Backward stochastic differential equation approach to modeling of gene expression

In this article, we introduce a novel backward method to model stochastic gene expression and protein level dynamics. The protein amount is regarded as a diffusion process and is described by a backward stochastic differential equation (BSDE). Unlike many other SDE techniques proposed in the literature, the BSDE method is backward in time; that is, instead of initial conditions it requires the specification of endpoint ("final") conditions, in addition to the model parametrization. To validate our approach we employ Gillespie's stochastic simulation algorithm (SSA) to generate (forward) benchmark data, according to predefined gene network models. Numerical simulations show that the BSDE method is able to correctly infer the protein level distributions that preceded a known final condition, obtained originally from the forward SSA. This makes the BSDE method a powerful systems biology tool for time reversed simulations, allowing, for example, the assessment of the biological conditions (e.g. protein concentrations) that preceded an experimentally measured event of interest (e.g. mitosis, apoptosis, etc.).Comment: Accepted in Physical Review

Intercambio virtual entre jóvenes de Lationamérica: Una actividad posible

IX Congresso Brasileiro de Hispanistas realizado nos dias 22 a 25 agosto 2016En esa comunicación vamos a presentar la interesante experiencia de intercambio virtual entre alumnos de portugués uruguayos con estudiantes de lengua española en Brasil a través del sistema de video conferencia del Skype. Los aprendices eran alumnos del ANEP CES (Administración Nacional de Educación Pública Consejo de Educación Secundaria de Uruguay) y de un colegio privado en Rio de Janeiro. Al ofrecerle a nuestros alumnos la posibilidad de un intercambio virtual entre jóvenes de Latinoamérica no solo les ofrecimos la oportunidad de practicar de forma auténtica la lengua extranjera dentro del ambiente escolar, sino también una importante ocasión de contacto con otras formas de ser y ver el mundo facilitada por las nuevas tecnologías. Así, pudieron conocer su nivel real de competencia comunicativa a partir de la interacción con hablantes nativos en tiempo real y reflexionar sobre la importancia de superar estereotipos y prejuicios culturales, además de ampliar sus conocimientos sobre la diversidad cultural del continente a partir de la realidad de sus interlocutores. Entre los propósitos de esta experiencia estaba lo de fomentar la comunicación de los estudiantes en la lengua meta para que puedan evaluar sus capacidades y, al mismo tiempo, descubrir una nueva realidad cultural. Dicha experiencia educativa se enmarca dentro del abordaje de la enseñanza de segundas lenguas a través del enfoque comunicativo y encuentra fundamentos en los estudios sobre el uso de las nuevas tecnologías aplicadas a la educación. Entre otras referencias bibliográficas están las orientaciones curriculares de ambos países (2006), el Marco de referencia europeo para la enseñanza de lenguas extranjeras (2002) y documentos de la UNESCO.UNILA­-UNIOEST

La recolección de insectos con fines alimenticios en la zona turística de Otumba y Teotihuacán, Estado de México

La recolección de insectos es una práctica antigua que aún se observa en algunos lugares de México. El presente artículo tiene como objetivo describir la situación actual en torno a la recolección, comercialización y preparación de insectos comestibles en la zona turística de Teotihuacán y Otumba, México. Mediante la utilización de técnicas etnográfi cas (entrevistas a profundidad, semiestructuradas y observación participante) se documentaron las formas de recolección y preparación de seis especies de insectos comestibles. Se encontró que la recolección de éstos se lleva a cabo de manera tradicional utilizando estrategias complejas y rudimentarias. Su preparación es creativa, pudiendo consumirse en forma cruda o cocinada en diversos platillos tradicionales que son comercializados a los turistas que arriban a la zona

Metodologia para diagnóstico e intervenção em edifícios correntes: habitação social no Porto e Recife

De acordo com o INE (2010), o parque de habitação social distribui-se por 246 Municípios, sendo constituído por cerca de 97 mil fogos e 22 mil edifícios. O município do Porto detém 12 682 fogos, correspondendo a 13% do total. Durante o ano de 2009 os municípios portugueses executaram obras de conservação em 2 252 edifícios (10,2% do total) e procederam à reabilitação de 6 636 fogos (6,8% do total). Este património municipal gerou, em 2009, uma receita média por fogo de 706 euros, entre rendas cobradas e fogos vendidos. Por seu lado a despesa média (incluindo os encargos fixos) ficou-se pelos 676 euros por fogo. Atendendo apenas a estas rubricas de receitas e despesas relacionadas com o parque de habitação social dos municípios, verifica-se a existência de um “défice” nas regiões do Norte de 12,7 milhões, o que demonstra o investimento em curso actualmente. O Município do Porto registou um défice superior a 1 000 euros por fogo (receita de 604 euros e despesa de 1 718 euros). A Habitação Social resulta de uma necessidade passada e presente de pensar nas pessoas, isto é, pensar numa política de valorização da qualidade de vida da população que passando muito pela habitação, não acaba nela. A política social da habitação dá início a um processo global de melhoria da qualidade de vida das pessoas, sendo necessário fazer coincidir a melhoria das condições de alojamento, com a melhoria das condições envolventes aos conjuntos habitacionais. Só com uma participação activa dos moradores é possível a sua identificação com o conjunto habitacional onde residem. A missão descrita é incompatível com habitação social em deficiente estado de conservação ou mesmo muito degradada, tal como se verifica em inúmeros países. Importa desta forma assegurar a reabilitação deste património construído e a sua posterior conservação. Nos últimos anos ocorreram desenvolvimentos muito significativos no que diz respeito à capacidade de utilizar técnicas experimentais (in situ ou em laboratório) e simulações em computador. Um aspecto relevante é que a engenharia “de conservação” deve ter uma abordagem e capacidade diferentes das usadas em construções novas. Frequentemente, os materiais e técnicas tradicionais são desconhecidos para os envolvidos. Também se verifica que a tendência das entidades reguladoras e dos projectistas para que os regulamentos actuais sejam cumpridos. Isto é muitas vezes inaceitável, visto que os regulamentos foram escritos tendo em mente outras formas de construção, pelo que a sua aplicação em materiais, tecnologias e formas tradicionais é excessivamente conservadora ou penalizadora. A necessidade de reconhecer a diferença entre o projecto moderno e a conservação também é relevante no contexto dos custos associados à contribuição da engenharia. O procedimento habitual de cálculo de honorários de engenharia, como uma percentagem do trabalho realizado, está claramente em oposição com as melhores práticas de conservação. Ser capaz de recomendar não tomar qualquer medida pode, na realidade, implicar mais estudos e mais custos reais do que uma recomendação para grandes intervenções. Os procedimentos das intervenções modernas exigem um levantamento cuidado da construção, bem como a compreensão da sua história, tendo em vista obter um diagnóstico claro, que requer muitas vezes técnicas de inspecção adequadas e experiência adquirida relevante, num processo muito semelhante à medicina Após reconstituir o historial do paciente (o edifício) e requerer exames (técnicas de inspecção e ensaios), é possível um diagnóstico. Este diagnóstico permite, se necessário, uma terapia adequada (projecto de intervenção) e o respectivo controlo de resultados (monitorização dos resultados). Tendo em vista demonstrar a abordagem metodológica necessária, no presente artigo serão apresentados casos de estudo em Portugal e Brasil, onde os autores estiveram envolvidos

Safety analysis of modern heritage masonry buildings : box-buildings in Recife, Brazil

Box-buildings are structural masonry buildings named as such because of their shape. There are around 5,000 of them in Recife, Brazil. This paper presents a safety analysis of one box-building that suffered collapse on December 2007. The research aims at quantifying the safety of this type of existing buildings and at better understanding their structural behavior to try to identify the reasons for the collapse. A finite element model was prepared and a set of nonlinear numerical analyses were performed. The results of the analyses show good agreement between the observed damage in the real building and the damage achieved numerically at the current condition (LF=1). The model thus seems to represent satisfactorily the real behavior of the building but the safety factor obtained seems too conservative and does not justify the collapse observed in reality. Since results show that the building should not have failed under normal working conditions, a collapse assessment about why the building fell is therefore provided and a sensitivity analysis was performed in order to understand the importance of the material parameters and their influence on the structural response of the building

Neuropsychological assessment and perinatal risk: A study amongst very premature born 4- and 5-year old children

Background: Prematurity and its consequences are serious problems that can result in numerous neurosensory disabilities and cerebral cognitive dysfunctions. The Perinatal Risk Index (PERI) might provide a predictive measure of these problems. Aim: This study compared the cognitive development of prematurely born children at 4 and 5 years of age with age-matched peers born at term. The secondary objective was to determine whether a correlation exists between perinatal risk and performance on neuropsychological tests among premature children. Methods: A total of 54 children between four and five years of age were evaluated; 27 were born very premature (premature group; PG), and 27 were born at term (term group; TG). Executive function, attention, memory, language, visual perception, and spatial structuring were evaluated. Subtests from the Kaufman Assessment Battery for Children, the Rey Complex Figure Test, the McCarthy Scales of Children’s Abilities, the Peabody Picture Vocabulary Test, Test A, Trails A and B, the spatial structuring questionnaire from the Child Neuropsychological Maturity Questionnaire, and the Wechsler Intelligence Scale for Children were used. A PERI score was also obtained for the PG. Results: The PG showed significantly lower scores than the TG in all the studied cognitive domains. Visual-perceptive scores were significantly and negatively correlated with the PERI scores of the PG. Conclusions: The PG showed neurocognitive deficits compared with the TG. The PERI can be used to predict the development of visual-perceptive abilities in children between four and five years of age

A colour-excess extinction map of the southern Galactic disc from the VVV and GLIMPSE surveys

An improved high-resolution and deep A Ks foreground dust extinction map is presented for the Galactic disc area within 295◦ ≾ l ≾ 350◦, −1.0◦ ≾ b ≾ +1.0◦. At some longitudes the map reaches up to |b| ~ 2.25◦, for a total of ~148 deg 2. The map was constructed via the Rayleigh–Jeans colour excess (RJCE) technique based on deep near-infrared (NIR) and mid-infrared (MIR) photometry. The new extinction map features a maximum bin size of 1 arcmin, and relies on NIR observations from the Two Micron All-Sky Survey (2MASS) and new data from ESO’s Vista Variables in the Vía Láctea (VVV) survey, in concert with MIR observations from the Galactic Legacy Infrared Mid-Plane Survey Extraordinaire. The VVV photometry penetrates ~4 mag fainter than 2MASS, and provides enhanced sampling of the underlying stellar populations in this heavily obscured region. Consequently, the new results supersede existing RJCE maps tied solely to brighter photometry, revealing a systematic underestimation of extinction in prior work that was based on shallower data. The new high-resolution and large-scale extinction map presented here is readily available to the community through a web query interface.Peer reviewe