Assessment of genetic variation for the LINE-1 retrotransposon from next generation sequence data

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>In humans, copies of the Long Interspersed Nuclear Element 1 (LINE-1) retrotransposon comprise 21% of the reference genome, and have been shown to modulate expression and produce novel splice isoforms of transcripts from genes that span or neighbor the LINE-1 insertion site.</p> <p>Results</p> <p>In this work, newly released pilot data from the 1000 Genomes Project is analyzed to detect previously unreported full length insertions of the retrotransposon LINE-1. By direct analysis of the sequence data, we have identified 22 previously unreported LINE-1 insertion sites within the sequence data reported for a mother/father/daughter trio.</p> <p>Conclusions</p> <p>It is demonstrated here that next generation sequencing data, as well as emerging high quality datasets from individual genome projects allow us to assess the amount of heterogeneity with respect to the LINE-1 retrotransposon amongst humans, and provide us with a wealth of testable hypotheses as to the impact that this diversity may have on the health of individuals and populations.</p

DISEÑO, CONSTRUCCIÓN Y VALIDACIÓN DEL PROTOTIPO DE UNA MÁQUINA PARA ENSAYOS DE RESISTENCIA DE MATERIALES

Este trabajo presenta el diseño, construcción y validación del prototipo de una máquina universal de ensayos. Estudiando las diferentes alternativas para el tipo de accionamiento y de estructura que presentan las máquinas universales de ensayos. Se realizó un diseño del prototipo teniendo en cuenta la información encontrada en artículos académicos, catálogos comerciales, libros y, las designaciones de las normas ASTM para la realización de ensayos de tensión, compresión y flexión a tres puntos. También se presenta la selección y diseño de los elementos que conforman la estructura de la máquina, teniendo en cuenta la capacidad de esta, como barras, vigas, placas, y mordazas para el ensayo de tensión, de igual manera se seleccionaron los elementos que conforman el sistema de accionamiento. Se aplicaron los procesos de manufactura requeridos para la construcción y ensamble de las partes. Por último se realizó la validación del equipo mediante la comparación de datos obtenidos entre una máquina universal de ensayos calibrada y la construida. El prototipo construido cuenta con una estructura doble espacio y accionamiento hidráulico, con capacidad de 100 kN, permite realizar ensayos de tensión, compresión y flexión a tres puntos. Se encontró que el porcentaje de error relativo entre los resultados del prototipo y la máquina universal fue menor al 2 % y mediante la prueba estadística t-student, se verificó que no existen diferencias estadísticamente significativas entre las dos máquinas

Modelação e simulação baseadas em agentes como alternativa para o estudo das organizações empresariais

Introduction: The article arises from the research Agent-based modeling and simulation as an alternative for the study of business organizations, conducted during 2016 at the Universidad Distrital Francisco José de Caldas, Bogotá. The authors summarize the most outstanding literature published on the modeling and simulation of complex systems throughout history, particularly agent-based models, in order to form an opinion on their possible contributions to management research. Method: We analyzed the information collected from scientific articles in ProQuest and Scopus databases from 1990 to date, including key concepts of modeling and simulation, based on agents described in some books. Results: Traditional approaches, characterized by the use of statistics and classical mathematics, are not relevant to model organizations because of their deterministic and reductionist view. Therefore, an alternative approach is presented for the study of organizations that are found in the modeling and simulation techniques of the sciences of complexity, whose purpose is to study systems characterized by emerging behaviors. Conclusions: Despite its low popularity, the implementation of these alternatives cannot only benefit organizations, but can also contribute to the creation of guidelines for greater appropriation of simulation models for organizations.Introducción: el artículo es producto de la investigación “Modelación y simulación basada en agentes como alternativa para el estudio de las organizaciones empresariales”, desarrollada durante el 2016 en la Universidad Distrital Francisco José de Caldas, en Bogotá. Los autores sintetizan la literatura más sobresaliente publicada sobre la modelación y simulación de sistemas complejos a través de la historia, en particular de los modelos basados en agentes, con el fin de desarrollar una apreciación de sus posibles contribuciones a la investigación en administración. Metodología: se analiza la información recolectada por medio de los artículos científicos obtenidos de las bases de datos ProQuest y Scopus desde 1990 hasta la fecha, con la inclusión de conceptos claves de modelación y simulación, basadas en agentes descritos en algunos libros. Resultados: los enfoques tradicionales, caracterizados por el uso de la estadística y la matemática clásica no son pertinentes para modelar organizaciones por su visión determinista y reduccionista, por lo cual se presenta un enfoque alternativo para el estudio de las organizaciones que se encuentra en las técnicas de modelación y simulación desde las ciencias de la complejidad, cuyo fin es estudiar sistemas caracterizados por comportamientos emergentes. Conclusiones: a pesar de su baja popularidad, la implementación de estas alternativas no solo puede beneficiar a las organizaciones, sino que puede aportar en la construcción de lineamientos para una mayor apropiación de modelos de simulación para organizaciones.Introdução: este artigo é produto da pesquisa “Modelação e simulação baseadas em agentes como alternativa para o estudo das organizações empresariais”, desenvolvido em 2016 na Universidad Distrital Francisco José de Caldas, em Bogotá. Os autores sintetizam a literatura mais destacada publicada sobre modelação e simulação de sistemas complexos através da história, em particular dos modelos baseados em agentes, a fim de desenvolver uma apreciação de suas possíveis contribuições para a pesquisa em administração. Metodologia: analisa-se a informação coletada por meio dos artigos científicos obtidos das bases de dados ProQuest e Scopus desde 1990 até os dias atuais, com a inclusão de conceitos-chave de modelação e simulação baseadas em agentes descritos em alguns livros. Resultados: as abordagens tradicionais, caracterizadas pelo uso da estatística e da matemática clássica, não são pertinentes para modelar organizações por sua visão determinista e reducionista; portanto, apresenta-se uma abordagem alternativa para o estudo das organizações que se encontra nas técnicas de modelação e simulação desde as ciências da complexidade, cujo fim é estudar sistemas caracterizados por comportamentos emergentes. Conclusões: apesar de sua baixa popularidade, a implantação dessas alternativas não somente pode beneficiar as organizações, mas sim pode contribuir para a construção de lineamentos para uma maior apropriação de modelos de simulação para organizações

Caracterización preliminar del enzima polifenol oxidasa en frutas tropicales: implicaciones en su proceso de industrialización

En este trabajo se hace una caracterización preliminar del enzima Polifenol Oxidasa (PPO), responsable del deterioro nutricional de Physalis peruviana L (uchuva) y Solanum hirtum X Solanum quitoense (lulo), frutas de alto potencial en mercados internacionales. Para ello, se evalúan la cinética de reacción de un extracto enzimático concentrado y la capacidad inhibitoria de compuestos obtenidos a partir de fuentes naturales. Las diferencias entre los PPO del extracto enzimático de lulo y uchuva, con valores de velocidad de reacción de 1,32x10- 4±1,15x10-51 y 9,83x10-3 ±1,49x10-4 respectivamente, podrían estar relacionadas con una mayor cantidad del enzima en lulo. Por otra parte se hace un análisis del porcentaje de inhibición y una medición de absorbancia a punto final, para determinar no solo la capacidad inhibitoria sino también tener una aproximación a la duración de su efecto en el tiempo

Régimen alimentario de siete especies ícticas en el embalse de la hidroeléctrica Urrá (Córdoba, Colombia)

El objeto del estudio fue evaluar el régimen alimentario de siete especies de peces que se han establecido en el embalse de la Hidroeléctrica Urrá (HU). Se analizaron 453 estómagos, distribuidos así: 115 de perico (Tracheolypterus badeli cf), 111 de cacucho (Panaque gibbosus), 108 de yalúa (Cyphocharax magdalenae), 89 de mojarra amarilla (Caquetaia kraussii) , 11 de moncholo (Hoplias malabaricus), 10 de barbul ( Pimelodus clarias) y 9 de doncella ( Ageneoisus pardales) . Los contenidos estomacales se evaluaron mediante frecuencia de ocurrencia (FO), frecuencia numérica (FN) y el método gravimétrico (G). Se determinó la importancia de cada presa mediante el índice de categorización de presa (ICP) y la superposición de dietas se analizó mediante el Índice de Morosita (IM). La distribución porcentual de los contenidos estomacales de la yalúa mostró que el 95.5% correspondió al ítem detritus y el restante 4.5% a microlagas (Clorofitas y Bacillariofitas) y protozoarios/rotíferos. La dieta del cacucho la conformaron en un 70.9% microalgas (Cianofitas, Clorofitas y Bacilariofitas) y protozoarios/rotíferos y el restante 29.1% correspondieron al ítem detritus. Barbul (FO = 50%, FN = 46.2%) y perico se alimentaron principalmente de insectos (FO = 73.9%, FN = 86.4%). La mojarra amarilla (FO = 87.1%, FN = 83.3%), doncella (FO = 92.3%, FN = 92.0%) y moncholo (FO = 90.9%, FN = 90.9%) prefieren peces como cachanita ( Roeboides dayi ) y sardinas ( Astianax sp). Los resultados sugieren que yalúa es detritívoro iliófago, cacucho es detritívoro, perico y barbul son carnívoros insectívoros y doncella, moncholo y mojarra amarilla son carnívoros piscívoros

Commonality and variation in mental representations of music revealed by a cross-cultural comparison of rhythm priors in 15 countries

Music is present in every known society but varies from place to place. What, if anything, is universal to music cognition? We measured a signature of mental representations of rhythm in 39 participant groups in 15 countries, spanning urban societies and Indigenous populations. Listeners reproduced random ‘seed’ rhythms; their reproductions were fed back as the stimulus (as in the game of ‘telephone’), such that their biases (the prior) could be estimated from the distribution of reproductions. Every tested group showed a sparse prior with peaks at integer-ratio rhythms. However, the importance of different integer ratios varied across groups, often reflecting local musical practices. Our results suggest a common feature of music cognition: discrete rhythm ‘categories’ at small-integer ratios. These discrete representations plausibly stabilize musical systems in the face of cultural transmission but interact with culture-specific traditions to yield the diversity that is evident when mental representations are probed across many cultures

Prototipo de incubadora neonatal

Las incubadoras neonatales proporcionan un entorno controlado para recién nacidos que necesitan cuidados especiales. Este prototipo ha sido diseñado para cubrir las necesidades mínimas en los hospitales, de modo que el personal médico pueda controlar el entorno del neonato. Este artículo reporta el diseño y construcción de un prototipo que incluyó una investigación con el fin de seleccionar y construir los elementos del prototipo: chasis, cúpula, portacolchón y una fuente de poder. Dentro de la incubadora se dispusieron sensores de temperatura, luminosidad, ruido, humedad y una alarma de apertura de la puerta; todos con el fin de garantizar el buen estado de salud del neonato. Con estos elementos, se pudo obtener un prototipo funcional, que se convierte en un primer paso para el desarrollo de incubadoras neonatales con tecnología apropiada.Newborn and premature infants incubators provide a controlled environment for infants which need special care. The constructed prototype has the potential to cover the minimal needs in a hospital, in a way that medical staff may control the newborn environment. This article reports the design and construction of the prototype included research for selecting and building the elements of the prototype: the chassis, hood, mattress case, and a power source. Different transducers were included in the incubator for measuring temperature, luminosity, noise, humidity, and a door alarm. The purpose of these was to guaranty the proper conditions for the newborn.The constructed prototype is fully functional and constitutes a first step for building newborn incubators with appropriated technology