CONTROL OF LOW-RESOLUTION SCANNING OF OVARIAN TUMOR STROMAL COMPARTMENT

The active search for markers of prognostic impact and therapeutic response is of crucial importance in oncology. The amount of stroma is a potential indicator with a significant impact on tumor growth. To solve the problems linked to tumor heterogeneity and, hence, of quantization at the microscopic level, we developed an image-analysis strategy dedicated to estimating the proportion of tumor connective tissue in whole histological sections at low resolution. 2,700-dot-per-inch numerical images were acquired with a calibrated slide scanner and automatically analyzed. We performed a quality control in order to evaluate the efficiency of the proposed method of analysis at the selected resolution. The point-counting method and the interactive drawing of stroma limits on equivalent mosaic microscopic images were "the gold standards." The proportions of stroma estimated on microscopic images (magnification with a 4× objective corresponding to 16,200 dots per inch) and on slide scanner images (2,700 dots per inch) through point counting stereology or manual delineation were equivalent (p &lt; 0.0001). The results obtained through automatic image processing of scanner images were also close to the gold standard (95% correlation, p &lt; 0.0001). The proposed method makes it possible to estimate the stroma amount of ovarian carcinomas in whole histological sections with a simple, fast, and low-cost acquisition device.</jats:p

Dessillement numérique : énaction, interprétation, connaissances

International audienceCet essai présente la recherche chemin faisant de deux auteurs de disciplines différentes : linguistique et reconnaissance de formes. Il tisse leur réflexion à partir d'un questionnement commun : qu'est ce qu'interpréter ? Comment s'approprier des connaissances à partir de documents ? Le numérique peut-il y aider ? En s'appuyant sur plusieurs projets de recherche, les auteurs conçoivent une plateforme informatique qui donne le rôle principal à la créativité de l'utilisateur. Adossé à la sémantique textuelle et à l'approche énactive, cet ouvrage tente un dessillement qui prenne le contre-pied des évidences ontologiques. Il rejette une vision réductionniste de l'humain issue du computationalisme et d'une approche managériale de la révolution numérique. Pour penser les interactions usager-plateforme, il articule la phénoménologie dans sa dimension sémiotique à l'herméneutique philologique appliquée à un corpus juridique. La question du sens et de son advenue sous-tend ce travail qui participe des sciences de la culture et ainsi s'ouvre à une réflexion éthique et politique comme le souligne François Rastier dans la préface

Contributions à la découverte des stratégies d'écriture d'élèves de scolarité primaire

L'objet de cet article est celui de présenter une étude longitudinale qui assure une aide au suivi d'élèves typique en scolarité primaire. Nous proposons une méthode pour la découverte de groupes d'élèves partageant les mêmes stratégies1 d'écriture tout au long de leur scolarité primaire. Acquis à partir des tests d'écritures et de dessin, nos données sont représentées par un modèle graphique probabiliste, les "réseaux bayésiens". La structure du réseau étant partiellement déterminée par des connaissances a priori des experts. Une stratégie d'écriture est représentée dans le réseau par une variable cachée. Nous considérons d'abord que chacun des tests d'écritures est représenté par une stratégie locale et qu'il existe une stratégie globale qui agit sur chacune des stratégies locales. Nous construisons ainsi un modèle Globale Hierarchie (GH), ensuite nous utilisons l'inférence bayésien comme un outil de classification automatique pour pouvoir lier les stratégies locales aux stratégies globales et modéliser la causalité (ou la dépendance) entre variables et stratégie donnée. Il ressort (découle) de l'inférence que dans chaque test, deux stratégies locales regroupant 86% de la population, puis nous redécouvrons ces deux stratégies locales dans deux stratégies globales(Glob1 et Glob4), ces derniers correspondent à des élèves normo-scripteurs (NS) et normo-scripteurs plus avancés (NSA). De point de vu longitudinal, la distribution des élèves par niveau scolaire des stratégies d'écriture globales (NS et NSA) est constante pour les trois périodes d'acquisitions, de même la probabilité transition entre NS et NSA est encore constante au cours du temps. Enfin les enfants passent graduellement de G1 a G4 par niveau scolaire.The aim of this study is to bring a contribution to the realization of the evolution follow-up in writing among typical pupils in primary education. For this purpose, we have developed a software for the acquisition of handwritten tracings and the automatic extraction of features from these tracings. Distributed on three periods of about six months each, the acquisitions have therefore been achieved three times for the same pupils in the same experimental conditions, these tracings being acquired online by means of a digitizer. An unsupervised classification is first applied on a set of dynamic features chosen by an expert in the field of child's development psychology; strong forms are thus selected as steady clusters from the obtained partitions. With this unsupervised approach, we have thus discovered three strategies: a first one which is performant in control and global planning, a second one labeled local in control and planning, and a third one which is an unstable intermediary strategy. Next we modeled our problem by means of a probabilistic graphical model (bayesian network) in which the writing strategy is represented by a hidden variable. We build a global hierarchical model in order to link local and global strategies and model the probabilistic dependance between variables and strategies. Our hierarchical model, learnt with real data, enables us to discover two global strategies that correspond to normo-writer pupils and more advanced normo-writers. These two strategies are consistent: the distribution of typical pupils by school level is constant over time, and the probability of transition between (or within) these strategies is also constant over time.ROUEN-BU Sciences Madrillet (765752101) / SudocROUEN-BU Sciences (764512102) / SudocSudocFranceF

Le numérique : quelle histoire ! Digital: what a story!

International audienceBref historique de la révolution technologique en cours dans le domaine des réseaux informatiques. Ce que cela offre comme opportunités dans le monde documentaire ; Une nouvelle lecture savante et une bibliothèque mondiale partagée.Une révolution des usages et un bouleversement culturel

ETUDE DES STRATEGIES DE TRI (APPLICATION A UN SYSTEME DE TRI FORMULAIRES)

S'INSCRIVANT DANS LE DOMAINE DE LA RECONNAISSANCE DE FORMES, CETTE THESE TRAITE PLUS PARTICULIEREMENT DU TRI DE FORMULAIRES. L'APPLICATION CIBLE CONSISTE A IDENTIFIER AU SEIN D'UN FLUX DE DOCUMENTS CEUX QUI CORRESPONDENT A DES TYPES CONNUS DU SYSTEME. IL S'AGIT DONC D'UNE PART DE RECONNAITRE LES DOCUMENTS APPRIS ET D'AUTRE PART DE REJETER LES DOCUMENTS NON APPRIS. L'ETUDE DES TECHNIQUES DE RECONNAISSANCE DE FORME NOUS CONDUIT DANS UN PREMIER TEMPS A FAIRE UNE DISTINCTION ENTRE CLASSIFICATION ET TRI. LA SPECIFICITE DU TRI EST DUE A L'APPARITION IMPLICITE DE FORMES N'APPARTENANT PAS A UNE CLASSE CONNUE ET DEVANT DONC ETRE REJETEES. CECI NOUS AMENE A REDEFINIR LES CRITERES D'EVALUATION DES PERFORMANCES D'UN SYSTEME DE TRI. PAR LA SUITE, NOUS DECRIVONS PLUS PRECISEMENT L'APPLICATION DE TRAITEMENT DES COURRIERS D'UN ORGANISME DE GESTION DES PRESTATIONS FAMILIALES. EN TENANT COMPTE DES CONTRAINTES DU SYSTEME, NOUS PROPOSONS DIFFERENTES REALISATIONS D'UN MODULE DE TRI. CHACUNE DES SOLUTIONS CONSIDERE QUE LE TRI PEUT ETRE DECOMPOSE EN UNE PHASE DE CLASSEMENT SUIVIE D'UNE PHASE DE VALIDATION. NEANMOINS ELLES DIFFERENT PAR LES INFORMATIONS UTILISEES A CHACUNE DES ETAPES. AINSI, CERTAINES DES SOLUTIONS ENVISAGEES UTILISENT LES MEMES INFORMATIONS POUR LE CLASSEMENT ET LE REJET ALORS QUE D'AUTRES UTILISENT DES METRIQUES OU DES INFORMATIONS DIFFERENTES. ENSUITE, AU VU DES RESULTATS OBTENUS PAR LES DIFFERENTES SOLUTIONS, NOUS NOUS ORIENTONS VERS UNE REALISATION BASEE SUR LA COMBINAISON DE CLASSIFIEURS. NEANMOINS, L'ETUDE DES METHODES DE COMBINAISON NOUS CONDUIT A LES ADAPTER AU PROBLEME DU TRI, NOTAMMENT DANS LA GESTION DU REJET. NOUS COMPLETONS CETTE ETUDE EN PRESENTANT QUELQUES RESULTATS D'UNE EXPERIENCE DE SUIVI DU REGARD RELATIVE A DES SUJETS HUMAINS EN SITUATION DE TRI DE FORMULAIRES. L'ETUDE DES DONNEES OCULOMETRIQUES NOUS PERMET D'APPREHENDER LA NATURE DES INFORMATIONS CAPTUREES LORS DE L'APPRENTISSAGE ET LA RECONNAISSANCE DES IMAGES.CAEN-BU Sciences et STAPS (141182103) / SudocTOURS-Polytech'Informat.Product. (372612209) / SudocSudocFranceF

OPTIMISATION DES SYSTEMES DISTRIBUES TEMPS REEL EMBARQUES (APPLICATION AU PROTOTYPAGE RAPIDE D'UN VEHICULE ELECTRIQUE AUTONOME)

ROUEN-BU Sciences (764512102) / SudocROUEN-BU Sciences Madrillet (765752101) / SudocSudocFranceF

Classification supervisée et semi-supervisée : contributions à la classification d images et de documents

Cette thèse propose des contributions à la problématiques de la classification supervisée et semi-supervisée des images de documents sous des contraintes telles qu un faible nombre d exemples d apprentissage, la sélection dynamique de caractéristiques pertinentes et le temps de classification. Le premier chapitre dresse une introduction générale de la problématique en exposant les composants d une chaîne de traitement des images de document. Le second chapitre propose une stratégie de classification supervisée basée sur les notions de point de vue dans plusieurs espaces caractéristiques et d espace de distances induit. Le troisième chapitre propose une méthode de classification semi-supervisée se basant sur une collaboration entre les dendogrammes obtenus par classification ascendante hiérarchique à partir de plusieurs espaces de caractéristiques. Enfin, le dernier chapitre dresse une conclusion et ouvre des perspectives pour la poursuite de ce travail.This manuscript proposes some contributions to the supervised and semi-supervised document image classification under contraints such as a low number of training samples, dynamic feature selection and classification time. The first chapter draws up a general introduction of problems by exposing the components of a document image processing system. The second chapter proposes a strategy for the supervised classification based on the concepts from point of view in several feature spaces and induced distance space. The third chapter proposes a method for the semi-supervised classification based on a collaboration between the dendogrammes obtained by ascending hierarchical clustering using several feature spaces. Lastly, the last chapter draws up a conclusion and opens on prospects for the continuation for this work.ROUEN-BU Sciences (764512102) / SudocROUEN-BU Sciences Madrillet (765752101) / SudocSudocFranceF

Dessillement numérique : énaction, interprétation, connaissances

International audienceCet essai présente la recherche chemin faisant de deux auteurs de disciplines différentes : linguistique et reconnaissance de formes. Il tisse leur réflexion à partir d'un questionnement commun : qu'est ce qu'interpréter ? Comment s'approprier des connaissances à partir de documents ? Le numérique peut-il y aider ? En s'appuyant sur plusieurs projets de recherche, les auteurs conçoivent une plateforme informatique qui donne le rôle principal à la créativité de l'utilisateur. Adossé à la sémantique textuelle et à l'approche énactive, cet ouvrage tente un dessillement qui prenne le contre-pied des évidences ontologiques. Il rejette une vision réductionniste de l'humain issue du computationalisme et d'une approche managériale de la révolution numérique. Pour penser les interactions usager-plateforme, il articule la phénoménologie dans sa dimension sémiotique à l'herméneutique philologique appliquée à un corpus juridique. La question du sens et de son advenue sous-tend ce travail qui participe des sciences de la culture et ainsi s'ouvre à une réflexion éthique et politique comme le souligne François Rastier dans la préface

Le numérique : quelle histoire ! Digital: what a story!

International audienceBref historique de la révolution technologique en cours dans le domaine des réseaux informatiques. Ce que cela offre comme opportunités dans le monde documentaire ; Une nouvelle lecture savante et une bibliothèque mondiale partagée.Une révolution des usages et un bouleversement culturel

Questionnement sur le couplage énactif comme dualité sémiotique

Cet article abordera la problématique sujet-monde commune à de nombreux champs scientifiques, sous l''angle d''une réflexion sur le contexte comme lieu du couplage entre un sujet et son environnement et d''appariement temporaire entre contenu et expression. La difficulté essentielle est alors d’expliciter le régime de rationalité des interactions entre des grandeurs de natures différentes : matérielles-immatérielles, corps-esprit. C’est pourquoi nous approfondirons ici le concept de dualité, source de nombreuses mésinterprétations. Nous tenterons un parallèle avec les processus à l’oeuvre lors du couplage énactif. Nous concevons un environnement numérique de travail ENT centré utilisateur apte à éprouver cette posture.</jats:p