Microarray analysis of mouse lungs after high dose per fraction irradiation with limited lung volumes

One of the most important assignments that must be overcome is radiation-induced lung injury (RILI) which can diminish quality of life in patients treated by RT for lung cancer that is the leading cause of human cancer mortality and the most common cancers. Although cumulative studies had been reported about basic pathophysiology, prediction, and therapeutics about RILI, there have been so far no clear answer to any of these. To identify relevant genes in RILI with high dose per fraction irradiations (HDFR) such as stereotactic body radiation therapy (SBRT), both in vivo models and image-guided, highly focal irradiation systems are necessary. Here, we identified some genes from the lungs of mice after irradiation using such an irradiation system at lung volumes in mice considering radiation therapy range of clinical treatment. Highly focal irradiation (90 Gy) was exposed to a 3 mm volume of the left lung of C57BL6 mice using a small-animal stereotactic irradiator. Histo-pathological examination, and cDNA micro array using irradiated lung tissue were performed and radiation responsible genes were identified. Further study is necessary for functional elucidation and clinical implication of these genes in HDFR-mediated lung injury such as lung fibrosis or pneumonitis.;폐암은 현재 가장 흔하게 발병하는 질환이며 인간의 암 사망의 주된 원인이다. 이런 폐암을 치료하기 위해 많은 환자들의 방사선 치료를 받고 있으며, 이런 환자들은 방사선으로 인한 폐손상으로 인해 삶의 질이 낮아지고 있다. 비록 많은 연구들이 방사선으로 인한 폐손상에 대한 기본적인 병태생리학, 예측, 치료법 등에 대해 보고해 오고 있지만 정확한 해답이 현재로서는 없는 실정이다. 본 연구에서는 최근의 방사선치료의 트렌드를 반영하여 SBRT같은 고선량 저분할 방사선 조사에 의한 폐손상, 특히 폐섬유화 과정에 관여하는 유전자를 찾기 위해, 임상적 상황의 방사선 치료 범위를 고려하여 C57BL6 마우스의 왼쪽 폐 3 mm 부피에 90 Gy의 고선량 방사선을 조사한 후 폐로부터 마이크로 어레이 및 RT-PCR법을 사용하여 몇몇 유전자를 발굴하였다. 이때 매우 집중된 방사선의 용량을 소동물 입체공간적인 방사선 조사기를 사용하여 조사되었다. 방사선 조사된 폐 조직을 이용하여 조직병리학적 염색법 및 마이크로어레이를 수행하였고 고선량 저분할 방사선이 원인이 되는 유전자들을 확인하였다. 앞으로 진행할 연구는 기능적인 설명과 폐 섬유화나 폐렴 같은 고선량 저분할 방사선에 의해 영향을 받는 폐손상에서 이런 유전자들의 임상적인 영향을 밝혀내는 것이 필수적이다.I.Introduction 1 A. Radiation therapy 1 B. Radiation induced disease 8 C. Radiation induced fibrosis 11 D. Purpose of this study 18 II. Material & Methods 19 A. Mouse irradiation 19 B. Histological examination 21 C. Microarray experiment 21 D. RNA isolation, RT-PCR, and qRT-PCR 22 III. Results 24 A.Fibrotic changes after focally high-dose radiation 24 B. Selection of candidate genes from microarray data 27 C. Comparison of focally irradiated lung region and its neighboring non-irradiated lung region 32 IV. Discussion 37 Bibliography 42 국문초록 4

Inhibition of HSP27 alleviates Pulmonary Fibrosis

Part 1. Radiation-induced pulmonary fibrosis (RIPF) is the main side effect after thoracic irradiation for lung cancer, however, the protective strategies and the underlying mechanisms remain to be investigated. The expression of heat shock protein 27 (HSP27) was increased during RIPF with impaired lung function following focal high dose irradiation in limited lung volumes. Exacerbation of pulmonary fibrosis by ionizing radiation (IR) was also found in HSP25 transgenic (TG) mice. Knockdown of HSP27 to lung epithelial cells inhibited IR-mediated epithelial–mesenchymal transition (EMT). J2, a synthetic small molecule inhibitor of HSP27, significantly alleviated pulmonary fibrosis by IR in control and TG mice, and the therapeutic effects were better than pirfenidone and amifostine. HSP27 directly interacts with IkBα through protein binding and activates NFkB pathway. Subsequently, expressions of Twist, IL-1β and IL-6 increased through Nucleus translocation of NFkB. Collectively, HSP27 induces IkBα-NFkB signaling activation and increases Twist, IL-1β and IL-6 expression, is involved in EMT program that tightly connected to development of RIPF. Our findings also suggest that inhibition of HSP27 has the potential to become a valuable therapeutic strategy for RIPF. Part 2. Idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) is a fatal disease that has been known to induce fibrosis in the lungs without certain causes, and is usually known to die within three years after diagnosis. However, no drug has been recognized as an effective agent for increasing the survival rate of IPF. Also, the pathogenesis of IPF has not yet been clearly identified. Pulmonary fibrosis is characterized by ECM abnormalities, epithelial to mesenchymal transition (EMT), and the differentiation of myofibroblast derived from various cell types. Heat shock protein 27 (HSP27) has been reported to be strongly upregulated during radiation (IR) and bleomycin (BLM)-induced pulmonary fibrosis and in IPF patients. Therefore, in this study, I investigated the role of HSP27 during lung fibrogenesis, especially focus on EMT processing through in vitro and in vivo system. IR and BLM-induced pulmonary fibrosis was exacerbated in HSP25 transgenic (TG) mice. J2, a synthetic small molecule inhibitor of HSP27, significantly attenuated fibrosis developments in these models. To elucidate the mechanisms of HSP27-mediated fibrosis, knockdown of HSP27 by shRNA or J2 was treated to lung normal epithelial cells and found that functional HSP27 inhibition blocked TGF-β1-mediated EMT. Also, cDNA microarray and further immunohisto-chemical analysis revealed that upregulation of LRRC15 was observed in IR and BLM-induced fibrotic lungs, which were strongly induced in HSP25 TG mice. Moreover, these phenomena were significantly restored in J2-treated mice, suggesting that even though more detailed experiments are under the progression, LRRC15 might be a candidate target for HSP27-mediated pulmonary fibrosis development.;방사선 유발 폐섬유화 (RIPF)는 폐암에 대한 흉부 방사선 조사 후 주요 부작용이지만, 보호 전략 및 기본 메커니즘은 아직 정확히 규명되지 않았다. 열 충격 단백질 27 (HSP27)의 발현은 제한된 폐 부피에서 국소 고용량 방사선 (IR) 조사 후 RIPF 동안 증가되었다. HSP25 과 발현 (TG) 마우스에서 방사선에 의한 폐섬유화의 악화가 확인되었다. 또한, HSP27의 발현이 억제된 폐 상피 세포에서 방사선 매개 상피-중간 엽 전이 (EMT)를 억제가 확인되었다. HSP27의 합성 저분자 억제제 인 J2는 대조군 및 TG 마우스에서 방사선에 의한 폐섬유화를 유의하게 완화 시켰으며, 치료 효과는 기존에 사용되는 치료제보다 우수하였다. 본 연구에서는 HSP27이 단백질 결합을 통해 IkBα와 직접 상호 작용하고 NFkB 경로를 활성화함을 증명하였다. 이후, 활성화된 NFkB의 핵으로의 이동으로 인해 Twist, IL-1β 및 IL-6의 발현이 증가 하였다. 종합적으로, HSP27은 IkBα-NFkB 신호 활성화를 유도하고 Twist, IL-1β 및 IL-6 발현을 증가 시키며, RIPF의 발달에 밀접한 관련이 있는 EMT 과정에 관여한다. 우리의 연구 결과는 또한 HSP27의 억제가 RIPF에 대한 귀중한 치료 전략이 될 가능성이 있음을 시사한다. PARTⅡ에서는 방사선에 의해 유도되는 폐섬유화의 좀더 큰 범위인 특발성 폐섬유화 (IPF)에 대해 연구하였다. 특발성 폐섬유화는 원인불명으로 폐에 섬유화를 발생하는 것으로 알려진 치명적인 질병이며, 진단 후 3 년 이내에 사망하는 것으로 알려져 있습니다. 그러나, IPF의 생존율을 증가시키기 위한 효과적인 약물은 현재까지 개발되지 않았으며, IPF의 병인 또한 아직 명확하게 밝혀지지 않았다. 폐섬유화는 ECM 이상, 상피에서 중간 엽 전이 (EMT) 및 다양한 세포 유형으로부터 유래 된 근섬유 아세포의 분화를 특징으로 한다. HSP27은 IR 및 블레오마이신 (BLM)으로 유발된 폐섬유화 및 IPF 환자에서 강력하게 상향 조절되는 것으로 보고되었다. 따라서, 이 연구에서 폐 섬유 형성 동안 HSP27의 역할, 특히 체 외 및 생체 내 시스템을 통해 EMT 처리에 초점을 조사했다. IR 및 BLM- 유발 폐섬유화는 HSP25 과 발현 (TG) 마우스에서 악화되었다. HSP27의 합성 저분자 억제제 인 J2는 이들 모델에서 섬유화 발생을 상당히 약화시켰다. HSP27-매개 섬유화의 메카니즘을 설명하기 위해, shRNA 또는 J2에 의한 HSP27의 발현을 억제한 폐 정상 상피 세포에서 실험한 결과를 바탕으로, 기능적 HSP27 억제가 TGF-β1- 매개 EMT를 차단한다는 것을 발견 하였다. 또한, cDNA 마이크로 어레이 및 추가 면역 조직 화학적 분석은 LRRC15의 발현증가가 IR 및 BLM- 유도 섬유 성 폐에서 나타난다는 것을 밝혀냈으며 이러한 현상은 HSP25 TG 마우스에서 강력하게 나타났다. 더욱이, LRRC15의 발현 증가는 J2 처리 된 마우스에서 유의하게 회복되었는데, 이는 보다 더 많은 실험이 필요하지만, LRRC15가 HSP27-매개 폐섬유화 발달의 후보 표적 일 수 있음을 제시한다.II. Introduction 1 1. Radiation Therapy 1 1.1 Radiation-induced damage 1 1.2 Radiation-induced lung disease 1 2. Radiation-Induced Pulmonary Fibrosis 4 2.1 Characteristic of RIPF 4 2.2 Mechanisms of RIF 4 2.3 Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT) 7 2.3.1 Classification and type of EMT 9 2.3.2 EMT in fibrosis development 11 2.4 Anti-fibrotic drug approved FDA 11 2.4.1 Pirfenidone 12 2.4.2 Nintedanib 12 3. Heat Shock Protein 27 13 3.1 What is HSP27? 13 3.2 HSP27 and Fibrosis 13 3.3 HSP27 inhibitor 14 3.3.1 Small Molecules 14 3.3.1.1 RP101 (Brivudine) 14 3.3.1.2 Quercetin 14 3.3.1.3 Altered Dimerization of HSP27 using small molecule 14 3.3.2 Peptide Aptamers 15 3.3.3 Antisense drug 15 4. Previous Study 17 III. Material & Methods. 18 1. Animal experiments 18 2. Generation of HSP25 TG mice 18 3. Microarray experiment. 19 4. Cell culture and transfection 19 5. RNA isolation, qRT-PCR and RT-PCR 20 6. Immunoblotting 22 7. Histological and immunohistochemical analysis 22 8. Antibodies and reagents 22 9. Irradiation 23 10. Immunofluorescence assay and subcellular fraction 23 11. Immunoprecipitation 23 12. Statistical analysis 23 IV. Results 25 1. Protein expression of HSP27 is increased during IR-induced pulmonary fibrosis 25 2. HSP27 cross-linker J2 inhibited IR-induced pulmonary fibrosis in mice 28 3. Cellular role of HSP27 involved in IR-mediated EMT in lung cell lines 32 4. HSP27 is involved in gene expression of twist, il-1β and il-6 increased during RIPF 37 5. NFkB activation by HSP27 is involved in the expression of IR-induced fibrosis-related genes 40 V. Conclusion 44 PART Ⅱ 46 I. Abstract 47 II. Introduction 48 1. Idiopathic Pulmonary Fibrosis (IPF) 48 1.1 Characteristic of IPF 48 1.2 Risk factors of IPF 49 1.2.1 Genetic risk factor 49 1.2.2 Intrinsic risk factor 51 1.2.2.1 Gastroesophageal reflux 51 1.2.2.2 Lung microbiota 51 1.2.3 Extrinsic risk factor 51 1.2.3.1 Tabacco smoke 51 1.2.3.2 Occupational exposure 52 1.2.3.3 Air pollution 52 2. Animal models of pulmonary fibrosis 54 2.1 Type of pulmonary fibrosis murine model 54 2.2 Bleomycin-induced fibrosis murine model 56 2.2.1 Mechanism of action and kinetics of injury by bleomycin 56 3. LRRC15 58 4. Purpose of this study 60 III. Material & Methods 61 1. Animal experiments 61 2. Microarray experiment. 63 3. Cell culture and transfection 63 4. RNA isolation, qRT-PCR and RT-PCR 63 5. Immunoblotting 66 6. Antibodies and reagents 66 7. Preparation of lung tissue for histology and immunohistochemistry 66 8. Statistical analysis 67 IV. Results 68 1. Overexpression of HSP27 aggravates BLM- induced pulmonary fibrosis. 68 2. Knockdown of HSP27 inhibited TGFβ-mediated EMT in lung cell lines 74 3. HSP27 cross-linker J2 inhibited BLM-induced pulmonary fibrosis in mice 77 4. LRRC15 is involved in HSP27-mediated pulmonary fibrosis 80 5. Knockdown of HSP27 inhibited the expression of LRRC15 in lung cell lines 84 V. Discussion 8

순수 티타늄에 대한 열중합 의치상 레진, 간접 복합 레진과 도재의 결합강도에 관한 비교 연구

목적: 절삭형 티타늄 구조물을 이용한 보철물 제작에 많이 사용되는 열중합 의치상 레진, 도재, 간접 복합 레진의 순수 티타늄과의 결합 강도를 비교 평가하였다. 방법: 지름 9 mm, 높이 10 mm의 Grade II 순수 티타늄 (Grade Ⅱ commercially pure titanium; CP-Ti, Dynamet, Santa Fe Springs, CA, USA) 원통형 시편 30 개를 3 군으로 나누어 각각 직경 7 mm, 두께 2 mm의 열중합 의치상 레진 (Lucitone 199, Dentsply Trubyte, York, PA, USA), 간접 복합 레진 (Sinfony, 3M ESPE, Seefeld, Germany), 도재 (Triceram, Dentaurum, Ispringen, Germany)를 결합시켰다. 대조군으로 Type Ⅳ gold alloy를 직경 9 mm로 주조하여 열중합 의치상 레진 (Lucitone 199)과 결합시켰다. 시편은 5-55 ℃에서 5000회 열 순환 처리 후, 만능 시험기 (Instron 4465, Canton, Mass, USA)를 이용하여 1 mm/min의 속도로 하중을 가하여 결합강도를 측정하였다. 측정값은 Kruskal-Wallis Test와 Mann-Whitney Test (SPSS 15.0, SPSS Inc., Chicago, IL, USA)로 통계 처리하였으며, 유의수준은 P < .05로 하였다. 파절면은 광학현미경관찰 및 SEM 관찰하였다. 결과: 티타늄 군에 대한 실험결과에서는 Ti-Lucitone 199 (12.11 ± 4.44 MPa) 의 결합 강도가 가장 높았으며, Ti-Triceram (11.09 ± 1.66 MPa), Ti-Sinfony (4.32 ± 0.64 MPa) 순으로 감소하였다. 주조 금합금에 Lucitone 199을 결합시킨 대조군 (16.14 ± 1.89 MPa)에 비하면 낮은 수치이나 대조군과 Ti-Lucitone 199군, Ti-Lucitone 199 군과 Ti-Triceram 군의 차이는 통계학적으로 유의하지 않았다. 파절면의 관찰결과 실험군의 대부분은 부착성 파절 양상을 보였다. 결론: 절삭형 티타늄과 의치상용 레진, 티타늄 전용 도재의 결합은 임상적으로 허용 가능한 결합강도를 갖는다.;Purpose: The objective of this study is to evaluate the shear bond strength of three different veneering materials to commercially pure titanium (CP-Ti). Materials and Methods: The total number of specimens for the experimental and control groups were 40. Thirty specimens of CP-Ti disc with 9 mm diameter and 10 mm height were divided into three experimental groups. Each group was bonded to heat-polymerized acrylic resin (Lucitone 199), porcelain (Triceram), and indirect composite (Sinfony) with 7 mm diameter and 2 mm height according to the manufacturers’ recommendations. For the control group (n = 10), type Ⅳ gold alloy castings with 9 mm diameter and 10 mm height were used and heat-polymerized acrylic resins (Lucitone 199) were applied on those castings. All samples were thermocycled for 5000 cycles in 5 - 55 ˚C water. The maximum shear bond strength (MPa) was measured with a Universal Testing Machine (Instron 4465, Canton, Mass, USA) with cross head speed of 1 mm/min. After the shear bond strength test, the failure mode of the veneering material on metal was assessed with a scanning electron microscope (SEM). Statistical analysis of the results was carried out with a Kruskal-Wallis Test and Mann-Whitney Test at a significance level of 0.05. Results: The mean shear bond strength and standard deviations for experimental groups were as follows: Ti-Lucitone 199 (12.11 ± 4.44 MPa); Ti-Triceram (11.09 ± 1.66 MPa); Ti-Sinfony (4.32 ± 0.64 MPa). All of these experimental groups showed lower shear bond strength than the control group (16.14 ± 1.89 MPa). However, there was no statistically significant difference between the Ti-Lucitone 199 group and the control group, and the Ti-Lucitone 199 group and the Ti-Triceram group. Most of the failure patterns in all experimental groups were adhesive failures. Conclusions: The combinations of the casted gold alloy with Lucitone 199, titanium with Lucitone 199, and titanium with Triceram have shown the clinically acceptable shear bond strength.Ⅰ. INTRODUCTION = 1 Ⅱ. MATERIALS AND METHODS = 3 A. Materials = 3 B. Methods = 5 Ⅲ. RESULTS = 10 Ⅳ. DISCUSSION = 14 Ⅴ. CONCLUSIONS = 20 REFERENCES = 21 APPENDIX = 24 국문초록 = 3

Autonomous vehicle localization using probabilistic feature map update

학위논문(석사) - 한국과학기술원 : 로봇공학학제전공, 2021.2,[iii, 29 p. :]차량의 정밀한 위치 인식은 자율주행의 핵심요소이다. 일반적으로 위성항법 시스템과 관성 측정 장비를 융합한 위치 측위 방법을 주로 사용하지만, 도심 환경, 터널과 같이 위성항법 시스템의 음영지역이나 다중경로 오차가 발생하면 추정된 위치를 신뢰할 수 없다. 본 논문에서는 사전에 제작된 3차원 점군 지도를 이용하여 특징지도를 업데이트하고, 3차원 라이다 센서를 이용한 특징점 매칭에 활용하는 자율주행 자동차의 위치 인식 기법을 제안한다. 3차원 점군 지도는 밀집된 점군 데이터의 집합으로 구성되어 메모리 저장공간 및 알고리즘의 실시간성 측면에서 비효율적이다. 따라서, 도로 환경의 기둥, 빌딩, 연석의 특징을 추출하여 높이 방향을 고려한 확률적 특징지도를 생성하였다. 라이다 스캔 매칭을 통해 실시간으로 추정되는 차량의 위치는 특징지도를 기반으로 특징점을 매칭하는 파티클 필터 프레임워크를 적용하여 보정하였다. 본 논문에서 제안한 위치 추정 시스템은 RTK GNSS/INS 대비 위치 오차를 평가하여 정확도를 검증하였으며, 기존의 방법과의 비교 및 분석을 통해 성능을 평가하였다.한국과학기술원 :로봇공학학제전공

Cyst-motile relationship, morphology and phylogeny of a new chain-forming dinoflagellate Cucumeridinium tongyeongese sp. nov. from the south coast of Korea

A new species, Cucumeridinium tongyeongese sp. nov. was established by incubating resting cysts, which were collected from surface sediment samples from Tongyeong coastal area, Korea. The resting cysts were spherical or ovoidal, with a large reddish pigment body and surrounded with a thick mucous layer including agglutinate detritus particles. The vegetative cells were 29&#8211 40 μm in length and 24&#8211 35 μm in width. The cell surface was covered with longitudinal equidistant ridges. The cingulum was narrow and had a cingulum descending ~5 times its width. The nucleus was obovoid and located at the central part of the epicone. The peripheral chloroplasts were usually granular and yellow-greenish in culture conditions, and were distributed along the rim of the cingulum. The apical groove was loop-shaped. The vegetative cells of C. tongyeongese can be clearly differentiated from the other Cucumeridinium species based on several morphological characteristics formation of cell-chains, shape of chloroplasts and the position of nucleus. Molecular phylogenetic analysis using small subunit rRNA gene sequences showed that C. tongyeongese was allied with other Cucumeridinium species. Large subunit ribosomal DNA sequences revealed that C. tongyeongese formed a clade distantly related to the other genera within the order Gymnodiniales.e reddish pigment body and surrounded with a thick mucous layer including agglutinate detritus particles. The vegetative cells were 29&#8211 40 μm in length and 24&#8211 35 μm in width. The cell surface was covered with longitudinal equidistant ridges. The cingulum was narrow and had a cingulum descending ~5 times its width. The nucleus was obovoid and located at the central part of the epicone. The peripheral chloroplasts were usually granular and yellow-greenish in culture conditions, and were distributed along the rim of the cingulum. The apical groove was loop-shaped. The vegetative cells of C. tongyeongese can be clearly differentiated from the other Cucumeridinium species based on several morphological characteristics formation of cell-chains, shape of chloroplasts and the position of nucleus. Molecular phylogenetic analysis using small subunit rRNA gene sequences showed that C. tongyeongese was allied with other Cucumeridinium species. Large subunit ribosomal DNA sequences revealed that C. tongyeongese formed a clade distantly related to the other genera within the order Gymnodiniales.2

한국해양과학기술원 해양시료도서관에 구축된 해양플랑크톤 배양주 보존실 Ⅰ. 식물플랑크톤 배양주

한국해양과학기술원은 해양생태계에서 중요한 1차 생산자인 식물플랑크톤을 활용한 연구 활성화를 위하여, 1995년부터 한국해양미세조류은행(KMMCC)에서 보존, 관리해온 식물플랑크톤 배양주를 거제 남해연구소 해양시료도서관으로 이관하였다. 이관된 배양주는 현재 형태적 특징을 바탕으로 종에 대한 명확성을 확보하고자 재동정을 수행하고 있다. 그중 동정이 완료된 규조류의 형태적 정보를 제공하고자 하며, 분양을 통한 연구 활성화를 유도하기 위하여 분양 요청자 중심의 시스템(http://lims.kiost.ac/portal/ms/hsPlLstPG.do)과 보존실을 소개하고자 한다.는 현재 형태적 특징을 바탕으로 종에 대한 명확성을 확보하고자 재동정을 수행하고 있다. 그중 동정이 완료된 규조류의 형태적 정보를 제공하고자 하며, 분양을 통한 연구 활성화를 유도하기 위하여 분양 요청자 중심의 시스템(http://lims.kiost.ac/portal/ms/hsPlLstPG.do)과 보존실을 소개하고자 한다.2

한국해양과학기술원 해양시료도서관의 해양플랑크톤 배양주 보존과 활용

해양플랑크톤은 해양생태계에서 생산자로 구분이 되는 생물군으로,많은 응용 연구를 통해 탄수화물,지방질,단백질 등 다양한 생리활성 물질을 포함하고 있는것으로 알려져 있으며,최근에는 범 지구적으로 발생하는 기후변화 문제,식량문제,화석연료 고갈에 따른 신재생 에너지 문제등을 해결 할 수 있는 미래의 생명자원으로서도 입지가 커지고 있다.생명자원으로서 해양플랑크톤의 중요성에 대한인식이 확산되면서 다양한 국제협약이 체결되고,FAO,OECD와 같은 국제기구에서 해양플랑크톤 보존과 활용을 위한 활발한 지원사업이 이루어 지고 있다.우리나라 또한 “해양생명자원의 확보,관리 및 이용등에 관한 법률”에 의거 다양한 해양생명자원의 체계적 관리를 위해 해양생명자원 통합정보시스템을 구축,운영중에있으며, 해양플랑크톤의 경우 1995년부터 부경대학교에 한국해양미세조류은행(KMMCC)을 두고 생명자원으로서 해양플랑크톤을 보존,활용해 왔다.하지만,최근에 관리자의 은퇴로 인해 그 동안 보존,관리 해온 해양플랑크톤의 안정성이 불확실해 졌고,한국해양과학기술원은 이 문제를 해결하기 위해 남해연구소에 소재한 해양시료도서관으로 해양플랑크톤 자원을 이관하였다.이관된 자원은 해양식물/동물 플랑크톤을 포함하고 있으며,체계적/안적적 보존과 활용을 위하여 특수 보존 랙 뿐만 아니라,관리 시스템을 완성하였고,연구자들의 분양 활성화를 위하여해양시료도서관의 해양시료검색시스템과 연계한 해양플랑크톤분양시스템을 구축하였으며,본 학회를 통해 소개하고자 한다.갈에 따른 신재생 에너지 문제등을 해결 할 수 있는 미래의 생명자원으로서도 입지가 커지고 있다.생명자원으로서 해양플랑크톤의 중요성에 대한인식이 확산되면서 다양한 국제협약이 체결되고,FAO,OECD와 같은 국제기구에서 해양플랑크톤 보존과 활용을 위한 활발한 지원사업이 이루어 지고 있다.우리나라 또한 “해양생명자원의 확보,관리 및 이용등에 관한 법률”에 의거 다양한 해양생명자원의 체계적 관리를 위해 해양생명자원 통합정보시스템을 구축,운영중에있으며, 해양플랑크톤의 경우 1995년부터 부경대학교에 한국해양미세조류은행(KMMCC)을 두고 생명자원으로서 해양플랑크톤을 보존,활용해 왔다.하지만,최근에 관리자의 은퇴로 인해 그 동안 보존,관리 해온 해양플랑크톤의 안정성이 불확실해 졌고,한국해양과학기술원은 이 문제를 해결하기 위해 남해연구소에 소재한 해양시료도서관으로 해양플랑크톤 자원을 이관하였다.이관된 자원은 해양식물/동물 플랑크톤을 포함하고 있으며,체계적/안적적 보존과 활용을 위하여 특수 보존 랙 뿐만 아니라,관리 시스템을 완성하였고,연구자들의 분양 활성화를 위하여해양시료도서관의 해양시료검색시스템과 연계한 해양플랑크톤분양시스템을 구축하였으며,본 학회를 통해 소개하고자 한다.2

한국해양과학기술원 해양시료도서관에 구축된 해양플랑크톤 배양주 보존실 Ⅱ. 동물플랑크톤 배양주

한국해양과학기술원은 해양생태계에서 중요 생물군인 동물플랑크톤을 활용한 연구 활성화를 위하여, 2008년부터 유용해양플랑크톤 자원은행(CCUMP)에서 보존, 관리해온 동물플랑크톤 배양주를 거제 남해연구소 해양시료도서관으로 이관하였다. 이관된 배양주는 총 120 배양주로, 7강 31속 38종이며, Copepoda(56%), Eurotatoria(35%), Branchiopoda(5%), Heterotrichea(1.6%), Ostracoda(0.8%), Oligohymenophorea(0.8%)와 Rhabditophora(0.8%)이다. 해양시료도서관에는 이관된 동물플랑크톤 배양주를 안정적/체계적으로 보존, 관리하고, 분양을 통한 연구 활성화를 유도하기 위하여, 분양 요청자 중심의 시스템과 보존실을 최근에 완성하였으며, 본 학회를 통해 배양주의 형태적 정보와 함께 분양 시스템(http://lims.kiost.ac.kr)을 소개하고자 한다.는 총 120 배양주로, 7강 31속 38종이며, Copepoda(56%), Eurotatoria(35%), Branchiopoda(5%), Heterotrichea(1.6%), Ostracoda(0.8%), Oligohymenophorea(0.8%)와 Rhabditophora(0.8%)이다. 해양시료도서관에는 이관된 동물플랑크톤 배양주를 안정적/체계적으로 보존, 관리하고, 분양을 통한 연구 활성화를 유도하기 위하여, 분양 요청자 중심의 시스템과 보존실을 최근에 완성하였으며, 본 학회를 통해 배양주의 형태적 정보와 함께 분양 시스템(http://lims.kiost.ac.kr)을 소개하고자 한다.2

Resting cysts of potentially harmful dinoflagellates in Korean coastal area

The frequency of harmful algal blooms (HABs) has been increasing dramatically since the 1980’s in Korean coastal waters, caused by the cyst-forming dinoflagellates. Although the distribution of dinoflagellate resting cysts has been widely investigated in Korean coastal areas, morphological characteristics of resting cysts of potentially harmful dinoflagellates are still unclear. Here we provide the descriptions of these potentially harmful dinoflagellates cysts in detail to help a better understanding of the morphological characteristics and biogeographic distribution of potentially harmful dinoflagellates. Sediment samples were collected from 51 stations in the southern coastal area, Korea. Viable resting cysts were isolated and induced to excysts, and identification was based on morphological characteristics and molecular phylogenetic positions of the germinated cells. 9 potentially harmful dinoflagellate species were identified: 7 potentially toxic species and 2 potentially bloom-forming species. The resting cysts of Gymnodinium aureolum, which has a smooth, thin wall and many pale lipid globules, were first observed from natural sediments. The presence of resting cysts of potentially harmful dinoflagellates suggests that further research deserves more attention and efforts in HAB monitoring and management.investigated in Korean coastal areas, morphological characteristics of resting cysts of potentially harmful dinoflagellates are still unclear. Here we provide the descriptions of these potentially harmful dinoflagellates cysts in detail to help a better understanding of the morphological characteristics and biogeographic distribution of potentially harmful dinoflagellates. Sediment samples were collected from 51 stations in the southern coastal area, Korea. Viable resting cysts were isolated and induced to excysts, and identification was based on morphological characteristics and molecular phylogenetic positions of the germinated cells. 9 potentially harmful dinoflagellate species were identified: 7 potentially toxic species and 2 potentially bloom-forming species. The resting cysts of Gymnodinium aureolum, which has a smooth, thin wall and many pale lipid globules, were first observed from natural sediments. The presence of resting cysts of potentially harmful dinoflagellates suggests that further research deserves more attention and efforts in HAB monitoring and management.2

Morphological Features of Marine Dinoflagellates from Jangmok Harbour in Jinhae Bay, Korea: A Case of 30 Species in the Orders Prorocentrales, Dinophysiales, Gonyaulacales and Gymnodiniales

Most previous studies on dinoflagellates in Korean coastal areas were conducted without morphological descriptions and illustrations of the observed dinoflagellates. This indicates that the species and diversity of dinoflagellates may have been respectively misidentified and underestimated in the past, probably due to cell shrinkage, distortion and loss caused by sample fixation. This study provides information on the morphological observations of four dinoflagellate orders (Prorocentrales, Dinophysiales, Gonyaulacales and Gymnodiniales) from Jangmok Harbour in Jinhae Bay, Korea. The unfixed samples were collected weekly from December 2013 to February 2015. A total of 13 genera and 30 species were identified using light and scanning electron microscopy, although some samples were not clarified at the species level. Harmful dinoflagellates, Prorocentrum donghaiense, Tripos furca, Alexandrium affine, A. fundyense, Akashiwo sanguinea and Cochlodinium polykrikoides, were identified based on the morphological observations. The results also reflect the occurrence and identification of dinoflagellates that had not been previously recorded in Jangmok Harbour.33Nkciothe