SADAM : um sistema para aquisição de dados meteorologicos

Orientador: Nelson Castro MachadoDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Ciencia da ComputaçãoResumo: o presente trabalho descreve o projeto e implementação do hardware e do monitor de um sistema para aquisição de dados meteorológicos. O sistema consiste de uma estação base e de uma estação de campo. Na estação base o meteorologista utiliza um microcomputador convencional e dispõe de uma linguagem apropriada para programar seus experimentos. A estação de campo é um sistema dedicado à coleta de dados através de 16 portas para sensores analógicos e/ou digitais. A interface entre as estações base e de campo é realizada por meio de um cartucho de memória RAM CMOS com sistema de "back-up" de bateria, constituindo um sistema não volátil. Inicialmente o cartucho contém o programa do experimento, gravado na estação base. O cartucho é então levado à estação de campo que possui um interpretador e um monitor capazes de executar o experimento programado na estação base, gravando os dados coletados no próprio, cartucho. Após encerrada a coleta dos dados o cartucho é novamente levado à estação base onde os dados são processados e são emitidos relatóriosAbstract: The present work describes the project and implementation of the hardware and monitor for a Meteorological Data Acquisition System. The system consists of a base station and a remote station. In the base station, the meteorologist uses a conventional personal computer with a special purpose language to program his experiments. The remote station is a system dedicated to data collection through 16 ports for analogical and for digital sensors. The interface between the base station and the remote station is accomplished with a RAM CMOS cartridge with a battery back-up system, which constitutes a non-volatile system. Initially the cartridge contains the experiment's program, written at the base station. The cartridge is then brought to the remote station, which has an interpreter and a monitor, able to carry out the experiment programmed in the base station, and to record the collected data in the same cartridge. At the end of the data collection, the cartridge is brought back to the base station, where the data are, processed and reports are generatedMestradoMestre em Ciência da Computaçã

Method for identifying BCR-ABL1-Like pediatric acute lymphoblastic leukemia

Orientador: José Andrés YunesDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaResumo: A Leucemia Linfóide Aguda (LLA) é o tipo de câncer mais comum na infância, correspondendo a cerca de 25% de todos os casos de cânceres e a 80% de todas as leucemias que ocorrem até a idade de 15 anos. Apesar de melhoras no sucesso da terapia para LLA, essa doença ainda é a causa mais comum de morte relacionada a câncer em crianças em todo o mundo. Trata-se de uma doença heterogênea do ponto de vista genético e clínico. Alguns subtipos moleculares de LLA apresentam prognóstico diferenciado e podem ser identificados baseado na presença de determinadas alterações genéticas. Existem seis subtipos moleculares clássicos de LLA B-derivada: t(4;11)(AF4-MLL) ou outros rearranjos em MLL, t(12;21)(ETV6-RUNX1), t(1;19)(TCF3-PBX1), t(9;22)(BCR-ABL1), hipodiplóide e hiperdiplóide. Alguns casos de LLA beneficiam-se de incorporação de novas drogas ou intensificação do tratamento. A LLA portadora da translocação cromossômica t(9;22) (BCR-ABL1), por exemplo, apresenta alto risco de recaída e se beneficia do uso de imatinib. Cerca de dez por cento das LLA pediátricas, embora não tendo a t(9;22), exibem perfil de expressão gênica similar ao da LLA BCR-ABL1 positiva, tendo recebido o nome de LLA "BCR-ABL1-like". É também um subtipo de LLA de maior risco de recaída. O objetivo do presente trabalho consiste em desenvolver um método para a identificação dos casos de LLA do subgrupo BCR-ABL1-like. Para tal foram identificados retrospectivamente, casos de LLA BCR-ABL1-Like do Centro Infantil Boldrini, partindo de dados disponíveis de expressão gênica global para 92 casos consecutivos de LLA B-derivada. Análise LIMMA foi utilizada para determinar uma lista de genes diferencialmente expressos em casos BCR-ABL1-like comparados ao subgrupos "B-others" (casos de LLA não pertencentes a um subgrupo molecular específico). Ensaios de RT-qPCR para os top 25 genes diferencialmente expressos foram feitos e utilizados para identificar casos de BCR-ABL1-like em 96 pacientes LLA B-derivada os quais não pertenciam a nenhum dos seis subtipos clássicos. Casos BCR-ABL1-like putativos foram confirmados associando-os com a presença de outros marcadores moleculares deste subtipo de LLA (SNPs em GATA3, deleções em IKZF1 e presença de transcritos quiméricos) Análise ROC concluiu que um conjunto de 15 genes permitiram a identificação de BCR-ABL1-like via RT-qPCR com uma acurárcia de >0.95.Foi definido um conjunto mínimo de quinze genes cuja expressão diferencial pôde ser usada como classificadora deste subtipo de LLA por PCR quantitativo. Definiu-se um conjunto de primers e sondas TaqMan que possibilitará a detecção da LLA BCR-ABL1-like de forma rotineiraAbstract: Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL) is the most common pediatric cancer, corresponding to about 25% of all cases of cancer and 80% of all leukemia in patients of less than 15 years old. Despite the improvement on the therapy of ALL, this disease is still the most common cause of cancer-related death in young people around the world. ALL is a heterogeneous disease in terms of both genetic and clinical features. Different molecular subtypes can be identified based on the presence of certain genetic alterations. There are six classic molecular subtypes of B-cell precursor ALL (BCP-ALL): t(4;11)(AF4-MLL) or other MLL rearrangements, t(12;21)(ETV6-RUNX1), t(1;19)(TCF3-PBX1), t(9;22)(BCR-ABL1), hypodiploid and hyperdiploid. Some molecular subtypes of ALL were shown to benefit from incorporation of new drugs or treatment intensification. The high risk ALL positive for the t(9;22)(BCR-ABL1) chromosomal translocation , for instance, benefits from the use of imatinib. Ten percent of pediatric ALLs, even without the t(9;22) exhibit a gene expression profile similar to that of positive BCR-ABL1 ALL and have a higher risk of relapse as well; This new high risk ALL subtype was named "BCR-ABL1-like". The aim of this study was to develop a reliable RT-qPCR-based method for the identification of BCR-ABL1-like ALL at diagnosis. We retrospectively identified BCR-ABL1-like cases by multivariate analysis of microarray gene expression data available for 92 consecutive cases of B-cell precursor ALL from the Boldrini Children Hospital. LIMMA analysis was used to determine a list of genes differentially expressed in the BCR-ABL1-like cases when in comparison with "B-other" ALL cases, i.e. ALL cases that do not belong to any other genetic subgroup. RT-qPCR assays for the top 25 differentially expressed genes where designed and used to identify BCR-ABL1-like ALL in a series of 96 cases of BCP-ALL that did not belong to any of the six classical subgroups. Putative BCR-ABL1-like cases were confirmed by identification of known genetic alterations, such as IKZF1 deletions, GATA3 SNPs, and the presence of fusion transcripts. ROC analysis revealed that 15 genes RT-qPCR assays allowed the identification of BCR-ABL1-like cases with an accuracy >0.95. In conclusion, it was developed a RT-qPCR assay of 15 gene markers for the routinely identification of BCR-ABL1-like ALLMestradoGenetica Animal e EvoluçãoMestre em Genética e Biologia Molecular131785/2015-0CNP

Pressure-induced Phase Transitions In Linh4so4

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Raman spectra of LiNH4SO4 in frequency range from 600 to 1200 cm-1 were measured from atmospheric pressure up to a pressure at 82 kbar. Two distinct phases are identified in the ranges below 13 kbar (phase) and above 35 kbar (phase). In the range between 13 and 35 kbar the spectrum changes qualitatively in a continuous manner, both as a function of time for fixed pressure and as a function of pressure when the latter is rapidly changed. The results suggest a dynamical reorientation of the SO4 2- ions taking place in this pressure interval. © 1988 The American Physical Society.37422622265CAPES; Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; CNPq; Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq

SONHOS PRESENTES, CONCRETIZANDO-SE A DISTÂNCIA

O presente artigo apresenta e descreve os desafios inerentes ao processo de oferta do primeiro curso de nível superior na modalidade Educação a Distância (EAD) na Universidade Federal do Espírito Santo (UFES) e a consolidação do Programa Universidade Aberta do Brasil (UAB) nesta Instituição Federal de Educação Superior (IFES). Relata todo o processo de implantação da cultura EAD nesta IFES, desde a autorização pelo MEC para a oferta do curso de pedagogia em EAD, até a sua implementação, bem como os reflexos desse curso nos múltiplos contextos regionais e nas práticas docentes dos sujeitos matriculados nele. Demonstra, ainda, o processo de implementação e de consecução do Curso-piloto de Administração da UAB e a participação da UFES no primeiro Edital da Universidade Aberta do Brasil – UAB

Transições de fase induzidas por pressão em LINH4SO4

Orientador: Vólia Lemos CrivellentiDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Fisica Gleb WataghinResumo: O espectro Raman do LiNH4SO4 foi medido no intervalo de freqüência de 600 a 1200cm-1 desde a pressão atmosférica até P = 82 kbar. Identifica-se duas fases distintas nos intervalos abaixo de 13 kbar (fase-b) e acima de 35 kbar (fase-d) .No intervalo compreendido entre 13 e 35 kbar o espectro muda qualitativamente tanto, como uma função do tempo para uma pressão mantida fixa neste intervalo, como uma função da pressão quando esta é variada rapidamente. Os resultados sugerem uma reorientação dinâmica dos íons SO4 neste intervalo de pressãoAbstract: Raman spectra of LiNH4S04 in the frequency range from 600 to 1200 cm-1 were measured from atmospheric pressure up to P = 82 kbar. Two distinct phases are identified in the ranges below 13 kbar (b-phase) and above 35 kbar (d-phase) .In the range between 13 and 35 kbar the spectrum changes qualitatively in a continuous manner both, as a function of time for fixed pressure or as a function of pressure when the latter is rapidly changed. The results suggest a dynamical reorientation of SO4 ions taking place in this pressure intervalMestradoFísicaMestre em Físic

Muriquis e Onde Habitam: Fatores que interferem na distribuição espacial de grupos sociais na Mata Atlântica fragmentada

RESUMO Em um mundo de paisagens naturais altamente fragmentadas, é conveniente identificar diferentes tipos de comportamento de movimentação animal e como eles contribuem para a compreensão dos processos de dispersão e distribuição de espécies. A demanda por produtos agrícolas cria novos padrões de uso da terra e influencia as taxas de desmatamento, alterando a conectividade entre os habitats, o grau de isolamento e o fluxo genético entre populações, influenciando, portanto, a persistência das espécies na paisagem. Neste contexto, esta tese abordou hipóteses sobre como as características do habitat afetam a distribuição e a movimentação dos muriquis, um primata endêmico criticamente ameaçado, em uma região de Mata Atlântica. Usando dados coletados em campo, teoria dos grafos e modelos espacialmente explícitos baseados no indivíduo, foi possível analisar a resposta populacional de muriquis às variáveis da paisagem, fazer inferências sobre distribuição de grupos sociais, movimentação animal e crescimento populacional e sugerir estratégias de conservação que podem ser implementadas na região. Dados mostram que, de 1970 a 2008, a cobertura florestal aumentou quase três vezes. O número de fragmentos florestais diminuiu mas o tamanho aumentou, refletindo uma regeneração natural que conectou alguns dos fragmentos que se encontravam isolados no passado. O tamanho do fragmento, a conectividade e o crescimento florestal foram identificados como fatores que influenciaram a distribuição de muriquis e a sua persistência na paisagem que, provavelmente, foi assegurada pela regeneração da floresta e pela sua habilidade em explorar florestas secundárias. Dados empíricos mostraram que, em fragmentos florestais isolados, houve uma mudança completa do comportamento esperado de muriquis, que apresenta um padrão onde somente fêmeas dispersam. Pelo menos cinco fêmeas permaneceram em seu grupo natal e se tornaram sexualmente ativas, enquanto outras deixaram o grupo e tornaram-se solitárias. Em fragmentos florestais funcionalmente conectados, o comportamento esperado foi preservado, com dispersão de fêmeas entre grupos. Além disso, foi relatada a fissão de um grupo em dois grupos sociais diferentes, em que o menor migrou para outro fragmento cruzando uma estrada e uma plantação de eucalipto. O modelo MPSG (Muriqui Population Spread and Growth), desenvolvido para simular o comportamento de movimentação dos muriquis pela paisagem, utilizou dados de dinâmica populacional como um regulador dos eventos de migração. A simulação resultou em um aumento populacional médio de 2,4 vezes nos próximos 50 anos, com a migração das fêmeas desempenhando um papel importante nesse crescimento populacional. Entretanto, mais de 60% das fêmeas provavelmente não terão sucesso em encontrar um parceiro reprodutivo porque a dispersão pode levá-las a fragmentos sem grupos sociais de muriquis. Verificou-se que, para espécies que apresentam processo de dispersão como os muriquis, a conectividade pode ser tão importante quanto o tamanho do habitat. Para fins de conservação, propomos incrementar a conectividade entre os fragmentos florestais, estabelecer um corredor protegido de biodiversidade e translocar fêmeas jovens para outros grupos sociais da mesma região. Este estudo demonstra a importância de análises históricas da paisagem para compreender o potencial de recuperação de populações de espécies ameaçadas de extinção. Modelos que estimam o comportamento de indivíduos, incluindo informações espaciais e populacionais, podem ser uma poderosa ferramenta para entender como as características da paisagem no passado moldaram a distribuição das espécies no presente e projetar a persistência dessa espécie no futuro. Palavras-chave: Brachyteles hypoxanthus; conectividade de habitat; heterogeneidade da paisagem; regeneração florestal; dispersão; modelos baseados no indivíduo