Outbreak of acute gastroenteritis in an air force base in Western Greece

BACKGROUND: On the 20(th )September 2005, soldiers and staff at the Air Force base in Western Greece experienced an outbreak of acute gastroenteritis. The purpose of this study was to identify the agent and the source of the outbreak in order to develop control measures and to avoid similar outbreaks in the future. METHODS: A case-control analytical approach was employed with 100 randomly selected cases and 66 controls. Patients completed standardized questionnaires, odds ratios were calculated and statistical significance was determined using χ(2 )test. In addition, to identify the source of the infection, we performed bacteriological examination of food samples (included raw beef, cooked minced meat, grated cheese and grated cheese in sealed package) collected from the cuisine of the military unit. RESULTS: More than 600 out of the 1,050 individuals who ate lunch that day, became ill. The overall attack rate, as the military doctor of the unit estimated it, was at least 60%. The overall odds ratio of gastroenteritis among those who had lunch was 370 (95% CI: 48–7700) as compared to those who didn't eat lunch. Among the symptoms the most prominent were watery diarrhoea (96%) and abdominal pain (73%). The mean incubation period was 9 h and the median duration of the symptoms was 21 h. In the bacteriological examination, Staphylococcus aureus was detected in a sample of raw beef (2,000 cfu per g) and in two samples of grated cheese; leftover cheese from lunch (7,800 cfu per g) and an unopened package purchased from the market (3,000 cfu per g). CONCLUSION: The findings of this study suggest that the aetiological agent of this outbreak was S. aureus. The food vehicle was the grated cheese, which was mixed with the beef and served for lunch in the military unit. This outbreak highlights the capacity of enterotoxin-producing bacteria to cause short term, moderately-severe illness in a young and healthy population. It underscores the need for proper food handling practices and reinforces the public health importance of timely notification of such outbreaks

Sample treatment for tissue proteomics in cancer, toxicology, and forensics

Since the birth of proteomics science in the 1990, the number of applications and of sample preparation methods has grown exponentially, making a huge contribution to the knowledge in life science disciplines. Continuous improvements in the sample treatment strategies unlock and reveal the fine details of disease mechanisms, drug potency, and toxicity as well as enable new disciplines to be investigated such as forensic science. This chapter will cover the most recent developments in sample preparation strategies for tissue proteomics in three areas, namely, cancer, toxicology, and forensics, thus also demonstrating breath of application within the domain of health and well-being, pharmaceuticals, and secure societies. In particular, in the area of cancer (human tumor biomarkers), the most efficient and multi-informative proteomic strategies will be covered in relation to the subsequent application of matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry imaging (MALDI-MSI) and liquid extraction surface analysis (LESA), due to their ability to provide molecular localization of tumor biomarkers albeit with different spatial resolution. With respect to toxicology, methodologies applied in toxicoproteomics will be illustrated with examples from its use in two important areas: the study of drug-induced liver injury (DILI) and studies of effects of chemical and environmental insults on skin, i.e., the effects of irritants, sensitizers, and ionizing radiation. Within this chapter, mainly tissue proteomics sample preparation methods for LC-MS/MS analysis will be discussed as (i) the use of LC-MS/MS is majorly represented in the research efforts of the bioanalytical community in this area and (ii) LC-MS/MS still is the gold standard for quantification studies. Finally, the use of proteomics will also be discussed in forensic science with respect to the information that can be recovered from blood and fingerprint evidence which are commonly encountered at the scene of the crime. The application of proteomic strategies for the analysis of blood and fingerprints is novel and proteomic preparation methods will be reported in relation to the subsequent use of mass spectrometry without any hyphenation. While generally yielding more information, hyphenated methods are often more laborious and time-consuming; since forensic investigations need quick turnaround, without compromising validity of the information, the prospect to develop methods for the application of quick forensic mass spectrometry techniques such as MALDI-MS (in imaging or profiling mode) is of great interest

Registration of foodborne infections and intoxications in the Netherlands at the Food and Consumer Product Safety Authority and the Centre for Infectious Disease Control, 2012

In 2012 zijn meer mensen ziek geworden van een voedselinfectie of -vergiftiging dan in voorgaande jaren. In totaal zijn 276 uitbraken geregistreerd bij de NVWA en het RIVM, waardoor 2607 mensen ziek zijn geworden. Daarnaast zijn 273 individuele gevallen gemeld. De toename kwam vooral doordat er in 2012 meerdere grote uitbraken van voedselinfecties of -vergiftigingen waren. De grootste en meest opvallende uitbraak was de landelijke uitbraak van Salmonella Thompson (1149 gerapporteerde zieken), die was veroorzaakt door het eten van besmette gerookte zalm. Dit blijkt uit een analyse door het RIVM van de registratiecijfers van voedselinfecties en -vergiftigingen bij de NVWA en het Centrum Infectieziektenbestrijding (CIb) van het RIVM over 2012. Beide instanties registreren voedselinfecties en -vergiftigingen om inzicht te krijgen in de besmette bronnen en de aard van de ziekteverwekkers; de cijfers overlappen gedeeltelijk. De genoemde getallen zijn echter een onderschatting van het werkelijke aantal voedselinfecties en -vergiftigingen, omdat niet iedere zieke naar de huisarts gaat of de NVWA informeert. Naar schatting zijn jaarlijks 680.000 mensen in Nederland ziek door het eten van besmet voedsel. Net als in voorgaande jaren zijn de bacteriën Campylobacter en Salmonella en het norovirus de belangrijkste verwekkers van uitbraken van voedselinfecties. De impact van Salmonella- en norovirus-uitbraken is groter dan die van Campylobacter, aangezien er meestal meer mensen ziek worden van één besmettingsbron met Salmonella of het norovirus. Daarnaast zijn de gevolgen van een Salmonella-besmetting vaak heviger: vrijwel alle gemelde ziekenhuisopnamen die verband hielden met een voedselinfectie waren het gevolg van een Salmonella-infectie (in 2012 79 van de 82), evenals de vier gemelde overledenen. Goede hygiëne en de juiste voorschriften volgen tijdens de productie en bereiding van voedsel zijn maatregelen die in hoge mate beschermen tegen voedselinfecties. Voorbeelden zijn risicovolle producten voldoende verhitten en kruisbesmetting voorkomen, zoals rauwe kip niet in aanraking laten komen met rauw te eten producten. Aandacht voor kennis over en uitvoering van dergelijk gedrag blijft belangrijk. Dit geldt zowel voor de overheid, voedselproducenten, voedselleveranciers, horeca als de consumenten. De NVWA kreeg in 2012 527 meldingen over voedselinfecties binnen, tegenover 363 meldingen in 2011. Nadat het aantal enkele jaren was afgenomen, steeg het hiermee tot het niveau van 2008-2009. Het aantal gerelateerde zieken dat bij de NVWA werd gemeld, was 2776 (in 2011 waren dat er 889). Het aantal meldingen van voedselinfecties bij de GGD, die aan het Centrum voor Infectieziektenbestrijding van het RIVM worden gerapporteerd, bleef gelijk: 43 meldingen, met 1652 zieken.In 2012, the number of cases with a foodborne infection was higher compared to previous years. A total of 276 outbreaks with 2607 patients and 273 single cases of foodborne infections and intoxications were registered from the the Dutch Food and Consumer Product Safety Authority (NVWA) and the regional health services. The increase was caused by several large outbreaks of foodborne infections in 2012. The largest outbreak that came to the attention of the public was the Salmonella Thompson (1149 reported cases) caused by contaminated smoked salmon. These are the main conclusions of an analysis made by the National Institute for Public Health and the Environment (RIVM) based on the 2012 registration data from the NVWA and the Centre for Infectious Disease Control (CIb). Both institutes register foodborne infections and intoxications to gain insight in sources of contamination and pathogens; the figures partially overlap. However, these figures are probably an underestimation, as not all infected patients visit their GP or inform the NVWA. In the Netherlands, an estimated 680,000 patients occur as a result of contaminated food. Just as in previous years, Campylobacter, Salmonella and norovirus were the most commonly occurring causative agents of foodborne outbreaks. However, the impact of Salmonella outbreaks and norovirus outbreaks is bigger than that of Campylobacter, as these pathogens cause more cases per outbreak. Furthermore, cases of a Salmonella infection are also more likely to be severe; almost all hospitalizations related to foodborne infections (in 2012: 79 of 82) and all four reported deaths were found to be caused by Salmonella infections. Examples of crucial steps in the prevention of foodborne infections are good hygiene and proper handling during food production and preparation. Adequate heating of risky products and preventing cross-contamination are instances of this. Therefore, continuous attention should be paid to food safety issues by the government, producers, suppliers, food handlers, and consumers. In 2012, the NVWA received 527 reports about foodborne infections compared with 363 reports in 2011. After a decrease in the intervening years, it increased to the level it had been in 2008-2009. The number of cases reported to the NVWA was 2776 patients compared with 889 in 2011. The number of reports made by the regional health services has remained fairly stable: 43 reports, involving 1652 patients.Nederlandse Voedsel en Warenautoritei

Records of food-related outbreaks in the Netherlands, 2020

Mensen kunnen ziek worden van voedsel. Als twee of meer mensen tegelijk ziek worden na het eten van hetzelfde voedsel, wordt dat een uitbraak door een voedselgerelateerde ziekteverwekker genoemd. In 2020 zijn 559 uitbraken met 1907 zieken gemeld. Dit zijn er duidelijk minder dan in 2018 (756 uitbraken met 2805 zieken) en 2019 (735 uitbraken met 3058 zieken). Dat komt vooral door de uitbraak van het coronavirus en de maatregelen om de verspreiding ervan te verminderen, zoals handen wassen. Het norovirus, Salmonella en Campylobacter veroorzaakten in 2020 nog steeds de meeste uitbraken en ziekte, maar in totaal dus wel veel minder dan in de jaren ervoor. De cijfers komen van de Nederlandse Voedsel- en Warenautoriteit (NVWA) en de GGD’en. Zij registreren en onderzoeken voedselgerelateerde infecties en vergiftigingen om te voorkomen dat meer mensen ziek worden. Daartoe proberen ze vanuit hun eigen werkveld te achterhalen waar mensen besmet zijn geraakt en door welke ziekteverwekker. De NVWA onderzoekt welke ziekteverwekkers in voedsel kunnen zitten, waar het voedsel vandaan komt, en de plaats waar het is bereid of verkocht. De GGD richt zich op de personen die hebben blootgestaan aan besmet voedsel en probeert via hen te achterhalen waar ze zijn besmet. Het RIVM voegt de meldingen van de twee instanties samen en analyseert ze als één geheel. Deze aanpak geeft inzichten in oorzaken van voedselgerelateerde uitbraken in Nederland, de mate waarin ze voorkomen en mogelijke veranderingen hierin door de jaren heen. De genoemde getallen zijn een onderschatting van het werkelijke aantal voedselgerelateerde uitbraken en zieken. Dit komt onder andere doordat niet elke zieke naar de huisarts gaat of de NVWA informeert. Ook is niet altijd duidelijk of besmet voedsel de oorzaak van een ziekte is.Food can make people ill. If two or more persons become ill at the same time after eating the same food, this is called a ‘food-related outbreak’. In 2020, 559 outbreaks, affecting 1907 people, were reported. This is clearly less than in 2018 (756 outbreaks affecting 2805 people) and in 2019 (735 outbreaks affecting 3058 people). This decrease is primarily due to the outbreak of the coronavirus and the measures taken to reduce its spread, such as washing one’s hands. The norovirus, Salmonella and Campylobacter are still the cause of most outbreaks, but at a much lower level in 2020 than in previous years. These figures come from the Netherlands Food and Consumer Product Safety Authority (NVWA) and the municipal public health services (GGDs). These institutions record and investigate food-related infections and food poisoning to prevent more persons from becoming ill. For that purpose, based on their own field of work, they attempt to determine where people were infected and by which pathogen. The NVWA investigates which pathogens may be present in food, the source of the food, and where the food is prepared or sold. The GGDs focus on people who have been exposed to contaminated food, trying to determine the possible sources of contamination via these persons. RIVM combines the figures from the two institutions and analyses them as a single whole. This approach provides insight into the causal factors of food-related outbreaks in the Netherlands, how often they occur and any changes and trends in this over the years. The figures given are an underestimate of the actual number of food-related outbreaks and people affected. This is because, among other things, people who are ill do not always visit their general practitioner (GP) or notify the NVWA. It is furthermore not always clear whether contaminated food is the cause of an illness.NVW

Registering food-related outbreaks in the Netherlands, 2022

Food can make people ill. If two or more people fall ill at the same time after eating the same food, it is called a food-related pathogen outbreak. In 2022, a total of 1,165 outbreaks were reported, with 4,470 people falling ill. In 2021, there were 838 reports with 3,517 people falling ill. Since 2016 (594 reports with 2,731 people falling ill), the number of reports has doubled. The cause of the reported outbreak is often unknown. This is because it is not always clear which food product may have been contaminated, or because no pathogen is found. It is known that the norovirus and the Salmonella and Campylobacter bacteria were still the most commonly identified causes of outbreaks in 2022, as they were in previous years. However, for the third year in a row there were far fewer outbreaks of the norovirus than in the years prior. This is because testing for this virus is less common nowadays. The information on food-related outbreaks comes from the Netherlands Food and Consumer Product Safety Authority (NVWA) and the Municipal Public Health Services (GGDs). They register and investigate food-related infections and poisoning. To this end, they each use their specific expertise to try to find out where people have become infected and by which pathogen. The NVWA examines the place where the food was prepared or sold, or where the food came from. It commissions Wageningen Food Safety Research (WFSR) to examine whether the food contains pathogens. The GGDs focus on the people who may have contracted an infection from food and try to find out through them what caused them to become infected. The aim of this approach is to prevent more cases of illness by removing the product from the market, or by taking measures to prevent a repeat incident. RIVM combines the reports from the two institutions and analyses them as a whole. This approach provides insights into the causes of food-related outbreaks in the Netherlands, the extent to which they occur and possible changes over the years. The figures given are an underestimate of the actual number of food-related outbreaks and the number of people falling ill as a result. This is because not everyone who falls ill visits a doctor or informs the NVWA. It is also not always clear whether contaminated food was the cause of an illness.Mensen kunnen ziek worden van voedsel. Als twee of meer mensen tegelijk ziek worden na het eten van hetzelfde voedsel, dan heet dat een uitbraak door een voedselgerelateerde ziekteverwekker. In 2022 zijn 1.165 uitbraken met 4.470 zieken gemeld; in 2021 waren er 838 meldingen en 3.517 zieken. Het aantal meldingen is daarmee sinds 2016 (594 meldingen met 2.731 zieken) verdubbeld. Vaak is de oorzaak van de gemelde uitbraken niet bekend. Dat komt omdat niet altijd duidelijk is welk voedselproduct besmet kan zijn geweest of omdat er geen ziekteverwekker wordt gevonden. Bekend is dat het norovirus, Salmonella en Campylobacter in 2022, net als in eerdere jaren, nog steeds het meest zijn aangetoond als oorzaak van een uitbraak. Wel zijn er voor het derde jaar achter elkaar veel minder uitbraken van het norovirus gezien dan in de jaren ervoor. Dit komt omdat er tegenwoordig minder snel op dit virus wordt getest. De informatie over deze uitbraken komt van de Nederlandse Voedsel- en Warenautoriteit (NVWA(Nederlandse Voedsel- en Warenautoriteit)) en de GGD(Gemeentelijke Gezondheidsdienst)’en. Zij registreren en onderzoeken voedselgerelateerde infecties en vergiftigingen. Daartoe proberen ze vanuit hun eigen werkveld te achterhalen waar mensen besmet zijn geraakt en door welke ziekteverwekker. De NVWA onderzoekt de plaats waar het voedsel is bereid of verkocht of waar het voedsel vandaan komt. Zij laat bij Wageningen Food Safety Research (WFSR(Wageningen Food Safety Research )) onderzoeken of daar ziekteverwekkers in zitten. De GGD richt zich op de personen die mogelijk via voedsel een infectie hebben opgelopen en probeert via hen te achterhalen waardoor ze zijn besmet. Het doel van deze werkwijze is meer zieken te voorkomen door het product uit de handel te halen, of maatregelen te nemen om herhaling te voorkomen. Het RIVM voegt de meldingen van de twee instanties samen en analyseert ze als één geheel. Deze aanpak geeft inzichten in oorzaken van voedselgerelateerde uitbraken in Nederland, de mate waarin ze voorkomen en mogelijke veranderingen hierin door de jaren heen. De genoemde getallen zijn een onderschatting van het werkelijke aantal voedselgerelateerde uitbraken en zieken. Dit komt onder andere doordat niet elke zieke naar de huisarts gaat of de NVWA informeert. Ook is niet altijd duidelijk of besmet voedsel de oorzaak van een ziekte is geweest

Registratie voedselgerelateerde uitbraken in Nederland, 2021

Mensen kunnen ziek worden van voedsel. Als twee of meer mensen tegelijk ziek worden na het eten van hetzelfde voedsel, wordt dat een uitbraak door een voedselgerelateerde ziekteverwekker genoemd. In 2021 zijn 838 uitbraken met 3.517 zieken gemeld. Dit zijn er duidelijk meer dan in 2020 (559 uitbraken met 1.907 zieken), en ook meer dan in 2018 en 2019 (735-756 uitbraken met 2.805-3.058 zieken). Het norovirus, Salmonella en Campylobacter veroorzaakten in 2021 nog steeds de meeste gemelde uitbraken en ziekte. Wel was dat voor norovirus voor het tweede jaar achter elkaar veel minder vaak dan in de jaren ervoor. De cijfers komen van de Nederlandse Voedsel- en Warenautoriteit ( NVWA (Nederlandse Voedsel- en Warenautoriteit)) en de GGD (Gemeentelijke Gezondheidsdienst)’en. Zij registreren en onderzoeken voedselgerelateerde infecties en vergiftigingen. Daartoe proberen ze vanuit hun eigen werkveld te achterhalen waar mensen besmet zijn geraakt en door welke ziekteverwekker. De NVWA onderzoekt de plaats waar het voedsel is bereid of verkocht of waar het voedsel vandaan komt. Zij laat bij Wageningen Food Safety Research ( WFSR (Wageningen Foodsafety Research )) onderzoeken of daar ziekteverwekkers in zitten. De GGD richt zich op de personen die mogelijk via voedsel een infectie hebben opgelopen en probeert via hen te achterhalen waardoor ze zijn besmet. Het doel van deze werkwijze is meer zieken te voorkomen door het product uit de handel te halen, of maatregelen te nemen om herhaling te voorkomen. Het RIVM voegt de meldingen van de twee instanties samen en analyseert ze als één geheel. Deze aanpak geeft inzichten in oorzaken van voedselgerelateerde uitbraken in Nederland, de mate waarin ze voorkomen en mogelijke veranderingen hierin door de jaren heen. De genoemde getallen zijn een onderschatting van het werkelijke aantal voedselgerelateerde uitbraken en zieken. Dit komt onder andere doordat niet elke zieke naar de huisarts gaat of de NVWA informeert. Ook is niet altijd duidelijk of besmet voedsel de oorzaak van een ziekte is geweest