The emergence of Vibrio pathogens in Europe: ecology, evolution, and pathogenesis

Global change has caused a worldwide increase in reports of Vibrio-associated diseases with ecosystem-wide impacts on humans and marine animals. In Europe, higher prevalence of human infections followed regional climatic trends with outbreaks occurring during episodes of unusually warm weather. Similar patterns were also observed in Vibrio-associated diseases affecting marine organisms such as fish, bivalves and corals. Basic knowledge is still lacking on the ecology and evolutionary biology of these bacteria as well as on their virulence mechanisms. Current limitations in experimental systems to study infection and the lack of diagnostic tools still prevent a better understanding of Vibrio emergence. A major challenge is to foster cooperation between fundamental and applied research in order to investigate the consequences of pathogen emergence in natural Vibrio populations and answer federative questions that meet societal needs. Here we report the proceedings of the first European workshop dedicated to these specific goals of the Vibrio research community by connecting current knowledge to societal issues related to ocean health and food security

Remplacement total des artémia par des microparticules inertes dans l’élevage larvaire de l’ombrine Sciaenops ocellatus en Martinique

In most of marine fishes cultured, larvae in their early development are fed with live prey (rotifer and/or artemia). In hatcheries, culture of these preys is labour consuming, needs specific facilities and represent an important part of production cast. On the other hand, world artemia production is subjected to fluctuation of harvest in the wild which could Iimit fish farming industry in the near future. A dried formula adapted to marine fish larvae has been perfected by Ifremer's center of Brest (France) and is distributed by a feeding company since 1999. This artificial microbound diet has been successfully tested on several temperate fishes such as European seabass (Dicentrarchus labrax), Atlantic cod (Gadus morhua) or European seabream (Sparus aurata) in a co-feeding (i.e. artemia and dried diet) strategy. Experiments described here were carried out ta evaluate the performances obtained during total substitution of artemia by this diet in Red drum (Sciaenops ocellatus) larval culture. ln 2004 and 2005, four experiments were conducted on feed technology aspects (experimental or industrial manufacturing), weaning strategy (direct or co-feeding) and feed distribution method (prototypes or classical self feeder) in comparison to the standardized method using live preys. At the end of larval phase (day 15) and at day 30, end of nursery phase (0.6 g), survival relative to control (RTC) was respectively 96.9% and 111.0% in the best treatment. Concerning growth, the weight RTC reached at day 15 and day 30 was respectively 82.8% and 72.4%. However, it is important to note that rearing protocols have to be adapted ta the use of these micro pellets in order toprevent degradation of culture quality. These results show that this new product can be applied on industrial scale in private hatcheries. But further research is needed ta evaluate replacement of rotifers by this dried formula in order to completely eliminate live prey in larval culture of Red drum.Dans la plupart des poisons marins élevés, les larves sont nourries avec des proies vivantes (rotifères et/ou artémia) au début de leur développement. Dans les écloseries, la culture de ces proies est consommatrice de main d'oeuvre, nécessite des installations spécifiques et entre pour une part importante dans le coût de production. Par ailleurs, la production mondiale d'artémia est dépendante de la fluctuation des récoltes dans le milieu naturel, ce qui pourrait gêner la filière piscicole marine dans un futur proche. Une formulation alimentaire inerte adaptée aux larves de poisson marin a été mise au point par le centre Ifremer de Brest (France) et est commercialisée par un provendier depuis 1999. Ces microparticules artificielles ont été testée avec succès sur plusieurs poissons tempérés comme le bar européen (Dicentrarchus labrax), la morue atlantique (Gadus morha) ou la daurade européenne (Sparus aurata) dans un contexte de co-feeding (i.e. artémia et aliment inerte). Les expériences décrites ici ont été menées afin d'évaluer les performances obtenues lors de la substitution totale des artémia par cet aliment dans l'élevage larvaire de l'ombrine (Sciaenops ocellatus). En 2004 et 2005, quatre expériences ont été menées sur l'aspect technologie alimentaire (fabrication expérimentale ou industrielle), la stratégie de sevrage (direct ou co-feeding) et le mode de distribution de l'aliment (distributeur classique ou prototypes) en comparaison au standard sur proies vivantes. En fin de phase larvaire (jour 15) et au jour 30 après une phase de prégrossissement (0.6g), la survie par rapport au témoin (RTC) était respectivement de 96.9% et 111 .1% dans le meilleur traitement. Concernant la croissance, les poids obtenus aux jours 15 et 30 atteignaient respectivement 82.8% et 72.4%. Cependant il est important de relever que les protocoles d'élevage doivent être adaptés à l'utilisation de ces microparticules afin de prévenir une dégradation de la qualité d'élevage. Ces résultats montrent que ce nouveau produit peut être appliqué à l'échelle industrielle dans les écloseries privées. Cependant, les recherches doivent être poursuivies pour évaluer les possibilités de remplacement des rotifères par ces aliments inertes afin de s'affranchir complètement de l'utilisation de proies vivantes dans l'élevage larvaire de l'ombrine

A farm-level study of risk factors associated with the colonization of broiler flocks with Campylobacter spp. in Iceland, 2001 – 2004

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Following increased rates of human campylobacteriosis in the late 1990's, and their apparent association with increased consumption of fresh chicken meat, a longitudinal study was conducted in Iceland to identify the means to decrease the frequency of broiler flock colonization with <it>Campylobacter</it>. Our objective in this study was to identify risk factors for flock colonization acting at the broiler farm level.</p> <p>Methods</p> <p>Between May 2001 and September 2004, pooled caecal samples were obtained from 1,425 flocks at slaughter and cultured for <it>Campylobacter</it>. Due to the strong seasonal variation in flock prevalence, analyses were restricted to a subset of 792 flocks raised during the four summer seasons. Flock results were collapsed to the farm level, such that the number of positive flocks and the total number of flocks raised were summed for each farm. Logistic regression models were fitted to the data using automated and manual selection methods. Variables of interest included manure management, water source and treatment, other poultry/livestock on farm, and farm size and management.</p> <p>Results</p> <p>The 792 flocks raised during the summer seasons originated from 83 houses on 33 farms, and of these, 217 (27.4%) tested positive. The median number of flocks per farm was 14, and the median number of positive flocks per farm was three. Three farms did not have any positive flocks. In general, factors associated with an increased risk of <it>Campylobacter </it>were increasing median flock size on the farm (p ≤ 0.001), spreading manure on the farm (p = 0.004 to 0.035), and increasing the number of broiler houses on the farm (p = 0.008 to 0.038). Protective factors included the use of official (municipal) (p = 0.004 to 0.051) or official treated (p = 0.006 to 0.032) water compared to the use of non-official untreated water, storing manure on the farm (p = 0.025 to 0.029), and the presence of other domestic livestock on the farm (p = 0.004 to 0.028).</p> <p>Conclusion</p> <p>Limiting the average flock size, and limiting the number of houses built on new farms, are interventions that require investigation. Water may play a role in the transmission of <it>Campylobacter</it>, therefore the use of official water, and potentially, treating non-official water may reduce the risk of colonization. Manure management practices deserve further attention.</p

Remplacement total des artémia par des microparticules inertes dans l’élevage larvaire de l’ombrine Sciaenops ocellatus en Martinique

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Influence de l'hydrodynamique des bassins sur la survie et la croissance des larves de turbot (Psetta maxima)

Une forte variabilité des performances larvaires est observée chez le turbot. De nombreuses causes ont été étudiées, mais peu de travaux ont été publiés sur l'influence des conditions environnementales. Dans cet article, les effets des conditions hydrodynamiques des milieux d'élevage sur la survie et la croissance de larves nourries jusqu'aux jours 7-10 et de larves non alimentées ont été étudiés. Plusieurs expérimentations ont porté sur l'importance des débits d'eau (600 et 1200 ml.mn-1, constant et progressif), des débits d'air (10 et 30 ml.mn-1) et du sens de circulation de l'eau (descendant et ascendant, avec et sans changement de sens en cours d'élevage). De plus, les interactions possibles du sens de circulation de l'eau avec les conditions d'alimentation des larves ont été étudiées (i) en différant la première distribution alimentaire (à 4 moments différents entre 52 à 76 heures après le stade 95% d'éclos) et (ii) en utilisant deux rations alimentaires (différentes d'un facteur 3). Les résultats montrent que les débits d'eau et d'air influencent fortement la mortalité : une élévation de 25% du débit d'eau et un faible débit d'air ont des effets négatifs durant la période d'alimentation mixte (jours 3-4). Le sens de circulation de l'eau influence la mortalité durant toute la période d'élevage concernée. Un courant ascendant améliore la survie. Ces résultats ont été confortés lorsque des changements de sens de circulation de l'eau ont été pratiqués en cours d'élevage. Ils modifient quasi immédiatement (dans les 8-24 heures) l'évolution des mortalités observées : le passage d'un courant ascendant à un courant descendant entraîne de fortes mortalités et le changement inverse se traduit par une diminution, voire un arrêt de la mortalité. Les conditions d'alimentation testées n'influencent pas la survie larvaire ; elles n'interagissent pas non plus avec le sens de circulation de l'eau sur la survie. Par ailleurs, ni les facteurs influençant l'hydrodynamique dans les bassins, ni le décalage de la première alimentation n'ont d'effet sur la croissance larvaire. Seule l'augmentation de la quantité de proies distribuées permet une augmentation significative de la croissance. En conclusion, l'hydrodynamique dans les bassins a une forte influence sur les survies des larves. Ceci impose, d'un point de vue pratique, un contrôle précis des débits d'eau et d'air. La disponibilité en proies et leur accessibilité pour les larves ne semblent pas devoir être liées aux effets des facteurs hydrodynamiques

Influence de l'hydrodynamique des bassins sur la survie et la croissance des larves de turbot (Psetta maxima)

Une forte variabilité des performances larvaires est observée chez le turbot. De nombreuses causes ont été étudiées, mais peu de travaux ont été publiés sur l'influence des conditions environnementales. Dans cet article, les effets des conditions hydrodynamiques des milieux d'élevage sur la survie et la croissance de larves nourries jusqu'aux jours 7-10 et de larves non alimentées ont été étudiés. Plusieurs expérimentations ont porté sur l'importance des débits d'eau (600 et 1200 ml.mn-1, constant et progressif), des débits d'air (10 et 30 ml.mn-1) et du sens de circulation de l'eau (descendant et ascendant, avec et sans changement de sens en cours d'élevage). De plus, les interactions possibles du sens de circulation de l'eau avec les conditions d'alimentation des larves ont été étudiées (i) en différant la première distribution alimentaire (à 4 moments différents entre 52 à 76 heures après le stade 95% d'éclos) et (ii) en utilisant deux rations alimentaires (différentes d'un facteur 3). Les résultats montrent que les débits d'eau et d'air influencent fortement la mortalité : une élévation de 25% du débit d'eau et un faible débit d'air ont des effets négatifs durant la période d'alimentation mixte (jours 3-4). Le sens de circulation de l'eau influence la mortalité durant toute la période d'élevage concernée. Un courant ascendant améliore la survie. Ces résultats ont été confortés lorsque des changements de sens de circulation de l'eau ont été pratiqués en cours d'élevage. Ils modifient quasi immédiatement (dans les 8-24 heures) l'évolution des mortalités observées : le passage d'un courant ascendant à un courant descendant entraîne de fortes mortalités et le changement inverse se traduit par une diminution, voire un arrêt de la mortalité. Les conditions d'alimentation testées n'influencent pas la survie larvaire ; elles n'interagissent pas non plus avec le sens de circulation de l'eau sur la survie. Par ailleurs, ni les facteurs influençant l'hydrodynamique dans les bassins, ni le décalage de la première alimentation n'ont d'effet sur la croissance larvaire. Seule l'augmentation de la quantité de proies distribuées permet une augmentation significative de la croissance. En conclusion, l'hydrodynamique dans les bassins a une forte influence sur les survies des larves. Ceci impose, d'un point de vue pratique, un contrôle précis des débits d'eau et d'air. La disponibilité en proies et leur accessibilité pour les larves ne semblent pas devoir être liées aux effets des facteurs hydrodynamiques