Crop supplemental irrigation experiences in Burkina Faso. [P-2222-13]

This study assesses the impact of supplemental irrigation from small man-made basins on cereal production in climate variability and change context marked by dry spells in the Sahelian zone of Burkina Faso. After two years, the experiments showed that this innovation in family farms increases maize yield and allows growing a second crop with the surplus of water available in the basin. At the end of the 2012-2013 campaign, the average maize yield was estimated 2.5t/ha on experimental plots (EP) and 1.7t/ha on control plots (CP). The average yield of the 2013-2014 campaign was evaluated as 3.3T/ha and 0.9t/ha for EP and CP respectively. Increase in yield is 0.8t/ha for the 2012- 2013 campaign and 2.4t/ha during 2013-2014. It appears as well as the yield obtained on EP in 2012-2013 and 2013-2014 for bridging cereal need of 2 and 6 additional persons respectively in agricultural households compared to the CP. The review of the Net present value, internal rate of return and the Net benefits increase ratio show that the profitability to practice supplemental irrigation depends on the types of basins. (Texte intégral

Dynamic of agricultural innovations diffusion in Burkina Faso. [P-4414-22]

This study highlights the factors determining the spread of agricultural innovations for water harvesting since the drastic effects of drought 70s in Burkina Faso. These innovations include zaï, stone bunds, bunds land, halfmoons, mulching and grass strips. A survey of 629 farmers revealed that farmers fall into five categories which are the pioneer, early, latecomer, late and non-adopters. After four decades of diffusion (1974-2013) the rate is estimated at 69.3% for stone bunds, 49.1% for zaï, 26.2% for grass strips and less than 10% for half-moons, bunds land and mulching. The multinomial logit model showed that the climatic conditions in the Sahel zone, age and perception of increased dry spells of farm households promoted the spread of these innovations. However, the low level of organization and access to agricultural services were the major constraints to their adoption. (Texte intégral

Effets oestrogéniques du macéré aqueux des feuilles de Holarrhena floribunda (G. Don) Dur & Schinz chez la rate ovariectomisée

Oestrogenic effects of macerated aqueous extracts of the leaves of Holarrhena fl oribunda (G. Don) Dur & Schinz on ovariectomized rat. Estrogenic effects of aqueous extracts of leaves of Holarrhena fl oribunda have been evaluated by uterotrophic assay. Ovariectomized mice were used and treated subcutaneously during seven days with 50, 100, 200 mg.kg-1 doses of Holarrhena fl oribunda and with 100, 200 mg.kg-1 doses of Holarrhena fl oribunda plus 25 mg.kg-1 of oestradiol 17-β. Estrogenic activity was analysed by uterine dry and wet weight, surrenal gland wet weight, vaginal opening, protein and cholesterol level in uteri horn. Administration of extracts to the doses of 100 and 200 mg.kg-1 exhibits increase of uterine dry and wet weight, surrenal gland wet weight, vaginal opening, protein levels and decrease of level of cholesterol in uterine horn. The results suggest that, aqueous extracts of Holarrhena fl oribunda possesses estrogenic type effect. But when 100 and 200 mg.kg-1 of Holarrhena fl oribunda were given alone with 25 mg.kg-1 of estradiol 17-β, the estrogenic effect was slight. These results supposed that H. fl oribunda is a weak phytoestrogen and the aqueous extracts of the leaves behad as partial agonisti

Effet d’une réduction simultanée des taux de fibres et de protéines brutes de la ration sur la santé et la croissance de l’aulacode

L’aulacode est un monogastrique herbivore récemment domestiqué en Afrique subsaharienne pour la production de viande. L’élevage de cet animal connait un engouement auprès de la population locale mais son développement est freiné par la cherté des aliments. Il est possible de réduire le coût de l'aliment en diminuant les concentrés protéiques, très chers pour les éleveurs, mais aussi en substituant en partie les aliments fibreux par une céréale, nettement moins onéreuse que les tourteaux, pour limiter l’effet dépresseur des fibres sur la digestion des nutriments. Ainsi, nous avons formulé 3 aliments expérimentaux, avec une gamme croissante d'apport d’amidon (via une céréale) en substitution d'apports protéiques et de fibres. Ces aliments ont été testés sur trois lots d’aulacodes, du sevrage jusqu’à 96 jours d’âge. L'analyse des performances zootechniques et sanitaires obtenus indique qu’un bon compromis entre santé digestive et croissance de l’aulacode après son sevrage nécessite un taux de fibres supérieur à 13% de lignocellulose dans l’aliment. Par ailleurs, descendre au dessous de 6 g de protéines digestibles par MJ d’énergie digestible, via une hausse importante des apports d’amidon et une baisse importante du taux de protéines brutes (en dessous de 11%) est préjudiciable à la croissance des animaux. Mots clés : Thryonomys swinderianus, alimentation, performances zootechniques, taux de fibres, taux de protéine

Caractérisation agromorphologique des accessions de riz adventices (Oryza sp) collectés dans les rizières de la zone interfluve du Tchad

Le riz est la céréale de base des populations des Régions administratives de la Tandjilé et du Mayo- Kebbi Est, dans le sud du Tchad. Le rendement du riz est cependant relativement très bas (moins de 1 t/ha). Ceci est lié à plusieurs facteurs parmi lesquels la forte infestation des rizières par les riz adventices et la faible utilisation des semences des variétés améliorées haut rendement. Parmi les mauvaises herbes, les plus fréquentes et nocives pour le riz cultivé, sont les espèces comme Oryza sativa L., Oryza barthii (A Chev) et Oryza longistaminata (A. Chev et Roehr). Celles-ci montrent une forte dynamique de l'infestation dans les rizières des plaines inondées des Régions administratives de la Tandjilé et du Mayo-Kebbi Est. La caractérisation agromorphologique de 24 échantillons riz adventices issus des opérations de prospectioncollecte d'octobre 2005 à Mars 2006 a été réalisée. A partir d’un dispositif de Ficher à trois répétitions, une expérimentation a permis de mettre en évidence, par une analyse de variance , une classification ascendante hiérarchique et l'analyse factorielle discriminante, l'existence de cinq groupes de riz adventices

Préservation de la diversité génétique dans le genre Gossypium au Burkina Faso: collecte et évaluations préliminaires de cotonniers locaux

Le but de l’étude a été de réunir et d’évaluer la diversité génétique des cotonniers traditionnels afin de les valoriser et de les conserver. Dans 243 villages, 336 accessions ont été collectées. Pendant la campagne hivernale 2010-2011, une évaluation préliminaire a été faite à partir de 25 caractères qualitatifs et quantitatifs. Les résultats ont révélé la présence d’un grand nombre d’écotypes différents appartenant aux espèces diploïdes (Gossypium arboreum et G. herbaceum) et tétraploïdes (G. hirsutum et G. barbadense) de cotonniers cultivés. Au plan qualitatif, les caractères «forme des feuilles», «forme des capsules» et «couleur du duvet» ont été les plus discriminants, subdivisant les accessions en 3 groupes. Les variables quantitatives, ont montré une opposition nette entre celles liées à l’architecture et celles liées à la production. L’ACP a mis en exergue 6 groupes de diversité. Les groupes G1, G2 et G3 étaient homogènes. Les autres groupes, cosmopolites, et la forte dispersion d’accessions dans le plan confirment l’importante diversité génétique intra- et inter-écotypes. Cette richesse génétique sera conservée, surtout son évaluation approfondie est en cours. Les cotonniers locaux jadis négligés pourraient s’avérer utiles dans un contexte de changements climatiques et de rétrécissement continu de la base génétique des variétés cultivées.Mots clés : Burkina Faso, cotonniers traditionnels, Gossypium spp., prospection-collecte, diversité morphologique

PlasmoView: a web-based resource to visualise global Plasmodium falciparum genomic variation.

Malaria is a global public health challenge, with drug resistance a major barrier to disease control and elimination. To meet the urgent need for better treatments and vaccines, a deeper knowledge of Plasmodium biology and malaria epidemiology is required. An improved understanding of the genomic variation of malaria parasites, especially the most virulent Plasmodium falciparum (Pf) species, has the potential to yield new insights in these areas. High-throughput sequencing and genotyping is generating large amounts of genomic data across multiple parasite populations. The resulting ability to identify informative variants, particularly single-nucleotide polymorphisms (SNPs), will lead to the discovery of intra- and inter-population differences and thus enable the development of genetic barcodes for diagnostic assays and clinical studies. Knowledge of genetic variability underlying drug resistance and other differential phenotypes will also facilitate the identification of novel mutations and contribute to surveillance and stratified medicine applications. The PlasmoView interactive web-browsing tool enables the research community to visualise genomic variation and annotation (eg, biological function) in a geographic setting. The first release contains over 600,000 high-quality SNPs in 631 Pf isolates from laboratory strains and four malaria-endemic regions (West Africa, East Africa, Southeast Asia and Oceania)

Anémie et parasitoses (intestinales et urinaires) chez les enfants d’âge scolaire au Burkina Faso: cas des écoles de Yamtenga, Daguilma et Koubri

La présente étude vise principalement à évaluer le statut de l’anémie associé à l’état parasitaire chez des enfants de trois écoles riveraines de retenues d’eaux au Burkina Faso: Daguilma, Koubri et Yamtenga. Il s’agit d’une étude transversale réalisée d’avril 2004 à octobre 2014. L’évaluation de l’anémie a été basée sur la mesure du taux d’hémoglobine à l’aide de l’appareil Hemocue. La caractérisation des parasitoses intestinales a été réalisée en utilisant la méthode de formol éther. La méthode de filtration de Plouvier a été utilisée pour identifier les oeufs de schistosomes. Au total, 363 écoliers dont 182 garçons et 181 filles ont participé à l’étude. La prévalence de l’anémie chez les écoliers à Yamtenga, Koubri et Daguilma est respectivement de 35,83%, 28,33% et 41,46%. Aucune différence significative n’a été notée entre filles et garçons au niveau de chaque site et sur l’ensemble des 3 sites (p= 1). La prévalence globale des parasites intestinaux chez les écoliers est de 75,83%. Pour la schistosomiase urinaire, 5,83% des écoliers sont infectés à Yamtenga, 4,33% à Koubri et 3,06% à Daguilma. La différence est significative entre les garçons (11,67%) et les filles (0,0%) à Yamtenga (p= 0,01). Par contre, à Koubri et à Daguilma, aucune différence significative n’a été observée entre les garçons et les filles (p= 0,619 et p= 1, respectivement).Tous les écoliers infectés par les Ankylostomes, Trichocéphales et Ascaris sont anémiés au niveau des trois sites de l’étude. Parmi les 16 écoliers infectés par la schistosomiase urinaire, 11 présentent une anémie. De l’ensemble des résultats de cette étude, il ressort que la prévalence de l’anémie chez les enfants est fortement influencée par les géohelminthes et la schistosomiase urinaire.Mots clés : Anémie, parasite intestinal, schistosome, élève, Burkina Faso

Evidence of heterosis in Okra (Abelmoschus esculentus) landraces from Burkina Faso

In our study, 24 hybrids obtained by diallel cross between ecotypes of okra were subjected to analysis of their combining ability effects and hybrid vigor for different important traits for producers and consumers. Parents and hybrids differed significantly for gca effect. UAE 3 and UAE 20 were found to be the best general combiners for 50% day of flowering and number of fruits per plant. While UAE 25, UAE 3 and UAE 5 were best for seeds weight per fruit and yield per plant; between tester lines, UAE 19 shown good gca effect of number of seeds per fruit and fruit yield per plant, when UAE 22 is good for number of seeds per fruit. The most heterotic combinations for number of fruits per plant were those including UAE 22 in their combination.The same hybrids have shown medium heterobeltiosis effect for fruit  length and in some of them (H22-20 and H22-5) was observed highest heterobeltiosis of yield per plant, varied from 59.90 to 77.57 respectively. The highest depression (non heterobeltiosis) was observed in hybrids with combination including H19 for number of seeds per fruit. Overall, the results discussed above indicated the fact that okra hybrid with UAE 22 hasgreat potentialities of maximizing fruit yield while hybrid H3-19 and H22-3 have the smallest days of flowering. Similarly, the heterosis effect  appeared in F1 in these hybrids with UAE22 as a mother form keeps up to the third generation. Key words: hybrid vigor, combining ability, okra, Burkina Faso

A barcode of organellar genome polymorphisms identifies the geographic origin of Plasmodium falciparum strains.

Malaria is a major public health problem that is actively being addressed in a global eradication campaign. Increased population mobility through international air travel has elevated the risk of re-introducing parasites to elimination areas and dispersing drug-resistant parasites to new regions. A simple genetic marker that quickly and accurately identifies the geographic origin of infections would be a valuable public health tool for locating the source of imported outbreaks. Here we analyse the mitochondrion and apicoplast genomes of 711 Plasmodium falciparum isolates from 14 countries, and find evidence that they are non-recombining and co-inherited. The high degree of linkage produces a panel of relatively few single-nucleotide polymorphisms (SNPs) that is geographically informative. We design a 23-SNP barcode that is highly predictive (~92%) and easily adapted to aid case management in the field and survey parasite migration worldwide