ iv, 68 p. ]In this thesis, we present a novel example-based paradigm for producing motions of various characters. With a rich repertoire of captured motions, our paradigm extends previous methods for motion synthesis in two directions: First, we produce realistic human motions guided by monocular videos, which are a most common source of human motions. Second, we apply those motions to diverse characters with different structures. After processing a input video, we select a pre-captured motion clip called a "reference motion" from a motion library, and then compute the sequence of body configurations of a character based on spacetime formulation. The root trajectory is estimated by using kinematic constraints and dynamic property of character. After synthesizing human motions from monocular videos, the motion is cloned frame by frame to a target character based on scattered data interpolation. To do this, we exploit the correspondence between keypostures of the source character and those of the target character. Through experiments, we demonstrated that our scheme can effectively produce a variety of motions for character animation.한국과학기술원 : 전산학전공

Higher level control of animation with FFD(free-form deformation)

학위논문(석사) - 한국과학기술원 : 전기및전자공학과, 1999.2, [ 46 p. ]한국과학기술원 : 전기및전자공학과