A gaussian process emulator for estimating the volume of tissue activated during deep brain stimulation

The volume of tissue activated (VTA) is a well-established approach to model the direct effects of deep brain stimulation (DBS) on neural tissue and previous studies have pointed to its potential clinical applications. However, the elevated computational time required to estimate the VTA with standard techniques used in biological neural modeling limits its suitability for practical use. The goal of this project was to develop a novel methodology to reduce the computation time of VTA estimation. To that end, we built a Gaussian process emulator. It combines a field of multi-compartment axon models coupled to the stimulating electric field with a Gaussian process classifier (GPC); following the premise that computing the VTA from a field of axons is in essence a binary classification problem. We achieved a considerable reduction in the average time required to estimate the VTA, under both ideal isotropic and realistic anisotropic brain tissue conductive conditions, limiting the loss of accuracy and overcoming other drawbacks entailed by alternative methods

Flavonoids: an overview

Flavonoids, a group of natural substances with variable phenolic structures, are found in fruits, vegetables, grains, bark, roots, stems, flowers, tea and wine. These natural products are well known for their beneficial effects on health and efforts are being made to isolate the ingredients so called flavonoids. Flavonoids are now considered as an indispensable component in a variety of nutraceutical, pharmaceutical, medicinal and cosmetic applications. This is attributed to their anti-oxidative, anti-inflammatory, anti-mutagenic and anti-carcinogenic properties coupled with their capacity to modulate key cellular enzyme function. Research on flavonoids received an added impulse with the discovery of the low cardiovascular mortality rate and also prevention of CHD. Information on the working mechanisms of flavonoids is still not understood properly. However, it has widely been known for centuries that derivatives of plant origin possess a broad spectrum of biological activity. Current trends of research and development activities on flavonoids relate to isolation, identification, characterisation and functions of flavonoids and finally their applications on health benefits. Molecular docking and knowledge of bioinformatics are also being used to predict potential applications and manufacturing by industry. In the present review, attempts have been made to discuss the current trends of research and development on flavonoids, working mechanisms of flavonoids, flavonoid functions and applications, prediction of flavonoids as potential drugs in preventing chronic diseases and future research directions

Campagne BERYX 5 de pêche à la palangre de fond sur deux monts sous-marins du sud-est de la zone économique de Nouvelle Calédonie (N.O. "Alis", 28 janvier - 6 février 1992)

BERYX 5 fut la cinquième campagne d'une série consacrée à l'étude des ressources halieutiques des monts sous-marins situés au sud-est de la Nouvelle Calédonie. 8 pêches furent réalisées sur les monts B et K avec une palangre de fond du même type que celle qui fut mise en oeuvre par le palangrier "Humboldt". Un total de 8000 hameçons fut mis à l'eau. La diversité des prises (15 espèces) fut du même ordre que celle des campagnes précédentes de pêche à la palangre de fond. Les rendements en #Beryx furent excellents sur le mont B. Les autres espèces bien représentées furent #Rexea antefurcata et #Centrophorus sp.$. Les prises firent l'objet de mensurations et de prélèvements (gonades et estomacs). La bathymétrie réalisée sur le mont K a mis en évidence une extension vers le sud. L'utilisation d'une sonde CTD DEACAT PROFILER a permis d'obtenir une coupe de température et de salinité pour le mont B. Il n'apparaît aucune modification majeure de la structure thermique. (Résumé d'auteur

Mesures de courant, de marée et de vent dans le lagon sud-ouest de Nouvelle-Calédonie : 2ème partie : juillet 1989 à octobre 1990

Ce rapport scientifique et technique présente l'ensemble des données physiques récoltées, de juillet 1989 à octobre 1990, dans le cadre du programme de modélisation du lagon sud-ouest de Nouvelle-Calédonie. Durant cette période, il a été mesuré le courant à partir de 3 mouillages de 2 courantomètres, le niveau de la mer à partir de 4 marégraphes et le vent par 2 stations météorologiques. Dans une première partie la technique de mouillage, la localisation des appareils et les différents problèmes rencontrés sont expliqués. Dans une deuxième partie l'ensemble des tracés liés à ces mesures est donné. (Résumé d'auteur

Campagne BERYX 7 de pêche à la palangre de fond sur trois monts sous-marins du Sud Est de la zone économique de Nouvelle Calédonie (N.O. "Alis", 25 mars - 3 avril 1992)

La campagne BERYX 7 fut la septième d'une série consacrée à l'étude des ressources halieutiques des monts sous-marins situés au sud-est de la Nouvelle-Calédonie. 8 pêches furent réalisées sur les monts B, D et K avec une palangre de fond du même type que celle qui fut mise en oeuvre par le palangrier "Humboldt". Un total de 6000 hameçons fut mis à l'eau. La diversité des prises fut particulièrement faible (11 espèces). Le rendement moyen en #Beryx splendens fut de 11,12 kg pour 100 hameçons. Les deux autres espèces bien représentées furent #Etmopterus lucifer et #Squalus cf. megalops. Les prises firent l'objet de mensurations et de prélèvements (gonades et estomacs). La période de reproduction de #Beryx splendens touchait à sa fin; celle-ci intervient donc durant la saison chaude. Des essais de fécondation in vitro furent tentés sans succès. Des traits de filets à larves de poissons furent réalisées dans le but de collecter des larves de #Beryx splendens$. La bathymétrie du mont K fut poursuivie en utilisant les indications du sondeur grand fond et du GPS. Une sonde CTD permit d'obtenir des coupes de température et de salinité pour les monts B et D; aucune remontée des isothermes ne fut observée. (Résumé d'auteur

Rapport de la campagne Equalis à bord du NO Alis pendant la période d'observations intensives de l'opération Coare du 3 novembre au 12 décembre 1992

La campagne océanographique EQUALIS est une opération commune aux programmes internationaux JGOFS (Joint Global Ocean Flux Study) et TOGA-COARE (Tropical Ocean and Global Atmosphere - Coupled Ocean Atmosphere Response Experiment) organisée par le groupe FLUPAC (Flux dans l'Ouest du Pacifique Equatorial) du Centre ORSTOM de Nouméa, Nouvelle-Calédonie, avec la participation ou la collaboration de chercheurs japonais et australiens. Elle a eu lieu du 3 novembre au 12 décembre 1992 à bord du navire océanographique de l'ORSTOM, l' ALIS, et a consisté en deux points fixes à 156°15E, 1°30S (10 jours) et 156°10E, 1°45S (8 jours), interrompus par une journée d'intercomparaison de mesures météorologiques avec un navire océanographique australien... Ce rapport présente le déroulement de la campagne, le matériel et les méthodes employés et les premiers résultats obtenus. (D'après résumé d'auteur

Production primaire benthique du lagon sud-ouest de Nouvelle Calédonie : méthodes et recueil des données

Ce document regroupe les résultats bruts obtenus lors des missions effectuées de juillet 1990 à juillet 1991 à bord du N.O. ALIS dans le lagon sud-ouest de Nouvelle-Calédonie. La production primaire benthique a été mesurée par le moyen d'incubations réalisées #in situ$. Pour cela des sondes polarographiques (YSI 58) reliées à des oxymètres protégés dans un caisson étanche ont été utilisées afin de mesurer la concentration d'oxygène dans des enceintes d'incubation isolant une fraction de benthos. 180 incubations ont été réalisées sur 60 stations disposées aléatoirement dans l'espace et dans le temps. Tout d'abord la production d'oxygène nette a été mesurée parallèlement à la quantité de lumière disponible à l'intérieur des enceintes, puis un inhibiteur de la photosynthèse a été injecté (DCMU) dans les enceintes ce qui a permis de mesurer la consommation d'oxygène. La production primaire brute a alors été calculée. (Résumé d'auteur

Flux d'oxygène et de sels nutritifs à l'interface eau-sédiment dans le lagon sud-ouest de Nouvelle-Calédonie : enrichissements en ammonium et action d'un inhibiteur de la photosynthèse : méthodes et recueil des données

Le présent document regroupe les méthodes utilisées et les résultats obtenus lors de la mission effectuée par le N.O. ALIS dans le lagon sud-ouest de Nouvelle-Calédonie, du 9 juillet au 10 août 1990. Des enceintes d'incubation ont été mises en oeuvre pour : 1-évaluer le métabolisme aérobie et calculer les flux de sels nutritifs à l'interface eau-sédiment; 2-estimer les flux d'ammonium après enrichissement du milieu; 3-juger de l'action d'un inhibiteur de la photosynthèse, le DCMU (Dichlorophenyl-dimethylurée). La concencration en oxygène de chaque enceinte a été mesurée par une sonde polarographique (YSI 58) reliée à un oxymètre protégé dans un caisson étanche. Au total, 15 stations réparties sur les trois types de fonds reconnus dans le lagon (fonds envasés, fonds de sables gris et fonds de sables blancs) ont été échantillonnées. En premier lieu, trois incubations ont été réalisées à l'obscurité pendant deux heures sur chaque station, pour mesurer les flux d'oxygène et de sels nutritif