Phenotypic and genotypic characterization of plasmid-mediated AmpC beta-lactamases in enteric Gram-negative bacteria from patients with lower respiratory tract infections in a tertiary hospital, southwest Nigeria

Background: AmpC or class C or group 1 beta lactamases are class C cephalosporinases that hydrolyse a wide variety of beta-lactam antibiotics including alpha methoxy beta-lactams (cefoxitin), narrow and broad spectrum cephalosporins. This study was conducted to characterize plasmid-mediated AmpC producing enteric Gram- negative bacteria from patients with lower respiratory tract infections in Obafemi Awolowo University Teaching Hospital Complex (OAUTHC) Ile Ife, Osun State, NigeriaMethodology: A total of 149 patients with clinical features of lower respiratory tract infections (LRTI) were selected by simple random sampling for the study. All Gram-negative isolates recovered from standard microbiological cultures of respiratory specimens of these patients were tested against cefoxitin, third generation cephalosporins (3GCs), and other antibiotics using the disc diffusion AST method, and also screened for production of AmpC beta-lactamases phenotypically by the CLSI method. Plasmid DNA extraction was carried out on twenty-nine cefoxitin-resistant selected isolates using the Kado and Lin method, while genotypic detection of plasmid-mediated AmpC gene was carried out by the polymerase chain reaction (PCR) assay.Results: The results showed that 204 (43.3%) of 471 isolates recovered from the 149 selected patients were resistant to 3GC in the AST assay, among which 121 (59.3%) were resistant to cefoxitin, and 189 of the 471 isolates (40.1%) were AmpC producers. The AmpC producers concurrently showed multiple resistance pattern to other antibiotics tested in this study. Ninety six percent of the 29 selected isolates for plasmid analysis contained plasmids, 45% of which amplified positive on PCR for CMY, 38% for FOX, and 31% for ACC types of AmpC genes.Conclusion: This study showed a high degree of antibiotic resistance among enteric Gram-negative bacteria recovered from patients with LRTIs, as well as high degree of plasmid-encoded AmpC genes responsible for this high antibiotic resistance among the isolates. Proper antibiotic policy and regulation are required to limit the spread of plasmid mediated AmpC β-lactamase producing organisms because they can lead to therapeutic failure in infected patients in the nearest future.   French title: Caractérisation phénotypique et génotypique des bêta-lactamases AmpC à médiation plasmidique dans les bactéries entériques Gram-négatives de patients atteints d'infections des voies respiratoires inférieures dans un hôpital tertiaire, sud-ouest du Nigéria Contexte: Les bêta-lactamases AmpC ou de classe C ou de groupe 1 sont des céphalosporinases de classe C qui hydrolysent une grande variété d'antibiotiques bêta-lactamines, y compris les alpha-méthoxy bêta-lactamines (céfoxitine), les céphalosporines à spectre étroit et large. Cette étude a été menée pour caractériser les bactéries à Gram négatif entériques produisant de l'AmpC à médiation plasmidique chez des patients atteints d'infections des voies respiratoires inférieures du complexe hospitalier universitaire d'Obafemi Awolowo (OAUTHC) Ile Ife, État d'Osun, NigériaMéthodologie: Un total de 149 patients présentant des caractéristiques cliniques d'infections des voies respiratoires inférieures (LRTI) ont été sélectionnés par échantillonnage aléatoire simple pour l'étude. Tous les isolats à Gram négatif récupérés à partir de cultures microbiologique standard d'échantillons respiratoires de ces patients ont été testés contre la céfoxitine, les céphalosporines de troisième génération (3GC) et d'autres antibiotiques en utilisant la méthode AST de diffusion sur disque, et également criblés pour la production de bêtalactamases AmpC phénotypiquement par le Méthode CLSI. L'extraction de l'ADN plasmidique a été réalisée sur 29 isolats sélectionnés résistants à la céfoxitine en utilisant la méthode Kado et Lin, tandis que la détection  génotypique du gène AmpC à médiation plasmidique a été réalisée par le test de réaction en chaîne par polymérase (PCR).Résultats: Les résultats ont montré que 204 (43,3%) des 471 isolats récupérés des 149 patients sélectionnés étaient résistants à la 3GC dans le test AST, parmi lesquels 121 (59,3%) étaient résistants à la céfoxitine et 189 des 471 isolats (40,1%) étaient des producteurs d'AmpC. Les producteurs d'AmpC ont montré simultanément plusieurs profils de résistance à d'autres antibiotiques testés dans cette étude. Quatre-vingt-seize pour cent des 29 isolats sélectionnés pour l'analyse des plasmides contenaient des plasmides, dont 45%  amplifiés positifs par PCR pour CMY, 38% pour FOX et 31% pour les types ACC des gènes AmpC.Conclusion: Cette étude a montré un degré élevé de résistance aux antibiotiques parmi les bactéries entériques Gram-négatives  récupérées chez des patients atteints de LRTI, ainsi qu'un degré élevé de gènes AmpC codés par plasmide responsable de cette résistance élevée aux antibiotiques parmi les isolats. Une politique et une réglementation appropriées en matière d'antibiotiques sont nécessaires pour limiter la propagation des organismes producteurs β-lactamase d'AmpC à médiation plasmidique car ils peuvent conduire à un échec thérapeutique chez les patients infectés dans un avenir proche. &nbsp

Arbuscular mycorrhiza contribution to the growth performance and heavy metal uptake of Helianthus annuus LINN in pot culture

A greenhouse experiment was conducted to assess the arbuscular mycorrhiza contribution to the growth performance and heavy metals (Cd and Pb) uptake of Helianthus annuus L. from polluted soils. Cadmium sulfate (CdSO4.8H2O) and lead acetate ((CH3COO)2Pb.3H2O) were applied at the concentrations: Cd- 0,20,40,60,80 mg kg-1 and Pb-0,250,500,750,1000 mg kg-1 in 90 plastic pots filled with 5 kg of topsoil each. Propagules of Glomus mosseae (GM) and Glomus intraradices (GI) at 25 g per pot were applied. Non-inoculated pots served as controls. Each treatment was replicated thrice in completely randomized design. Data were analysed using ANOVA and descriptive statistics. Results showed that arbuscular mycorrhiza (AM) fungi significantly (p ≤ 0.05) influenced the number of leaves, plant height and stem girth of sunflower plants only at 80 mg Cd kg-1 concentration. Highest values of 0.11 mg Cd kg-1 and 0.29 mg Pb kg-1 were obtained with GI in the dry shoot of Helianthus annuus while 0.05 mg Cd kg-1 and 0.23 mg Pb kg-1 were remediated with GM application. Least values of Cd and Pb were removed when no AM was applied. GM and GI fungi enhanced the growth of Helianthus annuus and the uptake of Cd and Pb; but GI performed better. Also, a significant (p < 0.05) reduction of AM fungi colonization percentage was obtained with increase in Cd and Pb concentrations.Key words: Glomus mosseae, Glomus intraradices, Helianthus annuus, phytoremediation, polluted soil

Alcohol-pentazocine combination: implication on the cytoarchitectural profile of the medial prefrontal cortex and cerebellum of juvenile male rats

Recently, Pentazocine and alcohol have become one of the drugs abused in the developing countries. However, there is the dearth of information on the effects of these substances on the cytological profile of the medial prefrontal cortex (mPFC) and cerebellar cortex; hence this study was aimed at evaluating the effect of these substances on the cytoarchitectural profile of the mPFC and cerebellar cortex of juvenile male rats. Twenty-four juvenile male rats were used for this study. They were randomly assigned to control (A), Alcohol-treated (B), Pentazocine-treated (C), and Pentazocine-Alcohol-treated group (D). Exposure to the various treatment paradigm was done s.c. twice daily (6hrs interval) for 14 days. It was observed that the cytological profile of the mPFC of the rats in the control groups was visible and well defined. In the B, C and D groups, there were numerous forms of neurodegeneration. There was also an increase in the density of astrocytes with the presence of glial scars. Furthermore, features of degenerative changes were also seen in the cerebellar cortex of the rats in the B, C, and D groups. It was observed from this study that exposure to Pentazocine-Alcohol combination triggers inflammatory and neurodegenerative processes in the cytoarchitectural profile of the mPFC and cerebellar cortex in juvenile male rats. These features could impair the functional integrity associated with these brain regions.Keywords: addiction, substance abuse, opioid, male, youn

Phytochemical, Antimicrobial and Gc-Ms of African Nutmeg (Monodora Myristica).

The quest to continue searching for new antibiotic, anti-parasites necitate this project as African nutmeg is a very useful plants medically and all its parts are useful. The major aim of this research work was to examine the monodora myristica for its secondary metabolites, antimicrobial analysis and to characterize the oil using gas chromatography mass spectrophotometer. The antimicrobial screening was done using agar method and the isolates used were obtained from the microbiology laboratory, Federal University of Technology, Akure, saponin, alkaloid, tannin and flavonoids were determined using standard methods. The results of the characterization of oil showed that organic compounds and fatty acids were present, the fatty acids present included, Palmitic acid, Eicosanoic acid, stearic acid, oleic acid, the results showed that the plants contained essential fatty acids useful for both adult and infant. The result of antimicrobial screening showed that the oil was very sensitive against the tested isolates. After 24hours incubation, the zone of inhibitions against Escherichia coli was (11millimetre), Bacillus substilis (8millimetre) and Staphylococcus aureus (11millimeter). The result compares favorably with standard streptomycin, the result of zone of inhibition against Escherichia coli of the sample (11millimetre) was better than that recorded for standard streptomycin (7millimetre).These may be as a result of presence various secondary metabolites which were discovered in the sample during analyses. These are flavonoids, tannin, saponin and alkaloids

Assessment of Different Biochar and Composted Cow Dung on Soil Properties, Growth and Cob Weight of Maize

Crop production in tropical soils is constrained by low fertility. The scarcity and high prices of chemical fertilizers have added to the existing challenges. This study examined the influence of different types of biochar and cow dung compost (CDC) on soil properties, growth and cob weight of maize. A polythene pot experiment was conducted at the screen house of the Institute of Ecology, Obafemi Awolowo University, Ile-Ife, Nigeria. The experiment was laid out in a completely randomized design. Amendments used were: cow dung compost, cow dung biochar and maize cob biochar, which were applied singly at the rates of 0, 4, 8, 12, 16 t.ha-1. The production of biochar from cow dung compost and maize cobs was done using a local charcoal-fired reactor. The feedstocks were slowly pyrolyzed at 350 0C and removed after 3hrs. The treatments were replicated twice. Soils amended with CDC had the highest growth parameters compared to other amendments. In the first season, CDC had a 22% increase in height compared to MCB. CDC had a height of 72 cm while MCB had the lowest height with 56 cm. The growth rate was as follows: CDC > CDB > MCB. CDC also increased cob weights when compared to other amendments. At 4 t ha-1, CDC had  2.20 g, CDB had 0.90 g while MCB had 0.47 g. Significant differences were observed among the treatments. However, it was observed that CDB increased soil chemical properties compared to other amendments. Soil properties such as organic carbon and total nitrogen were significantly improved in soils treated with CDB. This study concluded that cow dung biochar was better suited to improve soil properties while also improving crop growth compared to other amendments

Vaccination contre le virus du papillome humain pour le contrôle du cancer du col : Défi pour les pays en développement.

Primary HPV prevention may be the key to reducing incidence and burden of cervical cancer particularly in resource-poor countries. Vaccination programmes are already established in several developed regions, but several grey areas stand in the path of similar success in developing countries. This review sought to identify challenges of HPV vaccination in developing countries and discuss vaccine use, pitfalls and controversies; areas requiring collaborative efforts were identified. A Pub Med search was done; key words included Human papilloma virus, HPV vaccine and sub-Saharan Africa. Other resources included locally-published articles and additional internet resources. The potential benefit of mass HPV vaccination appears enormous. However, the challenges of competing health demands, poverty, ignorance, religion, culture, weak health system, establishment of an effective intersectoral collaboration and underfunding must be overcome to make maximal vaccine uptake a reality. Education and effective communication is crucial in achieving successful immunization programmesLa prévention du virus VPH peut être la clé à la réduction de l’incidence et du fardeau du cancer du col, surtout dans les pays qui n’ont pas assez de ressources. Des programmes de la vaccination ont été établis dans plusieurs régions avancées, mais beaucoup d’incertitude entravent le succès pareil dans les pays en développement. Cette étude a cherché à identifier les défis de la vaccination contre le VPH dans les pays en développement et discute l’emploi du vaccin, les pièges et les controverses ; les domaines qui méritent les efforts en collaboration ont été identifiés. Nous avons fait une recherche à la Pub Med ; les mots clé comprenaient le virus papillome humain, le vaccin contre le VPH et l’Afrique subsaharienne. D’autres ressources comprenaient les articles publiés localement et des ressources d’internet supplémentaires. L’avantage potentiel de la vaccination contre le VPH paraît énorme. Néanmoins, les défis des exigences sanitaires qui se font concurrence, la pauvreté, l’ignorance, la religion. La culture, un système sanitaire peu efficace, l’établissement d’une collaboration intersectorielle efficace et l’entente doivent être maîtrisés pour rendre l’acceptation du vaccin maximal une réalité. L’éducation et une communication efficace sont cruciales pour accomplir des programmes de l’immunisation réussit

Vaccination contre le virus du papillome humain pour le contrôle du cancer du col : Défi pour les pays en développement.

Primary HPV prevention may be the key to reducing incidence and burden of cervical cancer particularly in resource-poor countries. Vaccination programmes are already established in several developed regions, but several grey areas stand in the path of similar success in developing countries. This review sought to identify challenges of HPV vaccination in developing countries and discuss vaccine use, pitfalls and controversies; areas requiring collaborative efforts were identified. A Pub Med search was done; key words included Human papilloma virus, HPV vaccine and sub-Saharan Africa. Other resources included locally-published articles and additional internet resources. The potential benefit of mass HPV vaccination appears enormous. However, the challenges of competing health demands, poverty, ignorance, religion, culture, weak health system, establishment of an effective intersectoral collaboration and underfunding must be overcome to make maximal vaccine uptake a reality. Education and effective communication is crucial in achieving successful immunization programmesLa prévention du virus VPH peut être la clé à la réduction de l’incidence et du fardeau du cancer du col, surtout dans les pays qui n’ont pas assez de ressources. Des programmes de la vaccination ont été établis dans plusieurs régions avancées, mais beaucoup d’incertitude entravent le succès pareil dans les pays en développement. Cette étude a cherché à identifier les défis de la vaccination contre le VPH dans les pays en développement et discute l’emploi du vaccin, les pièges et les controverses ; les domaines qui méritent les efforts en collaboration ont été identifiés. Nous avons fait une recherche à la Pub Med ; les mots clé comprenaient le virus papillome humain, le vaccin contre le VPH et l’Afrique subsaharienne. D’autres ressources comprenaient les articles publiés localement et des ressources d’internet supplémentaires. L’avantage potentiel de la vaccination contre le VPH paraît énorme. Néanmoins, les défis des exigences sanitaires qui se font concurrence, la pauvreté, l’ignorance, la religion. La culture, un système sanitaire peu efficace, l’établissement d’une collaboration intersectorielle efficace et l’entente doivent être maîtrisés pour rendre l’acceptation du vaccin maximal une réalité. L’éducation et une communication efficace sont cruciales pour accomplir des programmes de l’immunisation réussit

Psychosocial Issues Affecting Surgical Care of HIVAIDS Patients in University College Hospital Ibadan, Nigeria, West Africa.

The paper discloses that patients with HIVAIDS receive sub-optimal surgical care in the University College Hospital Ibadan, Nigeria. Reasons adduced are, in the majority, of a psychosocial hue and these are explained under subheadings of the rigid mindset of the surgical care-givers themselves, the stigma attached to both infected patient and non-infected relation also, the fraudulent ‘AIDS for gain’ population and lastly the socio-cultural practices that do not augur well for good surgical health-care delivery. The paper concludes that without a mental paradigm shift, adequate and speedy surgical care will continue to elude HIVAIDS patients in Ibadan, Nigeria

Phenotypic and genotypic characterization of plasmid-mediated AmpC beta-lactamases in enteric Gram-negative bacteria from patients with lower respiratory tract infections in a tertiary hospital, southwest Nigeria

Background: AmpC or class C or group 1 beta lactamases are class C cephalosporinases that hydrolyse a wide variety of beta-lactam antibiotics including alpha methoxy beta-lactams (cefoxitin), narrow and broad spectrum cephalosporins. This study was conducted to characterize plasmid-mediated AmpC producing enteric Gram- negative bacteria from patients with lower respiratory tract infections in Obafemi Awolowo University Teaching Hospital Complex (OAUTHC) Ile Ife, Osun State, NigeriaMethodology: A total of 149 patients with clinical features of lower respiratory tract infections (LRTI) were selected by simple random sampling for the study. All Gram-negative isolates recovered from standard microbiological cultures of respiratory specimens of these patients were tested against cefoxitin, third generation cephalosporins (3GCs), and other antibiotics using the disc diffusion AST method, and also screened for production of AmpC beta-lactamases phenotypically by the CLSI method. Plasmid DNA extraction was carried out on twenty-nine cefoxitin-resistant selected isolates using the Kado and Lin method, while genotypic detection of plasmid-mediated AmpC gene was carried out by the polymerase chain reaction (PCR) assay.Results: The results showed that 204 (43.3%) of 471 isolates recovered from the 149 selected patients were resistant to 3GC in the AST assay, among which 121 (59.3%) were resistant to cefoxitin, and 189 of the 471 isolates (40.1%) were AmpC producers. The AmpC producers concurrently showed multiple resistance pattern to other antibiotics tested in this study. Ninety six percent of the 29 selected isolates for plasmid analysis contained plasmids, 45% of which amplified positive on PCR for CMY, 38% for FOX, and 31% for ACC types of AmpC genes.Conclusion: This study showed a high degree of antibiotic resistance among enteric Gram-negative bacteria recovered from patients with LRTIs, as well as high degree of plasmid-encoded AmpC genes responsible for this high antibiotic resistance among the isolates. Proper antibiotic policy and regulation are required to limit the spread of plasmid mediated AmpC β-lactamase producing organisms because they can lead to therapeutic failure in infected patients in the nearest future.&#x0D;  &#x0D; French title: Caractérisation phénotypique et génotypique des bêta-lactamases AmpC à médiation plasmidique dans les bactéries entériques Gram-négatives de patients atteints d'infections des voies respiratoires inférieures dans un hôpital tertiaire, sud-ouest du Nigéria&#x0D; Contexte: Les bêta-lactamases AmpC ou de classe C ou de groupe 1 sont des céphalosporinases de classe C qui hydrolysent une grande variété d'antibiotiques bêta-lactamines, y compris les alpha-méthoxy bêta-lactamines (céfoxitine), les céphalosporines à spectre étroit et large. Cette étude a été menée pour caractériser les bactéries à Gram négatif entériques produisant de l'AmpC à médiation plasmidique chez des patients atteints d'infections des voies respiratoires inférieures du complexe hospitalier universitaire d'Obafemi Awolowo (OAUTHC) Ile Ife, État d'Osun, NigériaMéthodologie: Un total de 149 patients présentant des caractéristiques cliniques d'infections des voies respiratoires inférieures (LRTI) ont été sélectionnés par échantillonnage aléatoire simple pour l'étude. Tous les isolats à Gram négatif récupérés à partir de cultures microbiologique standard d'échantillons respiratoires de ces patients ont été testés contre la céfoxitine, les céphalosporines de troisième génération (3GC) et d'autres antibiotiques en utilisant la méthode AST de diffusion sur disque, et également criblés pour la production de bêtalactamases AmpC phénotypiquement par le Méthode CLSI. L'extraction de l'ADN plasmidique a été réalisée sur 29 isolats sélectionnés résistants à la céfoxitine en utilisant la méthode Kado et Lin, tandis que la détection  génotypique du gène AmpC à médiation plasmidique a été réalisée par le test de réaction en chaîne par polymérase (PCR).Résultats: Les résultats ont montré que 204 (43,3%) des 471 isolats récupérés des 149 patients sélectionnés étaient résistants à la 3GC dans le test AST, parmi lesquels 121 (59,3%) étaient résistants à la céfoxitine et 189 des 471 isolats (40,1%) étaient des producteurs d'AmpC. Les producteurs d'AmpC ont montré simultanément plusieurs profils de résistance à d'autres antibiotiques testés dans cette étude. Quatre-vingt-seize pour cent des 29 isolats sélectionnés pour l'analyse des plasmides contenaient des plasmides, dont 45%  amplifiés positifs par PCR pour CMY, 38% pour FOX et 31% pour les types ACC des gènes AmpC.Conclusion: Cette étude a montré un degré élevé de résistance aux antibiotiques parmi les bactéries entériques Gram-négatives  récupérées chez des patients atteints de LRTI, ainsi qu'un degré élevé de gènes AmpC codés par plasmide responsable de cette résistance élevée aux antibiotiques parmi les isolats. Une politique et une réglementation appropriées en matière d'antibiotiques sont nécessaires pour limiter la propagation des organismes producteurs β-lactamase d'AmpC à médiation plasmidique car ils peuvent conduire à un échec thérapeutique chez les patients infectés dans un avenir proche.&#x0D;  </jats:p