fMRI activation detection with EEG priors

The purpose of brain mapping techniques is to advance the understanding of the relationship between structure and function in the human brain in so-called activation studies. In this work, an advanced statistical model for combining functional magnetic resonance imaging (fMRI) and electroencephalography (EEG) recordings is developed to fuse complementary information about the location of neuronal activity. More precisely, a new Bayesian method is proposed for enhancing fMRI activation detection by the use of EEG-based spatial prior information in stimulus based experimental paradigms. I.e., we model and analyse stimulus influence by a spatial Bayesian variable selection scheme, and extend existing high-dimensional regression methods by incorporating prior information on binary selection indicators via a latent probit regression with either a spatially-varying or constant EEG effect. Spatially-varying effects are regularized by intrinsic Markov random field priors. Inference is based on a full Bayesian Markov Chain Monte Carlo (MCMC) approach. Whether the proposed algorithm is able to increase the sensitivity of mere fMRI models is examined in both a real-world application and a simulation study. We observed, that carefully selected EEG--prior information additionally increases sensitivity in activation regions that have been distorted by a low signal-to-noise ratio

EAPC task force on education for psychologists in palliative care

It is argued that psychological aspects of care and psychosocial problems are essential components of palliative care. However, the provision of appropriate services remains somewhat arbitrary. Unlike medical and nursing care, which are clearly delivered by doctors and nurses respectively, psychological and psychosocial support in palliative care are not assigned exclusively to psychologists. It is generally expected that all professionals working in palliative care should have some knowledge of the psychological dynamics in terminal illness, as well as skills in communication and psychological risk assessment. On the one hand, palliative care education programmes for nurses and doctors comprise a considerable amount of psychological and psychosocial content. On the other hand, only a few palliative care associations provide explicit information on the role and tasks of psychologists in palliative care. Psychologists’ associations do not deal much with this issue either. If they refer to it at all, it is in the context of the care of the aged, end-of-life care or how to deal with grief

Presentation of Web API Data in Windows 8 Application

Cílem této bakalářské práce je návrh a implementace Windows 8 aplikace pro prezentaci dat z webového API. Přenesená data jsou pro uživatele citlivá a je zde kladen důraz na autorizaci a bezpečnost. Data jsou zobrazována v reálném čase. Práce obsahuje popis možností vývoje aplikace pro architekturu WinRT, komunikaci aplikace s webovým API, autorizaci a zabezpečení přenášených i offline dat. Byla vytvořena aplikace typu dashboard, která zobrazuje data z různých finančních kategorií. Pro zobrazení byly využity základní grafické komponenty, přičemž některé jsou obohaceny o animace.The aim of this bachelor's thesis is to design and implement a Windows 8 application that can provide data from web API. Transferred data are sensitive for the user with an emphasis for authorization and security. Data is displayed in real time. The thesis decribes possibilities for development of the application for WinRT architecture, communication of the application with web API, authorization and security of transffered and offline data. The application of dashboard type was created that display data from various financial categories. For the visualization basic graphic components were used, some of them includes animations.

A numerical algorithm for the explicit calculation of SU(N) and SL(N,C) Clebsch-Gordan coefficients

We present an algorithm for the explicit numerical calculation of SU(N) and SL(N,C) Clebsch-Gordan coefficients, based on the Gelfand-Tsetlin pattern calculus. Our algorithm is well-suited for numerical implementation; we include a computer code in an appendix. Our exposition presumes only familiarity with the representation theory of SU(2).Comment: 35 pages, 3 figures, 5 table

Untersuchungen zu der Entstehung und der Bedeutung löslicher Fragmente der neuralen Zelladhäsionsmoleküle NCAM und L1 im Zentralen Nervensystem der Maus

Zahlreiche Transmembranproteine existieren auch als lösliche Fragmente, die durch regulierte Prozessierung der extrazellulären Domäne dieser Moleküle entstehen. Auch für die Zelladhäsionsmoleküle NCAM und L1, die in zahlreiche essentielle Funktionen des sich entwickelnden sowie adulten Nervensystems involviert sind, wurde das Vorkommen löslicher Fragmente bestätigt. Die Entstehung löslicher Fragmente des Zelladhäsionsmoleküls NCAM mit einem Molekulargewicht von 110 kDa - 190 kDa konnte bisher nur partiell aufgeklärt werden. Im Rahmen dieser Arbeit wurde die Hypothese bestätigt, dass lösliche Fragmente des Moleküls NCAM durch regulierte Prozessierung der extrazellulären Domäne entstehen. Die Metalloprotease ADAM17 / TACE ist in der Lage, die membranständigen Isoformen NCAM140 und NCAM180 in der Nähe des Membranankers zu spalten und in Abhängigkeit des Glykosylierungsmusters des Proteins, Fragmente mit einem Molekulargewicht von 110 kDa und größer von der Membran zu lösen. Die Spaltung der extrazellulären Domäne des GPI-verankerten NCAM120 basiert dagegen auf einem anderen Mechanismus. Der Metalloproteaseinhibitor GM 6001 zeigt einen inhibitorischen Effekt auf die Freisetzung von löslichen NCAM-Fragmenten. Der darüber hinaus negative Effekt des Metalloproteaseinhibitors auf das NCAM-abhängige Neuritenwachstum, weist auf eine bedeutende funktionelle Rolle der regulierten Prozessierung des Proteins NCAM hin, die unter anderem durch Modulationen des Aktinzytoskeletts reguliert wird. Auch der Calmodulininhibitor CGS 9343 B, der die Freisetzung löslicher NCAM-Fragmente stimuliert, zeigt einen inhibitorischen Effekt auf den Prozess des NCAM-vermittelten Neuritenwachstums. Ob der durch Calmodulin vermittelte Einfluss auf das NCAMabhängige Neuritenwachstum auf einer direkten Interaktion mit seinem Bindungspartner NCAM basiert, bleibt zu klären. Zusätzlich zu der membrangebundenen 200 kDa Form des L1-Moleküls können auch lösliche L1-Fragmente nachgewiesen werden, die durch regulierte Prozessierung der extrazellulären Domäne des Moleküls entstehen. Im Rahmen dieser Arbeit konnte gezeigt werden, dass an der Spaltung des Moleküls L1 in der dritten Fibronektindomäne und der Freisetzung des löslichen Fragmentes L1-140 die Prohormonkonvertase PC5A beteiligt ist. Eine Beteiligung der Prohormonkonvertasen Furin, PC1, PC2, PACE4 und PC7 an der Prozessierung von L1 kann ausgeschlossen werden. Das Fragment L1-140 ist im Hippocampus, jedoch nicht im Kleinhirn nachweisbar, was basierend auf dem Expressionsmuster der Konvertase PC5A die Verantwortlichkeit der Protease für die Prozessierung von L1 bestätigt. Das Fragment L1-140 verbleibt nach seiner Entstehung durch die Ausbildung eines Heterodimers mit einem membranständigen L1-200 membranassoziiert und wird erst durch die Spaltung seines „Interaktionspartners“ von der Membran gelöst. Dies führt zu einer Dissoziation des Komplexes und zu der Freisetzung der löslichen Fragmente L1-180 und L1-140. Für die Spaltung der extrazellulären Domäne des Moleküls L1 in der Nähe des Membranankers, die durch den Kalziumsensor Calmodulin negativ beeinflusst wird, ist eine Metalloprotease verantwortlich. Der Einfluss des Metalloproteaseinhibitors GM 6001 auf das L1-vermittelte Neuritenwachstum weist auf eine bedeutende Rolle des Ectodomain Sheddings des Moleküls für das L1-vermittelte Neuritenwachstum hin. Im Rahmen dieser Studie wurden darüber hinaus weitere lösliche Fragmente des Moleküls L1 nachgewiesen, die auf zusätzliche Schnittstellen in der extrazellulären Domäne von L1 hinweisen. Die Metalloprotease MMP9 scheint an der Prozessierung und Freisetzung dieser Fragmente beteiligt zu sein. Zahlreiche Transmembranproteine werden zusätzlich zu einer Proteolyse der extrazellulären Domäne in ihrer Transmembrandomäne gespalten. Die Voraussetzung für diesen Prozess ist die Abspaltung der extrazellulären Domäne eines Moleküls durch regulierte Prozessierung eines Proteins in der Nähe des Membranankers. Im Rahmen dieser Arbeit wurde gezeigt, dass ein lösliches L1-Fragment von 15 kDa durch eine Spaltung in der Transmembrandomäne von der Plasmamembran gelöst und in den Zellkern transportiert wird. Die Funktion des zytoplasmatischen L1-Fragmentes im Zellkern und eine mögliche Beteiligung an der Regulation der Transkription von Genen sind Fragen, die zu klären bleiben

Cosmological parameter inference from galaxy clustering: the effect of the posterior distribution of the power spectrum

Citation: Kalus, B., Percival, W. J., & Samushia, L. (2016). YCosmological parameter inference from galaxy clustering: the effect of the posterior distribution of the power spectrum. Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, 455(3), 2573-2581. doi:10.1093/mnras/stv2307We consider the shape of the posterior distribution to be used when fitting cosmological models to power spectra measured from galaxy surveys. At very large scales, Gaussian posterior distributions in the power do not approximate the posterior distribution P-R we expect for a Gaussian density field delta(k), even if we vary the covariance matrix according to the model to be tested. We compare alternative posterior distributions with P-R, both mode-by-mode and in terms of expected measurements of primordial non-Gaussianity parametrized by f(NL). Marginalising over a Gaussian posterior distribution P-f with fixed covariance matrix yields a posterior mean value of f(NL) which, for a data set with the characteristics of Euclid, will be underestimated by Delta f(NL) = 0.4, while for the data release 9 of the Sloan Digital Sky Survey-III Baryon Oscillation Spectroscopic Survey (BOSS DR9; Ahn et al.) it will be underestimated by Delta f(NL) = 19.1. Adopting a different form of the posterior function means that we do not necessarily require a different covariance matrix for each model to be tested: this dependence is absorbed into the functional form of the posterior. Thus, the computational burden of analysis is significantly reduced