PT Symmetry of the non-Hermitian XX Spin-Chain: Non-local Bulk Interaction from Complex Boundary Fields

The XX spin-chain with non-Hermitian diagonal boundary conditions is shown to be quasi-Hermitian for special values of the boundary parameters. This is proved by explicit construction of a new inner product employing a "quasi-fermion" algebra in momentum space where creation and annihilation operators are not related via Hermitian conjugation. For a special example, when the boundary fields lie on the imaginary axis, we show the spectral equivalence of the quasi-Hermitian XX spin-chain with a non-local fermion model, where long range hopping of the particles occurs as the non-Hermitian boundary fields increase in strength. The corresponding Hamiltonian interpolates between the open XX and the quantum group invariant XXZ model at the free fermion point. For an even number of sites the former is known to be related to a CFT with central charge c=1, while the latter has been connected to a logarithmic CFT with central charge c=-2. We discuss the underlying algebraic structures and show that for an odd number of sites the superalgebra symmetry U(gl(1|1)) can be extended from the unit circle along the imaginary axis. We relate the vanishing of one of its central elements to the appearance of Jordan blocks in the Hamiltonian.Comment: 37 pages, 5 figure

Pyroséquençage pour le développement d'EST et de SNP aviaires

Le but du programme est de combler les déficits en marqueurs observés pour trois espèces aviaires : la caille, le canard et la poule. La stratégie choisie est l'obtention, à partir de plusieurs individus de lignées d'intérêt, de SNP (Single Nucleotide Polymorphism, polymorphisme d'un nucléotide) par une nouvelle technologie de séquençage à haut débit (séquenceur 454 GS-FLX, Roche). Nous séquençons des représentations réduites du génome, en sélectionnant d'une part des fragments de restriction d'ADN génomique - les mêmes chez tous les individus - et d'autre part les transcrits qui représentent globalement la partie du génome correspondant aux gènes exprimés. Ces expérimentations sont réalisées à partir d'échantillons d'ADN ou d'ARN issus d'individus de lignées à l'origine de croisements existants, pour chacune des trois espèces. Les données générées par plusieurs "runs" de séquence seront traitées in silico : contigage à haut débit, recherche de SNP, comparaison avec les banques de séquences connues...En plus de l'intérêt que représente la production d'un très grand nombre de SNP nouveaux, cette technologie devrait permettre de mieux séquencer les régions riches en (G+C) correspondant aux plus petits des microchromosomes pour lesquels il n'y a pas de séquence chez la poule. La comparaison des séquences des transcrits obtenues chez la caille et le canard avec la séquence du génome de la poule permettra d'établir une "cartographie virtuelle" des SNP obtenus, grâce à la grande conservation de synténie existant entre ces trois espèces

Divergence et convergence au sein du « club européen »

URL des Cahiers : https://halshs.archives-ouvertes.fr/CAHIERS-MSECahiers de la MSE 2000.42 - Série Blanche - ISSN : 1624-0340This paper analyses the evolution of income inequalities among "Western Europeans" (Western Europe and European offshoots : USA, Canada, Chile, Argentina, Australia and New Zealand) since 1820 and the incidence of this evolution on the distribution of income among world citizens. From 1820 to 1870-90, inequality among Europeans increased for two reasons : larger inequalities among citizens in each country and a divergence processus between countries. But internal inequalities and inequality between "European" countries decreased since 1890 or 1910. The incidence of this evolution on world income distribution was largely unequalizing during the XIXth century, but neutral afterwards : the equalizing effect of reduced inequality among Western Europeans was set off because the rate of growth of GDP per capita in European countries and their offshoots was higher than the average economic growth in the other countries.Ce document traite de l'évolution des inégalités de revenu à l'intérieur du "club européen" (l'Europe occidentale, les Etats-Unis, le canada, le Chili, l'Argentine, l'Australie et la Nouvelle-Zélande) depuis 1820 et de l'impact de cette évolution sur la distribution mondiale des revenus. De 1820 à 1870-90 les inégalités ont augmenté à la fois à l'intérieur de chaque pays et entre pays puis les unes et les autres ont diminué. L'impact de cette évolution sur la distribution mondiale a été fortement inégalitaire au XIXe siècle, mais neutre depuis parce que l'effet égalitaire de la réduction des inégalités à l'intérieur du club a été compensé par l'effet inégalitaire d'une croissance du revenu moyen dans les pays du club plus rapide que la croissance du revenu moyen du reste du monde

Cloning of cDNA encoding the nuclear form of chicken sterol response element binding protein-2 (SREBP-2), chromosomal localization, and tissue expression of chicken SREBP-1 and -2 genes

International audienc

Cloning of cDNA encoding the nuclear form of chicken sterol response element binding protein-2 (SREBP-2), chromosomal localization, and tissue expression of chicken SREBP-1 and -2 genes

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Génomique des canards

La démocratisation des outils de la génomique et plus particulièrement du séquençage à haut débit a permis le séquençage du génome du canard commun. Des projets complémentaires sont déjà initiés pour prolonger et exploiter au mieux ces premiers acquis. En tout premier lieu, il s’agit de poursuivre la description de la structure du génome et d’en exploiter les connaissances : cartes d’hybrides irradiés pour ordonner la séquence le long des chromosomes ; génomique comparée avec le génome de la poule pour bénéficier des connaissances sur ce génome modèle ; recherche de SNP (Single Nucleotide Polymorphism) pour les études et la gestion de populations ; carte génétique pour la détection des QTL (Quantitative Trait Locus). La première détection de QTL influençant les performances du mulard, réalisée à l’aide de marqueurs microsatellites chez la cane commune, sera complétée par une seconde étude utilisant des marqueurs SNP développés spécifiquement et permettant une bien meilleure couverture du génome. Par ailleurs, il est important de réaliser une annotation fonctionnelle du génome, ce qui peut être abordé par le séquençage de transcrits. A terme, le génome annoté sera utilisé pour analyser son expression dans différents tissus et/ou conditions d’élevage, la connaissance des modèles de transcrits et de protéines facilitant les études en transcriptomique et protéomique. Le canard mulard, produit du croisement de la cane commune avec le canard de Barbarie, devra également être étudié en raison de son intérêt agronomique, lié à ses performances exceptionnelles dans la filière des palmipèdes gras.As DNA sequencing throughputs increase and genomics becomes commonplace, more and more animal species are studied. Thus, the duck genome sequence was published recently. However, although this is an important step and will drastically increase our knowledge on the biology of this species, complementary projects are needed. Some have been initiated, amongst which SNP (Single Nucleotide Polymorphism) detection for population studies and management, radiation hybrid maps for ordering the sequence along chromosomes, genetic maps for QTL (Quantitative Trait Locus) detection and transcript sequencing for structural and functional annotation. The first QTL detection for traits influencing the performances of the mule duck, performed using microsatellite markers in the common duck, will be completed by a second study using specifically designed SNP, allowing for an improved coverage of the genome. Transcript and protein models constructed from the sequences will facilitate proteomics and transcriptomics studies. The mule duck, the product of a cross between the common duck and the Muscovy duck, has an important agronomic interest for the foie gras industry and will also have to be studied

Recherche de manifestations épigénétiques chez la poule

"Chantier qualité spécifique "Auteurs Externes" département de Génétique animale : uniquement liaison auteur au référentiel HR-Access "National audienc

Development of polymorphic markers in quail by next generation sequencing

Session : Exploiting Genomics to Dissect the Genetic Control of Complex TraitsSession : Exploiting Genomics to Dissect the Genetic Control of Complex TraitsMolecular genetic analyses in quail will benefi t greatly from a higher density ofgenetic markers. We chose therefore to obtain high numbers of SNP (Single NucleotidePolymorphism) by high-throughput sequencing (Titanium 454 GS-FLX, Roche) of twomain types of reduced representations of the genome: restriction digested fractionsof genomic DNA and EST (Expressed Sequence Tag), representing the expressedgenes. The genomic fractions were generated as AFLP (Amplifi ed Fragment LengthPolymorphism) fragments and the expressed ones by preparing cDNA libraries fromtwo tissues: embryo and brain. To optimize the information content of the SNPdetected for subsequent analyses, libraries were prepared from individuals selectedin the two lines involved in a QTL cross and each individual in the AFLP librarywas tagged. Sequencing runs produced 399,189 sequence reads from cDNA, and1,107,451 from genomic fragments, covering over 433 Mb of sequence in totaland allowing the detection of 17,400 putative SNP. Further analyses using the tagsinformation will allow the estimation of heterozygozity in the F1 males.Besides the interest of the production of a large number of new SNP, thistechnology should allow to sequence GC rich regions corresponding to the smallestmicrochromosomes for which there is no or few sequence in chicken. The comparisonof the quail sequences with the chicken genome assembly will allow a virtualmapping of the SNP obtained, based on the high synteny conservation betweenthese two avian species

Development of polymorphic markers in quail by next generation sequencing

Session : Exploiting Genomics to Dissect the Genetic Control of Complex TraitsMolecular genetic analyses in quail will benefi t greatly from a higher density ofgenetic markers. We chose therefore to obtain high numbers of SNP (Single NucleotidePolymorphism) by high-throughput sequencing (Titanium 454 GS-FLX, Roche) of twomain types of reduced representations of the genome: restriction digested fractionsof genomic DNA and EST (Expressed Sequence Tag), representing the expressedgenes. The genomic fractions were generated as AFLP (Amplifi ed Fragment LengthPolymorphism) fragments and the expressed ones by preparing cDNA libraries fromtwo tissues: embryo and brain. To optimize the information content of the SNPdetected for subsequent analyses, libraries were prepared from individuals selectedin the two lines involved in a QTL cross and each individual in the AFLP librarywas tagged. Sequencing runs produced 399,189 sequence reads from cDNA, and1,107,451 from genomic fragments, covering over 433 Mb of sequence in totaland allowing the detection of 17,400 putative SNP. Further analyses using the tagsinformation will allow the estimation of heterozygozity in the F1 males.Besides the interest of the production of a large number of new SNP, thistechnology should allow to sequence GC rich regions corresponding to the smallestmicrochromosomes for which there is no or few sequence in chicken. The comparisonof the quail sequences with the chicken genome assembly will allow a virtualmapping of the SNP obtained, based on the high synteny conservation betweenthese two avian species