Entre l'excepcionalitat i la informalitat: apunts per a un urbanisme postbombolla

Segons els autors l’esclat de la bombolla immobiliària ha tallat en sec la lògica de la plusvàlua que ha governat l’urbanisme fins ara. Aquest fet ha produït dos tipus de respostes que no solucionen pas els problemes derivats de la crisi: la resposta institucional basada en la promoció de megaprojectes (Eurovegas, BCNWorld, etc.), i l’urbanisme autogestionat (pràctiques urbanístiques de microtransformacions, de recuperació temporal d’espais, etc.). Les solucions que plantegen els autors passen per considerar l’urbanisme com a instrument polític, com a eina per al canvi social. Un urbanisme que ha de ser multidisciplinar i col·laboratiu i que gestioni (indivisiblement) tant l’urbanització i l’edificació del sòl, com els canvis del seu valor que la planificació genera.Según los autores del estallido de la burbuja inmobiliaria ha cortado en seco la lógica de la plusvalía que ha gobernado el urbanismo hasta ahora. Este hecho ha producido dos tipos de respuestas que no solucionan los problemas derivados de la crisis: la respuesta institucional basada en la promoción de megaproyectos (Eurovegas, BCNWorld, etc.), Y el urbanismo autogestionado (prácticas urbanísticas de microtransformaciones, de recuperación temporal de espacios, etc.). Las soluciones que plantean los autores pasan por considerar el urbanismo como instrumento político, como herramienta para el cambio social. Un urbanismo que debe ser multidisciplinar y colaborativo y que gestione (indivisiblemente) tanto la urbanización y la edificación del suelo, como los cambios de su valor que la planificación genera

1000 Genomes Selection Browser 1.0: A genome browser dedicated to signatures of natural selection in modern humans

This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Non-Commercial License (http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/), which permits non-commercial re-use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.Searching for Darwinian selection in natural populations has been the focus of a multitude of studies over the last decades. Here we present the 1000 Genomes Selection Browser 1.0 (http://hsb.upf.edu) as a resource for signatures of recent natural selection in modern humans. We have implemented and applied a large number of neutrality tests as well as summary statistics informative for the action of selection such as Tajima's D, CLR, Fay and Wu's H, Fu and Li's F* and D*, XPEHH, ΔiHH, iHS, FST, ΔDAF and XPCLR among others to low coverage sequencing data from the 1000 genomes project (Phase 1; release April 2012). We have implemented a publicly available genome-wide browser to communicate the results from three different populations of West African, Northern European and East Asian ancestry (YRI, CEU, CHB). Information is provided in UCSC-style format to facilitate the integration with the rich UCSC browser tracks and an access page is provided with instructions and for convenient visualization. We believe that this expandable resource will facilitate the interpretation of signals of selection on different temporal, geographical and genomic scales. © 2013 The Author(s). Published by Oxford University Press.Ministerio de Ciencia y Tecnología (Spain); Direcció General de Recerca, Generalitat de Catalunya (Grup de Recerca Consolidat 2009 SGR 1101); Subprogram BMC [BFU2010-19443 awarded to J.B.]; Post-doctoral scholarship from the Volkswagenstiftung [Az: I/85 198 to J.E.]; Spanish government [BFU-2008-01046; SAF2011-29239]; The Spanish government FPI scholarships [BES-2009-017731 and BES-2011-04502 to G.M.D. and M.P., respectively]; PhD fellowship from ‘Acción Estratégica de Salud, en el marco del Plan Nacional de Investigación Científica, Desarrollo e Innovación Tecnológica 2008-2011’ from Instituto de Salud Carlos III (to P.L.). Funding for open access charge: Prof. Jaume Bertranpetit.Peer Reviewe

Desenvolupament de problemes virtuals i interactius per a l'aprenentatge de la microbiologia

El web Microbiologia Interactiva promou l'aprenentatge de la Microbiologia a través de la resolució de problemes teòrics i pràctics. El material s'ha dissenyat per ser utilitzat a les classes presencials i també com a eina d'autoaprenentatge. La innovació més destacada és la integració dels aspectes teòrics i dels pràctics, gràcies al fet que, a més de continguts teòrics, el web inclou un laboratori virtual de Microbiologia on es poden realitzar diverses tècniques bàsiques de Microbiologia obtenint una simulació de resultats. El web va adreçat a estudiants que entren en contacte per primera vegada amb el món invisible dels microorganismes, és a dir a estudiants de primer o segon curs d'una titulació universitària que inclogui aquesta matèria. La implementació d'un prototip d'aquesta nova eina s'efectua de forma pilot durant el curs acadèmic 2007-2008 a les assignatures de Microbiologia (titulació de Biologia) i de Microbiologia I (titulació de Biotecnologia). L'avaluació que s'ha fet en aquest primer semestre mostra una molt bona acceptació per part dels estudiants així com del professorat que l'ha implementat. En aquesta avaluació s'han identificat determinades disfuncions del web, que ja han estat corregides en la versió final, la qual s'ha simplificat i conté diferents recursos d'ajuda. Aquesta eina, que es considera única, servirà de base per al desenvolupament de futurs webs que tractin de l'aprenentatge de la Microbiologia a un nivell més avançat.La web Microbiología Interactiva promueve el aprendizaje de la Microbiología a través de la resolución de problemas teóricos y/o prácticos. El material se ha diseñado para ser utilizado en las clases presenciales y también como herramienta de autoaprendizaje. La innovación más destacada es la integración de los aspectos teóricos y prácticos, gracias a que, además de contenidos teóricos, la web incluye un laboratorio virtual de microbiología donde se pueden realizar diversas técnicas básicas de Microbiología obteniendo una simulación de resultados. La web se dirige a estudiantes que entran en contacto por primera vez con el mundo invisible de los microorganismos, es decir, a estudiantes de primer o segundo curso de una titulación universitaria que incluya esta materia. La implementación de un prototipo de esta nueva herramienta se ha efectuado durante el curso académico 2007-2008 en las asignaturas de Microbiología (titulación de Biología) y de Microbiología I (titulación de Biotecnología). La evaluación que se ha hecho en este primer semestre muestra una muy buena aceptación por parte delos estudiantes, así como del profesorado que lo ha implementado. En esta evaluación se han identificado algunas disfunciones de la web, que ya se han corregido en la versión final, que se ha simplificado y contiene diversos recursos de ayuda. Esta herramienta, que se considera única, servirá de base para el desarrollo de futuras webs que se ocupen del aprendizaje de la Microbiología a un nivel más avanzado.The Interactive Microbiology website promotes the learning of microbiology by resolving theoretical and/or practical problems. The material was designed to be used in the classroom, as well as for independent learning. The most noteworthy innovation is the integration of the theoretical and practical aspects, thanks to the fact that in addition to theoretical contents the website also includes a virtual microbiology laboratory where students can practice a variety of basic microbiology techniques with a simulation of the results. The website is targeted to students who are entering into contact with the invisible world of micro-organisms for the first time, that is, to students in their first or second year of the university degree programme that covers this material. A prototype of this new tool was implemented as a pilot during academic year2007-08 in the Microbiology course (Biology degree programme) and the Microbiology I course (Biotechnology degree programme). The evaluations from this first term show a high degree of acceptance by both the students and the professors who have implemented it. This evaluation also identified certain dysfunctions of the website which have already been corrected in the final version, which was also simplified and contains a variety of help resources. This tool, which is considered unique, will serve as the foundation for the development of future websites dealing with learning microbiology at a more advanced level

Genomes reveal marked differences in the adaptive evolution between orangutan species

Integrating demography and adaptive evolution is pivotal to understanding the evolutionary history and conservation of great apes. However, little is known about the adaptive evolution of our closest relatives, in particular if and to what extent adaptions to environmental differences have occurred. Here, we used whole-genome sequencing data from critically endangered orangutans from North Sumatra (Pongo abelii) and Borneo (P. pygmaeus) to investigate adaptive responses of each species to environmental differences during the Pleistocene

La participación en el urbanismo: los planes de ordenación urbanística municipal en Cataluña

The article analyzes citizen participation in local urban planning (Plans d'ordenació urbanística municipal) approved in Catalonia. The results confirm, despite progress in Catalonia's urban legislation, that there is a great disparity in the application of this legislation in different municipalities. Significant deficiencies have been detected in terms of participation planning, informational activities and in the conducting of collaborative workshops, especially in the municipalities of less than 10,000 inhabitants. In general, we find poor quality and minimum participation in the most of plans; the models that look for a more collaborative and deliberative planning are still a minority.El artículo analiza la participación ciudadana en los Planes de Ordenación Urbanística Municipal (POUM) aprobados en Cataluña. Los resultados constatan, a pesar de los avances en esta materia de la legislación urbanística de Cataluña, una gran diversidad de situaciones entre municipios. En concreto, se detectan debilidades importantes en los municipios de menos de 10.000 habitantes por lo que se refiere a la planificación de la participación y a la realización de acciones informativas y talleres deliberativos. En términos generales, se pone de manifiesto una participación de mínimos, mientras que los municipios que apuestan por una plantificación más colaborativa y deliberativa en el proceso de elaboración de los POUM son aún una minoría

Toward optimal disease surveillance with graph-based active learning.

Tracking the spread of emerging pathogens is critical to the design of timely and effective public health responses. Policymakers face the challenge of allocating finite resources for testing and surveillance across locations, with the goal of maximizing the information obtained about the underlying trends in prevalence and incidence. We model this decision-making process as an iterative node classification problem on an undirected and unweighted graph, in which nodes represent locations and edges represent movement of infectious agents among them. To begin, a single node is randomly selected for testing and determined to be either infected or uninfected. Test feedback is then used to update estimates of the probability of unobserved nodes being infected and to inform the selection of nodes for testing at the next iterations, until certain test budget is exhausted. Using this framework, we evaluate and compare the performance of previously developed active learning policies for node selection, including Node Entropy and Bayesian Active Learning by Disagreement. We explore the performance of these policies under different outbreak scenarios using simulated outbreaks on both synthetic and empirical networks. Further, we propose a policy that considers the distance-weighted average entropy of infection predictions among neighbors of each candidate node. Our proposed policy outperforms existing ones in most outbreak scenarios given small test budgets, highlighting the need to consider an exploration-exploitation trade-off in policy design. Our findings could inform the design of cost-effective surveillance strategies for emerging and endemic pathogens and reduce uncertainties associated with early risk assessments in resource-constrained situations