Diagnosis of sarcopenia on thoracic computed tomography and its association with postoperative survival after anatomic lung cancer resection

Computer tomography-derived skeletal muscle index normalized for height in conjunction with muscle density enables single modality-based sarcopenia assessment that accounts for all diagnostic criteria and cutoff recommendations as per the widely accepted European consensus. Yet, the standard approach to quantify skeletal musculature at the third lumbar vertebra is limited for certain patient groups, such as lung cancer patients who receive chest CT for tumor staging that does not encompass this lumbar level. As an alternative, this retrospective study assessed sarcopenia in lung cancer patients treated with curative intent at the tenth thoracic vertebral level using appropriate cutoffs. We showed that skeletal muscle index and radiation attenuation at level T10 correlate well with those at level L3 (Pearson’s R = 0.82 and 0.66, p < 0.001). During a median follow-up period of 55.7 months, sarcopenia was independently associated with worse overall (hazard ratio (HR) = 2.11, 95%-confidence interval (95%-CI) = 1.38–3.23, p < 0.001) and cancer-specific survival (HR = 2.00, 95%-CI = 1.19–3.36, p = 0.009) of lung cancer patients following anatomic resection. This study highlights feasibility to diagnose sarcopenia solely by thoracic CT in accordance with the European consensus recommendations. The straightforward methodology offers easy translation into routine clinical care and potential to improve preoperative risk stratification of lung cancer patients scheduled for surgery

Disseminated cancer cells detected by immunocytology in lymph nodes of NSCLC patients are highly prognostic and undergo parallel molecular evolution

In melanoma, immunocytology (IC) after sentinel lymph node disaggregation not only enables better quantification of disseminated cancer cells (DCCs) than routine histopathology (HP) but also provides a unique opportunity to detect, isolate, and analyse these earliest harbingers of metachronous metastasis. Here, we explored lymph node IC in non-small cell lung cancer (NSCLC). For 122 NSCLC patients, 220 lymph nodes (LNs) were split in half and prepared for IC and HP. When both methods were compared, IC identified 22% positive patients as opposed to 4.5% by HP, revealing a much higher sensitivity of IC (p < 0.001). Assessment of all available 2,952 LNs of the same patients by HP uncovered additional patients escaping detection of lymphatic tumour spread by IC alone, consistent with the concept of skip metastasis. A combined lymph node status of IC and complete HP on a larger cohort of patients outperformed all risk factors in multivariable analysis for prognosis (p < 0.001; RR = 2.290; CI 1.407–3.728). Moreover, isolation of DCCs and single-cell molecular characterization revealed that (1) LN-DCCs differ from primary tumours in terms of copy number alterations and selected mutations and (2) critical alterations are acquired during colony formation within LNs. We conclude that LN-IC in NSCLC patients when combined with HP improves diagnostic precision, has the potential to reduce total workload, and facilitates molecular characterization of lymphatically spread cancer cells, which may become key for the selection and development of novel systemic therapies. © 2022 The Authors. The Journal of Pathology published by John Wiley & Sons Ltd on behalf of The Pathological Society of Great Britain and Ireland

Disseminated cancer cells detected by immunocytology in lymph nodes of NSCLC patients are highly prognostic and undergo parallel molecular evolution

Abstract In melanoma, immunocytology (IC) after sentinel lymph node disaggregation not only enables better quantification of disseminated cancer cells (DCCs) than routine histopathology (HP) but also provides a unique opportunity to detect, isolate, and analyse these earliest harbingers of metachronous metastasis. Here, we explored lymph node IC in non‐small cell lung cancer (NSCLC). For 122 NSCLC patients, 220 lymph nodes (LNs) were split in half and prepared for IC and HP. When both methods were compared, IC identified 22% positive patients as opposed to 4.5% by HP, revealing a much higher sensitivity of IC (p < 0.001). Assessment of all available 2,952 LNs of the same patients by HP uncovered additional patients escaping detection of lymphatic tumour spread by IC alone, consistent with the concept of skip metastasis. A combined lymph node status of IC and complete HP on a larger cohort of patients outperformed all risk factors in multivariable analysis for prognosis (p < 0.001; RR = 2.290; CI 1.407–3.728). Moreover, isolation of DCCs and single‐cell molecular characterization revealed that (1) LN‐DCCs differ from primary tumours in terms of copy number alterations and selected mutations and (2) critical alterations are acquired during colony formation within LNs. We conclude that LN‐IC in NSCLC patients when combined with HP improves diagnostic precision, has the potential to reduce total workload, and facilitates molecular characterization of lymphatically spread cancer cells, which may become key for the selection and development of novel systemic therapies. © 2022 The Authors. The Journal of Pathology published by John Wiley & Sons Ltd on behalf of The Pathological Society of Great Britain and Ireland

Transcriptome of Aphanomyces euteiches: New Oomycete Putative Pathogenicity Factors and Metabolic Pathways

Aphanomyces euteiches is an oomycete pathogen that causes seedling blight and root rot of legumes, such as alfalfa and pea. The genus Aphanomyces is phylogenically distinct from well-studied oomycetes such as Phytophthora sp., and contains species pathogenic on plants and aquatic animals. To provide the first foray into gene diversity of A. euteiches, two cDNA libraries were constructed using mRNA extracted from mycelium grown in an artificial liquid medium or in contact to plant roots. A unigene set of 7,977 sequences was obtained from 18,864 high-quality expressed sequenced tags (ESTs) and characterized for potential functions. Comparisons with oomycete proteomes revealed major differences between the gene content of A. euteiches and those of Phytophthora species, leading to the identification of biosynthetic pathways absent in Phytophthora, of new putative pathogenicity genes and of expansion of gene families encoding extracellular proteins, notably different classes of proteases. Among the genes specific of A. euteiches are members of a new family of extracellular proteins putatively involved in adhesion, containing up to four protein domains similar to fungal cellulose binding domains. Comparison of A. euteiches sequences with proteomes of fully sequenced eukaryotic pathogens, including fungi, apicomplexa and trypanosomatids, allowed the identification of A. euteiches genes with close orthologs in these microorganisms but absent in other oomycetes sequenced so far, notably transporters and non-ribosomal peptide synthetases, and suggests the presence of a defense mechanism against oxidative stress which was initially characterized in the pathogenic trypanosomatids

Neuronale Korrelate moralischen Urteilens bei Jugendlichen im Alter zwischen 14 und 16 Jahren

Ziel der vorliegenden Arbeit war es die neurobiologischen Korrelate moralischen Urteilens bei 14- bis 16-jährigen Jugendlichen zu erforschen. Zu diesem Zweck wurde mittels der funktionellen Bildgebung die Aktivierung derjenigen Hirnareale detektiert, die an diesem komplexen Entscheidungsprozess beteiligt sind. In gleicher Weise wurde ein Probandenkollektiv von Erwachsenen untersucht und die jeweiligen Ergebnisse der beiden Altersgruppen miteinander verglichen. Die Probanden wurden in den durchgeführten Untersuchungen dazu angehalten sowohl moralische als auch neutrale Konfliktsituationen mit vorgegebenen Lösungsoptionen zu bewerten. Im Fokus des wissenschaftlichen Interesses standen die hierbei auftretenden neuronalen Aktivierungen der Moralareale, welche durch die funktionelle Kernspintomographie für den Kontrast Moral > Neutral ermittelt wurden. Während sich die Studienlage zur Moralität von Jugendlichen bisher eher dürftig darstellt, gibt es zum moralischen Entscheiden von Erwachsenen bereits eine Reihe bildgebender Untersuchungen. Diese kamen allesamt zu dem Ergebnis, dass ein komplexes Netzwerk an Hirnarealen zur Bearbeitung moralischer Fragestellungen nötig sei, welches u. a. den medialen präfrontalen Kortex, den dorsolateralen präfrontalen Kortex, den superioren temporalen Sulcus und den orbitofrontalen Kortex umfasse (Greene et al., 2001; Moll et al., 2002a; 2002b; Sommer et al., 2010). Die bisherigen Studien arbeiteten jedoch fast alle mit alltagsfernen, strafrechtlich relevanten Dilemmata. Dagegen stellten wir an unsere Konflikte den Anspruch, die Lebenswirklichkeit unserer Probanden möglichst realistisch darzustellen. Somit bestand hinsichtlich der erwachsenen Probanden die Möglichkeit, die von uns detektierten Aktivierungen nochmals kritisch mit bisher bekannten Moralarealen zu vergleichen. Mit dem Nachweis der Aktivierung ventraler, dorsaler und orbitaler Anteile des präfrontalen Kortex, der temporo-parietalen Junktion, des mittleren und oberen Temporallappens und Präcuneus, des Gyrus parahippocampalis und des Gyrus fusiformis konnten diese Untersuchungsergebnisse erneut repliziert werden. Zudem wird sowohl die These zur Existenz eines Moralnetzwerks gestützt als auch gezeigt, dass diese Gehirnareale nicht nur in menschlichen Extremsituationen sondern auch bei Alltagsentscheidungen aktiv sind. Was die Jugendlichen betrifft, so erwarteten wir aufgrund der postulierten neuronalen Umbauprozesse sowie des damit einhergehenden pubertären Leistungsknicks ein „schlechteres“ Abschneiden auf der Verhaltensebene im Sinne einer größeren Anzahl unmoralischer Antworten im Vergleich zu den Erwachsenen. Bezüglich der fMRT-Daten gingen wir von einer Mehraktivierung der Jugendlichen (z.B. der Amygdalae oder des anterioren cingulären Kortexes) aus als Zeichen einer höheren emotionalen und kognitiven Arbeitsleistung des noch unerfahrenen, moralisch inkompetenteren adoleszenten Gehirns. Entgegen dieser aufgestellten Hypothesen zeigten sich weder auf Verhaltensebene, noch im Bezug auf die neuronalen Aktivierungen signifikante Unterschiede zwischen den Probandengruppen: Es wurden wie in der Erwachsenengruppe Regionen wie VMPFC, DMPFC, OFC, STS und TPJ aktiviert. Somit waren keine wesentlichen altersabhängigen Besonderheiten nachweisbar. Lediglich der rechte Gyrus parahippocampalis, der Gyrus occipitalis medius und der Gyrus fusiformis zeigten für die Bedingung M > N eine Mehraktivierung beim jugendlichen im Vergleich zum erwachsenen Probandenkollektiv. Als Ergebnis der vorliegenden Studie zeigt sich somit, dass das Moralnetzwerk bei Jugendlichen schon so ausgereift zu sein scheint, dass eine subjektiv plausible Entscheidungsfindung möglich ist. Diese Folgerung steht im Einklang mit den Verhaltensdaten. Der pubertäre Leistungsabfall scheint zumindest auf das moralische Entscheiden keinen Einfluss zu haben. Aus diesen Erkenntnissen ergibt sich die Frage, bis zu welchem Lebensalter die Kompetenz zum moralischen Reasoning noch nicht vorhanden ist. Zur Beantwortung dieser Frage ist deshalb die entsprechende Untersuchung eines jüngeren Probandenkollektivs (z.B. Kinder im Alter von 8-12 Jahren) sinnvoll. Die gefundenen neuronalen Aktivierungen verdeutlichen des Weiteren, dass moralisches Urteilen die Intaktheit vieler sozialer Teilbereiche erfordert. So spielen sowohl Emotionen als auch die Fähigkeit zur Empathie, zur Perspektivenübernahme und zum logischen Abwägen über Vor- und Nachteile eine große Rolle. Die Mehraktivierungen im Gyrus parahippocampalis, Gyrus occipitalis medius und im Gyrus fusiformis könnten darauf hindeuten, dass die Jugendlichen durch die Konfliktszenarien emotional stärker gefordert sind. Die Mehraktivierungen dieser Regionen, die insbesondere mit dem Empfinden negativer Gefühle in Zusammenhang gebracht werden (Koelsch & Fritz, 2007), könnte ein Resultat dieser „moralischen Zwickmühle“ darstellen. Es stellt sich auch die Frage, ob sich bei entsprechenden Untersuchungen Defizite in den erwähnten sozialen Teilbereichen durch ein abweichendes Aktivierungsmuster bildgebend detektieren lassen. Von Interesse wäre deshalb eine Vergleichsuntersuchung mit gleichaltrigen Probanden, welche ein deutlich auffälliges Moralverhalten zeigen. Neben den strukturellen Hirnveränderungen beeinflussen auch die individuelle Erziehung und das sozio-kulturelle Umfeld das moralische Handeln des Adoleszenten. Daraus ergeben sich weitergehende Forschungsansätze durch vergleichende Untersuchungen bei Probanden aus unterschiedlichen kulturellen und sozialen Gesellschaftsstrukturen. Als Schlussfolgerung aus der vorliegenden Arbeit ergibt sich somit die Sinnhaftigkeit weiterer Untersuchungen für ein umfassendes Verständnis der Entwicklung der menschlichen Moralität

Patterns in Multiples

Patterns in color, design, sound, and rhythm are fascinating and enjoyable to children. All of these can be incorporated in learning experiences that help children see mathematical relationships in multiples of numbers.</jats:p

Grid Arrays for Multiplication

Arrays are often used as excellent models for beginning multiplication examples, but sometimes are put aside when they become unwieldy for greater factors. L earners. therefore. may be deprived of the benefits of array models just when they need help with more challenging examples. The use of grid arrays, made from paper marked in squares, allows the learner to continue to benefit from array model and to follow a logical sequence of multiplication experiences.</jats:p