Application of fast technology for analysis (FTA) for sampling and recovery of deoxyribonucleic acid (DNA) for molecular characterization of cowpea breeding lines for Striga resistance

Article purchasedStriga gesnerioides (Willd) Vatke is a significant constraint to cowpea production in the dry savannas of sub-Saharan Africa. Yield losses caused by S. gesnerioides in these regions are estimated in millions of tons annually and the prevalence of Striga soil infestation is steadily increasing. Conventional breeding efforts have developed some cowpea lines with Striga resistance as well as other important agronomic traits but it is time-consuming and difficult to pyramid favorable traits. The use of marker-assisted selection (MAS) makes it easier to select plant traits and reduce the time needed to develop new varieties. The potential of Fast Technology for Analysis (FTA) as an effective technology for sampling and retrieval of DNA from plant tissue and their subsequent molecular analysis was assessed in the laboratory. DNA was successfully recovered from the leaf tissues of cowpea pressed into the FTA® Classic card and the DNA obtained from the FTA papers was found to be suitable for molecular analysis by PCR-based techniques. The marker efficiency of Sequence Characterized Amplified Region (SCAR) marker MahSe2 and C42B was 93% in detecting SG3 resistance. This study demonstrated that the application of MAS using FTA technology has the potential to put the breeding process on a fast track and increase the efficiency of breeding activities

Communicating seasonal forecasts to farmers in Kaffrine, Senegal for better agricultural management

Our project explaining seasonal forecasting to farmers in central Senegal built common ground between scientific forecasting and traditional knowledge. It helped farmers understand and use seasonal forecasts to improve crop strategies, and let farmers explain to meteorologists what seasonal climate information they most needed, in turn improving the forecasts’ usefulness

Options de Modèles d’Affaires pour Assurer la Durabilité de l’Utilisation des Services d’Information Climatique au Sénégal

USAID/CINSERE (Services d’information climatiques pour améliorer la résilience et la productivité au Sénégal) est un projet de résilience qui vise à renforcer les capacités nationales pour la production, l’accès et la diffusion efficiente d’informations météorologiques et climatiques (IC) et de développer des stratégies pour une mise à l’échelle durable de l’utilisation des services d’information météorologiques et climatiques (SIC) sur toute l’étendue du territoire national. Le projet est financé par l’USAID et mis en œuvre par le Programme de Recherche du CGIAR sur le Changement Climatique, l’Agriculture et la Sécurité Alimentaire hébergé par ICRISAT (CCAFS/ICRISAT) en collaboration avec l’ANACIM. La zone d’intervention du projet est celle des projets Feed the Future (FtF) au Sénégal, notamment Naatal Mbay (clôturé en 2019), Yaajeende (remplacé par Kawolor en 2018), ERA (remplacé par Youth in Agriculture en 2018) et COMFISH (remplacé par Dekkal Geej en 2019). Démarré en Mai 2016 pour une durée de trois ans (Jusqu’en mai 2019), le projet a bénéficié d’une extension d’un an. Ainsi, cette première phase de l’USAID/CINSERE prend fin en avril 2020. Durant presque quatre années de mise en œuvre, des résultats assez probants ont été atteints tant dans la production des SIC, la communication et l’utilisation de ces SIC, que dans le renforcement des capacités des bénéficiaires à utiliser de façon efficiente ces SIC. Dans le souci de préserver les acquis du projet et d’assurer une mise à l’échelle soutenue du système de développement et de fourniture des IC en vue d’une utilisation durable des IC au Sénégal, l’USAID a recommandé l’identification, le test, la validation et la mise en œuvre de modèles économiques viables impliquant des partenaires aussi bien du public que du privé (PPP). Le projet USAID/CINSERE s’est donc inspiré des expériences et leçons apprises au Sénégal, au Ghana, au Mali, en Inde et en Amérique Latine (Colombie) en matière de modèles économiques dans la fourniture des SIC pour bâtir des modèles adaptés au contexte du Sénégal. Ce document présente les modèles identifiés ainsi que les défis et perspectives

Species diversity and distribution of ruderal flora on landfills in Maradi city, Niger

Waste management continues to be a critical environmental issue in cities. It impacts on the well being of the population, the environment and the biodiversity. In the city of Maradi, in Niger, more interest is given to the problem in order to understand the whole waste management system. It is in this context that this study is carried out to investigate on the role of ruderal flora on the municipal solid wastes dumpsites and landfill sites in Maradi city. The specific objectives are to determine the floristic diversity and distribution of ruderal flora on the municipal solid waste disposal sites, and to identify potential species that can play an important role in the phytoremediation of these sites. In total, 65 species belonging to 52 genera and 24 families were recorded. These species can be categorised into two groups containing anthropic and nitrophilic species according to the ascending Hierarchical Classification (AHC) at 25% similarity. Characteristic species of the first group G1 are Amaranthus viridis and Cucurbita pepo, and Datura innoxia and Cucumis melo for the second group G2. Other ruderal species, namely Amaranthus spinosus L., Amaranthus viridis L., Celosia trygina L., Datura innoxia Mill., and an introduced woody species, Cuphea hyssopifolia Kunth., found are not included in the Maradi city list of species. Datura innoxia, Amaranthus viridis and Amaranthus spinosus are species known to tolerate different degrees of pollution and their ecology should be further study to better understand how they can be used for phytoremediation on this kind of sites

Optical and Thermal Performance Analysis of a Steady Spherical Collector with a Crescent-shaped Rotating Absorber

In this paper, optical analysis of spherical concentrator is made to determine the local and the global geometric concentration, as knowing the geometric concentration of a system can help predict what temperatures can possibly be obtained with it.This leads to conclude that spherical collectors may produce higher temperatures than parabolic trough, and they could even be sharply improved by using a mixt cylindrical and cavity (or flat) absorber. A craft prototype of a steady spherical concentrator made with concreteand having a smooth inner surface mapped with mirror tape is presented. Its absorber is made with blacken steel sheets and shaped like a moon crescent to be aligned with the declination plan and to avoid motorization for the tracking of the sun from East to West. Experimental measurements lead to temperatures reaching 686°C on the curve of the least diffusion, and 252°C in the absorber oven-like reservoir. Overall, the resultsuggests higher potentialities of spherical collectors,which also show possibility of use with much reduced tracking system and less vulnerability to bad weather

Analysis of pfhrp2 genetic diversity in Senegal and implications for use of rapid diagnostic tests

Background: The Senegalese National Malaria Control Programme has recommended use of rapid diagnostic tests (RDTs) that target the histidine-rich protein 2 (HRP2), specific to Plasmodium falciparum, to diagnose malaria cases. The target antigen has been shown to be polymorphic, which may explain the variability in HRP2-based RDT results reported in field studies. The genetic diversity of the pfhrp2 gene has not been investigated in depth in many African countries. The goal of this study is to determine the extent of polymorphism in pfhrp2 among Senegal, Mali and Uganda parasite populations, and discuss the implications of these findings on the utility of RDTs that are based on HRP2 detection. Methods: Sequencing data from the pfhrp2 locus were used to analyze the genetic diversity of this gene among three populations, with different transmission dynamics and malaria parasite ecologies. Nucleotide diversity (π) and non-synonymous nucleotide diversity (πNS) were studied in the pfhrp2 gene from isolates obtained in Senegal. Amino acid repeat length polymorphisms in the PfHRP2 antigen were characterized and parameters of genetic diversity, such as frequency and correlation between repeats in these populations, were assessed. Results: The diversity survey of the pfhrp2 gene identified 29 SNPs as well as insertion and deletion polymorphisms within a 918 bp region. The Senegal pfhrp2 exhibited a substantial level of diversity [π = 0.00559 and πNS = 0.014111 (πS = 0.0291627)], similar to several polymorphic genes, such as msp1, involved in immune responses, and the gene encoding the SURFIN polymorphic antigen, which are surface exposed parasite proteins. Extensive repeat length polymorphisms in PfHRP2, as well as similar patterns in the number, organization and the type of predicted amino acid repeats were observed among the three populations, characterized by an occurrence of Type 2, Type 4 and Type 7 repeats. Conclusions: These results warrant deeper monitoring of the RDT target antigen diversity and emphasize that development of other essential genes as a target for diagnostic tools is critical

Mise en place d’un Village Intelligent face au Climat pour la réduction des risques climatiques et de l’insécurité alimentaire à Daga-Birame, Sénégal. Guide de visite de terrain pour la Réunion du Comité Scientifique Indépendant du CCAFS

À Daga Birame, au Sénégal, CCAFS et ses partenaires ont mis en place un village climato-intelligent (CSV) dans lequel plusieurs activités sont menées. Sur la base de la vision du village et de son avenir, un ensemble d'actions ont été identifiées par la communauté afin d'atteindre les changements souhaités dans la productivité agricole et la sécurité alimentaire tels que les activités génératrices de revenus, l'amélioration de la résilience et la gestion durable des ressources naturelles du village. Ces actions ont été structurées autour de quatre composantes: Les services d'information climatologique (SIC); le développement des technologies / pratiques agricoles adaptées au climat; le renforcement de capacités des villageois et celle des connaissances et des institutions locales

Impacts des activités socio-économiques sur les ressources en eau du barrage de Tera au Niger

Situé dans le Liptako nigérien, en zone de socle, où les ressources en eau souterraines sont limitées, le département de Téra et, en particulier, son chef lieu, la ville de Téra, est confrontée à un problème aigu d’approvisionnement en eau potable des populations. Aussi, comme solution à ce manque d’eau qui bloque toutes les activités socioéconomiques de la ville, on a réalisé en 1978 le barrage de Téra, dans le cadre de la coopération Nigéro-chinoise. Cependant, la réalisation du réseau d’adduction en eau potable (AEP), a accusé un grand retard dans sa mise en oeuvre. Aussi, les Hautes Autorités du Niger, ont autorisé en 1985, l’utilisation de l’eau du barrage pour l’irrigation, les besoins domestiques, la pêche, etc. L’analyse de ces différentes activités socioéconomiques, développées autour du barrage, montre que celles-ci ont eu des impacts négatifs aussi bien sur la quantité que sur la qualité des eaux du barrage, dont entre autres, les phénomènes d’ensablement/envasement et de pollution.Par ailleurs, cette étude montre que les différents usages de l’eau du barrage sont des sources de revenus substantiels pour plusieurs ménages, leur permettant de lutter contre l’insécurité alimentaire et la pauvreté. Aussi, compte tenu des menaces graves qui posent sur les ressources en eau du barrage, jouant désormais un rôle socioéconomique pour la population de Téra, voire de la Commune de Téra, il paraît urgent d’entreprendre des actions pour une gestion rationnelle et durable des ressources en eau du barrage de Téra, c'est-à-dire, promouvoir au niveau du barrage, la Gestion Intégrée des Ressources en Eau (GIRE), approche adoptée par l’Etat nigérien pour la gestion des ressources hydriques du pays.Mots-clés : Liptako nigérien, AEP, usages des eaux barrage, pollution GIRE, AEP, Téra

Case study of Daga-Birame CSV for CCAFS ISP11/6.1.2 – Senegal

Senegal, with 196,712 km2 land area, is located at the extreme west of the African continent (Longitudes 11°21W - 17°32N and Latitudes 12°8N - 16°41N). The country’s soils are in general of low fertility, fragile and very susceptible to wind and water erosion. The climate is of Sudano-Sahelian type characterized by alternating dry season (November to May) and rainy season (June to October). The 700 km coastline brings climatic differences between coastal areas and inland zones. Rainfall amount follows a latitudinal variation going from 300 mm in the north semi-desertic areas to 1200 mm in the south. Senegal is divided into 7 agro-ecological zones for management perspectives: River Valley, Niayes, Groundnut Basin (North and South), Silvo-Pastoral zone, Eastern Senegal and Upper Casamance, Lower Casamance (CIAT-BFS/USAID, 2016). The country’s economy is mainly driven by crop and livestock production contributing 17% of the GDP and employing about 70% of the population (NAPA, Republic of Senegal 2006). Like other sub-Saharan African countries, Senegal faces food insecurity as a consequence of climate variability and change combined with other global changes (Zougmoré et al., 2015)