Population synthesis of HII galaxies

We study the stellar population of galaxies with active star formation, determining ages of the stellar components by means of spectral population synthesis of their absorption spectra. The data consist of optical spectra of 185 nearby ($z \leq 0.075$) emission line galaxies. They are mostly HII galaxies, but we also include some Starbursts and Seyfert 2s, for comparison purposes. They were grouped into 19 high signal-to-noise ratio template spectra, according to their continuum distribution, absorption and emission line characteristics. The templates were then synthesized with a star cluster spectral base. The synthesis results indicate that HII galaxies are typically age-composite stellar systems, presenting important contribution from generations up to as old as 500 Myr. We detect a significant contribution of populations with ages older than 1 Gyr in two groups of HII galaxies. The age distributions of stellar populations among Starbursts can vary considerably despite similarities in the emission line spectra. In the case of Seyfert 2 groups we obtain important contributions of old population, consistent with a bulge. From the diversity of star formation histories, we conclude that typical HII galaxies in the local universe are not systems presently forming their first stellar generation.Comment: 12 pages, 4 figures, MNRAS in pres

Um método rápido e econômico para a obtenção de DNA de dentes para estudos forenses

Introdução: Devido a sua estrutura mineralizada e inerte, ao seu tamanho e a sua localização, dentes molares e pré-molares são considerados boas fontes para obtenção do DNA necessário para a identificação molecular de pessoas. Várias metodologias têm sido empregadas para obtenção de DNA a partir dos dentes, sendo que o uso do equipamento de pulverização criogênica Freezer mill ® para a pulverização e da coluna concentradora MicroconTM-100 são procedimentos padrão mais utilizados e difundidos. O uso conjunto dessas duas metodologias é, porém, demorado e de custo elevado. Nós desenvolvemos este trabalho com o objetivo de testar e padronizar um novo método econômico e rápido para a obtenção de DNA de dentes para estudos forenses. O resultado deste trabalho vem a atender aos interesses do Convênio de Cooperação entre o Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular da PUCRS (PPGBCM-PUCRS) e o Instituto-Geral de Perícias (IGP-RS) da Secretaria da Justiça e da Segurança Pública do Rio Grande do Sul (SJS-RS), o qual visa desenvolver pesquisas que atendam às necessidades de avanço na linha de investigação da Biologia Forense. Material Foram utilizados dentes molares ou pré-molares provenientes de 26 cadáveres não identificados previamente, depositados no DML-RS. Para cada cadáver avaliado foi registrado seu estado geral de apresentação, o tempo estimado de morte, a idade e o local onde o cadáver foi encontrado. Os dentes foram retirados dos cadáveres, armazenados por no mínimo 24 horas a –80°C e, posteriormente, utilizados nos testes. A escolha dos corpos foi aleatória, abrangendo vários estágios de decomposição, tempo de morte e locais onde foram encontrados. Metodologia Material Foram utilizados dentes molares ou pré-molares provenientes de 26 cadáveres não identificados previamente, depositados no DML-RS. Para cada cadáver avaliado foi registrado seu estado geral de apresentação, o tempo estimado de morte, a idade e o local onde o cadáver foi encontrado. Os dentes foram retirados dos cadáveres, armazenados por no mínimo 24 horas a – 80°C e, posteriormente, utilizados nos testes. A escolha dos corpos foi aleatória, abrangendo vários estágios de decomposição, tempo de morte e locais onde foram encontrados. Metodologia Para a economia: (I) foi usado o moinho mineralógico IKA (Ika do Brasil – RJ- Brasil), de baixo custo em comparação ao uso do Freezer mill®; (II) foi usado precipitação do DNA com o uso de isopropanol, de baixo custo em comparação ao uso do MicroconTM-100. Para a rapidez: foi testado o tempo de duas horas para a incubação do tecido no tampão de lise celular em comparação ao tempo padronizado de 12 horas. Procedimentos: Nós usamos o moinho mineralógico IKA para obtenção de tecido pulverizado dos dentes a fim de extrair DNA na quantidade e qualidade necessárias para a obtenção de perfil genético. Cada amostra foi moída e separada em quatro subamostras, nas quais foi avaliado o tempo de incubação (2 ou 12 horas de incubação) e o método de precipitação final do DNA (MicroconTM–100 ou isopropanol). A quantidade e a qualidade do DNA obtido foram testadas. A viabilidade de uso do DNA nuclear e do DNA mitocondrial obtido foi verificada pela capacidade de amplificação por técnica de Polymerase Chain Reaction (PCR) das amostras através do uso dos kits apropriados. Resultados e Discussão: A utilização do moinho mineralógico IKA para pulverização de tecido foi eficaz em todas as amostras testadas. As amostras processadas com MicroconTM-100 não apresentaram diferenças significativas na quantidade de DNA obtido quando incubadas por 2 ou 12 horas, o que permite aceitar que uma incubação de duas horas é suficiente para o procedimento padrão.O mesmo foi verificado nos subgrupos, nos quais, a precipitação foi realizada com isopropanol. Com o uso do MicroconTM-100 obteve-se uma concentração superior de DNA quando comparado ao uso do isopropanol (p<0,001). No entanto, a precipitação por isopropanol obteve um DNA de pureza superior ao do DNA processado com MicroconTM-100 (p<0,001). Dos 26 casos avaliados, dentes de 20 corpos tiveram seu DNA nuclear autossômico identificado com sucesso e, em dois dos 20 casos, foi também utilizada com sucesso a análise do cromossomo Y, não excluindo vínculo patrilíneo. Os seis demais casos apenas foram identificados pela análise do DNA mitocondrial, não excluindo o vínculo matrilíneo. A menor concentração de DNA derivada da precipitação realizada com isopropanol parece ter sido compensada pela maior pureza do material uma vez que houve similaridade do números de loci analisados com sucesso quando se comparam MicroconTM-100 e isopropanol. O estado geral do cadáver, o tempo estimado de morte, a idade e o local onde o cadáver foi encontrado não foram significativamente associados com a quantidade ou a qualidade do DNA obtido, bem como com o número de loci analisados com sucesso. Conclusão: A utilização do moinho mineralógico IKA para pulverização de tecido foi eficaz e pode substituir o uso do Freezer mill® reduzindo o custo dos procedimentos. A precipitação com isopropanol foi eficaz e pode substituir o uso do MicroconTM-100 reduzindo ainda mais o custo dos procedimentos. Um tempo de duas horas para a incubação do tecido no tampão de lise celular foi eficaz para reduzir o tempo dos procedimentos. Os experimentos desenvolvidos neste trabalho testaram e padronizaram um novo método rápido e econômico para a obtenção de DNA de dentes para estudos forenses, que pode ser empregado em outros caso de identificação de cadáveres humanos.O resultado deste trabalho poderá atender aos interesses do Convênio de Cooperação entre o PPGBCM-PUCRS e o IGP-RS no desenvolvimento e no avanço na linha de investigação da Biologia Forense

Uso dos mini-STR NC01 e NC02 na prática forense: (I) validaçao; (II) análise em DNA degradado; (III) estudo populacional no Rio Grande do Sul

I offer this thesis, which is fulfill the purposes of the cooperation agreement between the Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, PUCRS and Instituto Geral de Perícias, State Security from Rio Grande do Sul, with the intention to establish a routine for molecular identification of human DNA from degraded to be functional and scientific basis. Even with the advances of commercial amplification kits and equipment for DNA extraction and genotyping, forensic samples remain challenging. With the occurrence of massive disasters or the increase in trace samples that will be part of the CODIS database, it is very important that forensic laboratories have the available markers to amplify fragments of small size and the use of miniSTRs may be an important tool for this purpose. The use of miniSTRs for the identification of degraded DNA samples and obtaining the allele frequency of six miniSTRs took place in samples from the population of Rio Grande do Sul for its use in forensics. The validation study was conducted as directed by the Scientific Working Group on DNA Analysis Methods (SWGDAM).The validation is to examine the robustness of miniPlex NC01 and NC02 in forensic cases. This study evaluated factors that potentially affect the results of genotyping obtained by amplification of STRs. The study of forensic samples of degraded DNA was performed with 22 samples of human remains (21 teeth and one bone). Due to the difficult amplification of such samples in forensic laboratories often is necessary to use the technique of sequencing of the mtDNA that is time consuming, costly and only indicates the maternal bond. Thus, the use of miniSTRs NC01 and NC02 in challenging samples proved to be a useful tool in generating human identification profile in all samples. The use of miniSTRs NC01 and NC02, in conjunction with other commercial kits with markers of small size will be of great assistance to the Forensic Scientists. With the study population as possible is the immediate use of these markers for forensic and criminal cases in the identification of family linkages, increasing the odds obtained by the statistical calculations.Apresento esta tese, a qual vem atender aos propósitos do convênio de cooperação entre o Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular da PUCRS e o Instituto Geral de Perícias da Secretaria de Segurança do Estado do Rio Grande do Sul, na intenção de estabelecer uma rotina de identificação molecular humana a partir de DNA degradado que seja funcional e que tenha embasamento científico. Mesmo com os avanços dos kits comerciais de amplificação de DNA e dos equipamentos para extração e genotipagem, as amostras forenses continuam sendo desafiadoras. Com a ocorrência de desatres massivos ou com o aumento de amostras de vestígios, que irão fazer parte do banco de dados CODIS, é de extrema importância que os Laboratórios Forenses tenham a disposição marcadores que logrem amplificar fragmentos de tamanho reduzidos. O uso de miniSTRs é uma ferramenta importante para esse fim. Tanto o uso de miniSTR para a identificação de amostras de DNA degradado quanto a obtenção da frequência alélica de seis miniSTR foram realizados nas amostras de indivíduos provenienstes da população do Rio Grande do Sul. O estudo de validação foi realizado conforme orientação do Scientific Working Group on DNA Analysis Methods (SWGDAM), cujo objetivo foi examinar a robustez dos MiniPlex de miniSTR NC01 e NC02 em casos forenses. Neste estudo de validação foram testados fatores que potencialmente afetam negativamente as tentativas de genotipagens através da amplificação de STRs. O estudo do DNA degradado de amostras forenses foi realizado com 22 amostras de restos humanos (21 dentes e 1 osso). Devido à difilculdade de amplificação deste tipo de amostras nos laboratórios forense muitas vezes se faz necessário o uso da técnica do seqüênciamento do mtDNA que é demorada, de elevado custo e que indica somente o vínculo materno. Neste caso, o uso dos miniSTRs NC01 e NC02 para amostras difíceis se mostrou uma ferramenta plenamente eficiente, uma vez que permitiu a obenção do perfil genético em todas as amostras analisadas. Diante dos resultados do presente trabalho, é possível sugerir que o uso dos miniSTRs NC01 e NC02, em conjunto com outros kits comerciais de marcadores de tamanho reduzido, será de grande auxílio para os Cientistas Forenses. Com o estudo populacional aqui realizado passa a ser possível o emprego imediato destes marcadores nos casos forenses criminais e na identificação de vínculos familiares, dado que aumentam os índices obtidos através dos cálculos estatísticos

Stellar population gradients in Seyfert 2 galaxies. Northern sample

We use high signal-to-noise ratio long-slit spectra in the 3600-4700A range of the twenty brightest northern Seyfert 2 galaxies to study the variation of the stellar population properties as a function of distance from the nucleus. In order to characterize the stellar population and other continuum sources (e.g. featureless continuum FC) we have measured equivalent widths Ws of six absorption features, four continuum colours and their radial variations, and performed spectral population synthesis as a function of distance from the nucleus. About half the sample has CaIIK and G-band W values smaller at the nucleus than at 1 kpc from it, due to a younger population and/or FC. The stellar population synthesis shows that, while at the nucleus, 75% of the galaxies present contribution > 20% of ages younger or equal than 100Myr and/or of a FC, this proportion decreases to 45% at 3 kpc. In particular, 55% of the galaxies have contribution > 10% of the 3 Myr/FC component (a degenerate component in which one cannot separate what is due to a FC or to a 3 Myr stellar population) at the nucleus, but only 25% of them have this contribution at 3 kpc. As reference, the stellar population of 10 non-Seyfert galaxies, spanning the Hubble types of the Seyfert (from S0 to Sc) was also studied. A comparison between the stellar population of the Seyferts and that of the non-Seyferts shows systematic differences: the contribution of ages younger than 1 Gyr is in most cases larger in the Seyfert galaxies than in non-Seyferts, not only at the nucleus but up to 1 kpc from it.Comment: 23 pages, 18 figures, MNRAS in pres

Effect of frequent hemodialysis on residual kidney function.

Frequent hemodialysis can alter volume status, blood pressure, and the concentration of osmotically active solutes, each of which might affect residual kidney function (RKF). In the Frequent Hemodialysis Network Daily and Nocturnal Trials, we examined the effects of assignment to six compared with three-times-per-week hemodialysis on follow-up RKF. In both trials, baseline RKF was inversely correlated with number of years since onset of ESRD. In the Nocturnal Trial, 63 participants had non-zero RKF at baseline (mean urine volume 0.76 liter/day, urea clearance 2.3 ml/min, and creatinine clearance 4.7 ml/min). In those assigned to frequent nocturnal dialysis, these indices were all significantly lower at month 4 and were mostly so at month 12 compared with controls. In the frequent dialysis group, urine volume had declined to zero in 52% and 67% of patients at months 4 and 12, respectively, compared with 18% and 36% in controls. In the Daily Trial, 83 patients had non-zero RKF at baseline (mean urine volume 0.43 liter/day, urea clearance 1.2 ml/min, and creatinine clearance 2.7 ml/min). Here, treatment assignment did not significantly influence follow-up levels of the measured indices, although the range in baseline RKF was narrower, potentially limiting power to detect differences. Thus, frequent nocturnal hemodialysis appears to promote a more rapid loss of RKF, the mechanism of which remains to be determined. Whether RKF also declines with frequent daily treatment could not be determined

The Stellar Populations of Starburst Galaxies Through near infrared spectroscopy

We study the central (inner few hundred parsecs) stellar populations of four starburst galaxies (NGC34, NGC1614, NGC3310 and NGC7714) in the near-infrared (NIR), from 0.8 to 2.4microns, by fitting combinations of stellar population models of various ages and metallicities. The NIR spectra of these galaxies feature many absorption lines. For the first time, we fit simultaneously as much as 15 absorption features in the NIR. The observed spectra are best explained by stellar populations containing a sizable amount (20 to 56 % by mass) of ~1Gyr old stellar population with Thermally Pulsing-Asymptotic Giant Branch stars. We found that the metallicity of the stars which dominates the light is solar. Metallicities substantially different from solar give a worse fit. Though the ages and metallicities we estimate using the NIR spectroscopy are in agreement with values from the literature based on the UV/optical, we find older ages and a larger age spread. This may be due to the fact that the optical is mostly sensitive to the last episode of star formation, while the NIR better maintains the record of previous stellar generations. Another interesting result is that the reddening estimated from the whole NIR spectrum is considerably lower than that based on emission lines. Finally, we find a good agreement of the free emission line spectrum with photoionization models, using as input spectral energy distribution the synthetic composite template we derived as best-fit.Comment: 11 pages, 7 figures, accepted for publication on MNRA

Linking the exotic structure of 17{}^{17}C to its unbound mirror 17{}^{17}Na

The structure of ${}^{17}$C is used to define a nuclear interaction that, when used in a multichannel algebraic scattering theory for the $n+{}^{16}$C system, gives a credible definition of the (compound) excitation spectra. When couplings to the low-lying collective excitations of the ${}^{16}$C-core are taken into account, both sub-threshold and resonant states about the $n+{}^{16}$C threshold are found. Adding Coulomb potentials to that nuclear interaction, the method is used for the mirror system of $p+{}^{16}$Ne to specify the low-excitation spectrum of the particle unstable $^{17}$Na. We compare the results with those of a microscopic cluster model. A spectrum of low excitation resonant states in ${}^{17}$Na is found with some differences to that given by the microscopic-cluster model. The calculated resonance half-widths (for proton emission) range from $\sim 2$ to $\sim 672$ keV.Comment: 13 pages, 5 figure

Lipid levels are inversely associated with infectious and all-cause mortality: international MONDO study results.

Cardiovascular (CV) events are increased 36-fold in patients with end-stage renal disease. However, randomized controlled trials to lower LDL cholesterol (LDL-C) and serum total cholesterol (TC) have not shown significant mortality improvements. An inverse association of TC and LDL-C with all-cause and CV mortality has been observed in patients on chronic dialysis. Lipoproteins also may protect against infectious diseases. We used data from 37,250 patients in the international Monitoring Dialysis Outcomes (MONDO) database to evaluate the association between lipids and infection-related or CV mortality. The study began on the first day of lipid measurement and continued for up to 4 years. We applied Cox proportional models with time-varying covariates to study associations of LDL-C, HDL cholesterol (HDL-C), and triglycerides (TGs) with all-cause, CV, infectious, and other causes of death. Overall, 6,147 patients died (19.2% from CV, 13.2% from infection, and 67.6% from other causes). After multivariable adjustment, higher LDL-C, HDL-C, and TGs were independently associated with lower all-cause death risk. Neither LDL-C nor TGs were associated with CV death, and HDL-C was associated with lower CV risk. Higher LDL-C and HDL-C were associated with a lower risk of death from infection or other non-CV causes. LDL-C was associated with reduced all-cause and infectious, but not CV mortality, which resulted in the inverse association with all-cause mortality

Recovering star formation histories: Integrated-light analyses vs stellar colour-magnitude diagrams

Accurate star formation histories (SFHs) of galaxies are fundamental for understanding the build-up of their stellar content. However, the most accurate SFHs - those obtained from colour-magnitude diagrams (CMDs) of resolved stars reaching the oldest main sequence turnoffs (oMSTO) - are presently limited to a few systems in the Local Group. It is therefore crucial to determine the reliability and range of applicability of SFHs derived from integrated light spectroscopy, as this affects our understanding of unresolved galaxies from low to high redshift. To evaluate the reliability of current full spectral fitting techniques in deriving SFHs from integrated light spectroscopy by comparing SFHs from integrated spectra to those obtained from deep CMDs of resolved stars. We have obtained a high signal--to--noise (S/N $\sim$ 36.3 per \AA) integrated spectrum of a field in the bar of the Large Magellanic Cloud (LMC) using EFOSC2 at the 3.6 meter telescope at La Silla Observatory. For this same field, resolved stellar data reaching the oMSTO are available. We have compared the star formation rate (SFR) as a function of time and the age-metallicity relation (AMR) obtained from the integrated spectrum using {\tt STECKMAP}, and the CMD using the IAC-star/MinnIAC/IAC-pop set of routines. For the sake of completeness we also use and discuss other synthesis codes ({\tt STARLIGHT} and {\tt ULySS}) to derive the SFR and AMR from the integrated LMC spectrum. We find very good agreement (average differences $\sim$ 4.1 $\%$) between the SFR(t) and the AMR obtained using {\tt STECKMAP} on the integrated light spectrum, and the CMD analysis. {\tt STECKMAP} minimizes the impact of the age-metallicity degeneracy and has the advantage of preferring smooth solutions to recover complex SFHs by means of a penalized $\chi^2$. [abridged]Comment: 23 pages, 24 figures. Accepted for publication in A&A (6 Sep 2015